19th ISEB (090914-090918)

090914-090918にドイツのハンブルグで開催された、19th International Symposium on Environmental Biogeochemistryの発表で、気になったもののメモ。

<090914>

Feedbacks in the climate systems and interactions between human and climate drivers
Martin Claußen
→最初のKeynote。ドイツやザンビアの土壌や森林で、CO2のフラックスを観測。

Methane and carbon dioxide exchange fluxes of Siberian polygonal tundra: Eddy covariance measurements and modeling
Lars Kutzbach, Christian Wille, Torsten Sachs, Eva-Maria Pfeiffer
→ツンドラ土壌には160Gtもの炭素が眠っていて、地球温暖化でどうなるか。アラスカのデータはそこそこあるが、シベリアの研究例は少なかった。レナ川のデルタで、CO2とCH4のフラックス観測。アラスカほどは気候に影響されない？

Contribution of soil-plant-microorganism interactions on the fate of metallic and organic pollutants in soils
Corinne Leyval
→土壌の有機・金属汚染に対する、植物－根菌－バクテリアの役割について、実験。

Taxonomy vs. habitat as determinants for weathering activity in root associated bacteria
Anna Rosling, Jessica Schenck
→土壌風化へのバクテリアの役割を探るため、様々な土壌に木を植えて7ヶ月培養実験。バクテリアの群集組成が重要な因子？

Arbuscular mycorrhizal fungi as an efficient agent to control Amaranthus viridis invasion’s effect on native Acacia species
Arsene Alain Sanon, Thierry Beguiristain, Aurelie Cebron, Jacques Berthelin, Corinne Leval, Robin Duponnois
→外来植物が在来種に与える影響では、根菌が重要な役割を果たしているらしい。

Aluminium cycling in podzols, the role of ectomycorrhizal fungi
Mark M. Smits, Ellis Hoffland
→ポドゾル土壌中のアルミ循環における、キノコの役割について実験。

Geomycology: Fungal roles in metal and mineral transformations
Geoffrey Michael Gadd, Fordyce Davidson, Marina Fomina, Karen Stephenson, Victoria Gortowski, Ji Won Hong, Corynne McGuire, Jae Yeon Park, Zhan Wei
→ウランなど金属の循環に、真菌が果たす役割について。劣化ウランを、真菌が代謝して減毒化するらしい。

Trees may prime the loss of soil organic matter through carbon allocation to ectomycorrhizal fungi in a subarctic-alpine forest-heath ecotone
Karina Engelbrecht Clemmensen, Björn Lindahl, Anders Michelsen, Mikael Brandström, Roger Finlay
→北極圏で気候変動に対してtree lineが変化すると、土壌中の炭素蓄積量がどう変化するか？　「木が増えると、共生キノコが増加して、腐食物質中の炭素が減少する」という仮説のもと、様々な木の量の土壌で真菌のメタゲノム解析。仮説は概ね良いらしい。

Role of soil engineers in the transfers of C-N-S in a regenerating cutover peatland
Aurélien Gicquel, Françoise Binet, Marie-Paule Briand, Nathalie Josselin, André-Jean Francez
→炭素・窒素・硫黄の3元素でラベルされた植物とミミズを用いて、飼育実験をして、土壌－植物－ミミズ間での元素移動を調べた。

Visualization and quantification of the C-N-S transfers by soil engineers using NanoSIMS
Aurélien Gicquel, André-Jean Francez, Thomas Delhaye, Gérard Gruau, Vincent Hallaire, Françoise Binet
→上の研究の続きで、さらにNano-SIMSを用いて、微小スケールでの元素移動・分布を調べた。


<090915>

Bioenergy cultivation - A case study from the northern latitudes
Narasinha J. Shurpali, Pertti J. Martikainen
→フィンランドでバイオ燃料を作るための耕作が、土壌炭素に与える影響の評価。耕作によってCO2放出が増えることは少ないらしい。

Past and future greenhouse gas emissions and the climate of the 21st century
Mojib Latif
→生物地球化学者のための、気候変動モデル研究のイントロ。気候安定化のためには、「負の排出」が必要らしい。

Separation of sources of carbon metabolites (CO2 and CH4) produced in a rice paddy soil using carbon-13 labeling during free-air CO2 enrichment (FACE)
Takeshi Tokida, Minaco Adachi, Weiguo Cheng, Yasuhiro Nakajima, Tamon Fumoto, Hirofumi Nakamura, Masumi Okada, Ryoji Sameshima, Toshihiro Hasegawa
→水田におけるCO2増加実験で、炭素源としてCO2（13Cラベル）とCH4を評価。

Analysis of in situ Mn-oxidation in the Columbia River and offshore plume: Linking microbial community structure to active biogeochemical cycles
Craig R. Anderson, Rick E. Davis, Shakira Bandolin, Antonio M. Baptista, Bradley M. Tebo
→コロンビア川沖でのマンガン酸化への微生物の役割を探るため、マンガン酸化代謝を担うタンパク質などを分析。

Limestone weathering by neutrophilic sulfur-oxidizing bacteria in Lower Kane Cave, Wyoming, USA
Elspeth S. Steinhauer, Christopher R. Omelon, Philip C. Bennett
→カルスト洞窟における石灰岩風化への硫黄酸化バクテリアの役割について、フィールドおよび室内で実験。

Characterizing biogeochemical processes with magnetic resonance imaging
Vernon R Phoenix, Baheerathan Ramanan, William T. Sloan, William M. Holmes
→バイオフィルムの中身での重金属の挙動を調べる手法として、MRIを導入。

Competition for CO2 between oxygenic and anoxygenic phototrophs in a hypersaline microbial mat
Niko Finke, Bo Thamdrup, Tori M. Hoehler
→バクテリアマットにおける酸素発生型光合成と非酸素発生型光合成の住み分けや競争について、可視光だけや近赤外だけなどの条件で、光照射実験。

Metal adsorption by thermophiles: A comparative study
Christopher John Daughney, Adrian Hetzer, Hannah Heinrich, Peta-Gaye Burnett, Marjolein Weerts, Hugh Morgan, Phil Bremer, Jim McQuillan
→ニュージーランドの火山地帯・熱水噴出孔の好熱菌の金属吸着能について、種類ごとや環境ごとなどで比較研究。

Microbial sulphur cycling: New evidence of microbial cooperation in global elemental cycles
Kelsey L.I. Norlund, Adam P. Hitchcock, Lesley A. Warren
→acid mine drainageにおける微生物硫黄循環が石灰岩風化に与える影響について。


<090917>

Demonstrating a natural origin of chloroform in forest soils and groundwater using compound specific isotope analysis
Florian Breider, Christian Albers, Daniel Hunkeler, Troels Laier, Ole Stig Jacobsen
→土壌・地下水中クロロフォルムの炭素同位体組成分析によると、やたら高いクロロフォルム濃度も天然起源らしい。

Soil organic matter decomposition and microbial communities in different pore size classes
Léo Ruamps, Mélanie Cointre, Naoise Nunan, Claire Chenu
→13Cラベル果糖を土壌に与えて、粒子サイズごとにPLFAを分析。

Inhibition of methane oxidation in soil by toxic metals
Maria De Nobili, Elena Bellina, Marco Contin, Claudia Rizzardini
→重金属（Hg、Zn、Pb）が土壌でのメタン酸化活性に与える影響について、実験。

Intracellular accumulation of Pb by Shewanella putrefaciens CN32 during the reductive dissolution of plumbojarosite
Christina Marie Smeaton, Brian J. Fryer, Christopher G. Weisener
→Pb-jarositeの還元的溶解における、微生物細胞の一部にPb濃集（＞90%）が見られる。PbやPの量を変えて培養実験。

Geochemical interactions and viral-prokaryote relationships in freshwater and acid mine drainage environments
Jennifer E. Kyle, F. Grant Ferris
→acid mine drainageで地球化学条件がウイルスに与える影響について調査。

The role of magnetotactic bacteria in the biogeochemical iron cycle
Cristina Moisescu, Steeve Bonneville, Ioan Ardelean, Liane G. Benning
→細胞内に磁性粒子配列を作るmagnetotacticバクテリアの研究。Magnetosomeなる小器官を持つ。いたるところにいて鉄循環に重要らしい。Magnetosomeの膜脂質が気になる。


<090918>

Predicting the effects of climate change on aquatic ecosystems in an extreme environment
Jenny Webster-Brown, Ian Hawes, Clive Howard-Williams
→南極の融水でできた池（塩分濃縮などで化学的にも過酷な環境）の生態系の比較研究で、気候変動が与える影響を評価。

The fate of microbial biomass in soil: A new view on soil organic matter genesis
Anja Miltner, Reimo Kindler, Claudia Hoffmann-Jäniche, Petra Bombach, Burkhard Schmidt-Brücken, Matthias Kästner
→13CラベルしたE.coliを土壌に入れてincubateして、どう分解されていくかを調べた。微生物炭素は、microbial food-webでリサイクルされているらしい。バクテリア細胞壁が土壌有機物の重要な成分？

Stoichiometry and trophic interactions: a comparison between aquatic and terrestrial ecosystems
Andre-Jean Francez, Myriam Bormans, Françoise Binet, Yvan Lagadeuc
→水圏・陸域の生態系の化学量論についてのレビュー。

Marinobacter; biogeochemical consequences of the ubiquitous colonisation of marine redox gradients by an organism with unexpected respiratory flexibility
Jonathan Lloyd, Kim Handley, Sergio Balzano, Moritz Müller, Marina Héry, Mathew Upton, Scott Beatson, Rachel Mills, Peter Statham
→Marinobacterというグラム陰性バクテリアは、FeやAsの酸化還元に重要らしい。深海熱水系、海洋POC、陸域熱水系でのデータも。新しい代謝もありそう。

Vascular bog vegetation annihilates CH4 release on ecosystem scale in Patagonia
Christian Fritz, Alfons Smolders, Nardy Kip, Veronica Pancotto, Josephus Elzenga
→パタゴニアの湿原で、vascular plantの根がメタン放出に与える影響について。

How Astelia pumila bogs Sphagnum down? Insights from nutrient cycling in bogs of Tierra del Fuego
Christian Fritz→上の研究の続き。この地でcushion bogsがSphagnum bogsに勝る理由を、窒素など栄養面から調べた。