☆Nature☆
Probabilistic assessment of sea level during the last interglacial stageRobert E. Kopp, Frederik J. Simons, Jerry X. Mitrovica, Adam C. Maloof & Michael Oppenheimer
Nature 462, 863-867 (17 December 2009) doi:10.1038/nature08686→確率論的方法を使ったモデリングとデータとを組み合わせて、いちばん最近の間氷期の海水準は現在のそれよりもずっと高かったことが示された。このことは、温暖化に対して、これから氷床がどんな応答をするかについての手がかりを与えてくれる。
【最新論文（Nature, Science）】
A super-Earth transiting a nearby low-mass starDavid Charbonneau, Zachory K. Berta, Jonathan Irwin, Christopher J. Burke, Philip Nutzman, Lars A. Buchhave, Christophe Lovis, Xavier Bonfils, David W. Latham, Stéphane Udry, Ruth A. Murray-Clay, Matthew J. Holman, Emilio E. Falco, Joshua N. Winn, Didier Queloz, Francesco Pepe, Michel Mayor, Xavier Delfosse & Thierry Forveille
Nature 462, 891-894 (17 December 2009) doi:10.1038/nature08679→地球型惑星の探索は、地球の2.7倍の大きさの惑星の発見によって大きく進んだ。この惑星の質量とサイズは、水が豊富にある巨大地球型惑星について理論から予測される値にぴったり。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Formation and Survival of Water Vapor in the Terrestrial Planet-Forming RegionThomas Bethell and Edwin Bergin
Science 18 December 2009: Vol. 326. no. 5960, pp. 1675 - 1677, DOI: 10.1126/science.1176879→地球型惑星形成領域での水蒸気の生成と残存性。原始惑星系円盤内の奥深く（赤道面付近）では、水分子は紫外線による解離から自己遮蔽されて、水分子や有機分子が大量に残る。海洋の数千倍の水蒸気が、ハビタブルゾーン内に存在しうる。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Proceedings of the National Academy of Sciences☆
Subcellular localization of marine bacterial alkaline phosphatases
Haiwei Luo, Ronald Benner, Richard A. Long, and Jianjun Hu
PNAS 2009 106:21219-21223; doi:10.1073/pnas.0907586106→海洋メタゲノムデータベースから、有機リンの細胞外加水分解酵素と細胞質内加水分解酵素の遺伝子の量を調べた。細胞内に溶存有機リンを輸送して加水分解するがメインの代謝らしい。
【海洋生元素循環3】
Identifying the missing steps of the autotrophic 3-hydroxypropionate CO2 fixation cycle in Chloroflexus aurantiacusJan Zarzycki, Volker Brecht, Michael Müller, and Georg Fuchs
PNAS 2009 106:21317-21322; doi:10.1073/pnas.0908356106→二酸化炭素固定の3-hydroxypropionate（3HP）回路の、未知の代謝ステップがついに同定された。全体では、重炭酸イオン3つから、13の酵素による19の代謝ステップを経て、ピルビン酸を合成する。
【最新論文（生物系）】
Circumpolar synchrony in big river bacterioplanktonByron C. Crump, Bruce J. Peterson, Peter A. Raymond, Rainer M. W. Amon, Amanda Rinehart, James W. McClelland, and Robert M. Holmes
PNAS 2009 106:21208-21212; doi:10.1073/pnas.0906149106→北極圏の6つの大河川で、バクテリアの群集組成は気候変動を反映して同調して変動しているらしい。
【最新論文（生物系）】
☆Geophysical Research Letters☆
Cosmic ray decreases and changes in the liquid water cloud fraction over the oceansLaken, B., A. Wolfendale, and D. Kniveton
Geophys. Res. Lett. (2009) 36, L23803, doi:10.1029/2009GL040961.→Forbush Decreaseと低層雲中液体水量に関係が見られるとしたSvensmark et al. (2009, GRL)に対する反論。ふーむ？？
【太陽と気候2】
☆Organic Geochemistry☆
Performance evaluation of nitrogen isotope ratio determination in marine and lacustrine sediments: An inter-laboratory comparisonEnno Bahlmann, Stefano M. Bernasconi, Steven Bouillon, Marco Houtekamer, Michael Korntheuer, Frauke Langenberg, Christoph Mayr, Marc Metzke, Jack J. Middelburg, Birgit Nagel, Ulrich Struck, Maren Voß, Kay-Christian Emeis
Organic Geochemistry, Volume 41, Issue 1, January 2010, Pages 3-12, doi:10.1016/j.orggeochem.2009.05.008→海洋・湖堆積物のバルク窒素同位体組成分析のラボ間評価。窒素含有量が0.07%以上は、精度0.45‰（2σ）で測れているが、含有量がそれより低いと精度は落ちてしまうらしい。
【最新論文（地球科学系）】
Experimental studies on the stable carbon isotope biogeochemistry of acetate in lake sedimentsVerena B. Heuer, Martin Krüger, Marcus Elvert and Kai-Uwe Hinrichs
Organic Geochemistry, Volume 41, Issue 1, January 2010, Pages 22-30, doi:10.1016/j.orggeochem.2009.07.004→湖堆積物の酢酸炭素同位体組成を用いた、生物地球化学プロセスの推定。TOCの炭素同位体組成より高い・同じくらい・低いの3パターンで、代謝プロセスが違うらしい。それぞれ、発酵、酢酸分解メタン発酵、酢酸生成。
【地下生物圏2】
☆Applied and Environmental Microbiology☆
Contribution of Microbial Activity to Carbon Chemistry in CloudsVaitilingom, Mickael, Amato, Pierre, Sancelme, Martine, Laj, Paolo, Leriche, Maud, Delort, Anne-Marie
Appl. Environ. Microbiol. 2010 76: 23-29; doi:10.1128/AEM.01127-09→大気中に多く存在する蟻酸、酢酸、酪酸、コハク酸の分解への、雲中微生物の寄与を培養実験で調べた。夜は微生物による分解がほとんどで（90-99%）、昼は光分解より少なくなる（2-37%）らしい。というか雲の中に微生物がいることを初めて知った。。。
【最新論文（生物系）】
2009年12月25日金曜日
2009年12月23日水曜日
科学ニュース（091214-091220）
Shaping US geology
Nature News, 18 December 2009
→アメリカ地質調査所（USGS）の新所長Marcia McNuttのインタビュー。初の女性所長。
2010 U.S. Budget: Congress Takes Care of Science In Quiet Finish to a Busy Year
Science News of the Week, 18 December 2009
→2010年度支出法案が米国連邦議会を平穏に通過。国立衛生研究所（NIH）の予算2.3％増、国立科学財団（NSF）の予算6.7％増など、科学関連機関の期待に応える内容。
France: Sarkozy's 'Grand Loan' Bets That Research Will Pay Off
Science News of the Week, 18 December 2009
→研究は採算が取れると請合うサルコジ大統領の「グランドローン」。12月14日、サルコジ大統領が350億ユーロの投資計画を発表。科学分野の生産性向上、国民高等教育の推進、経済競争力の強化、環境の浄化を公約。
Marine Sciences: U.S. Poised to Adopt National Ocean Policy
Science News Focus, 18 December 2009
→米国が国家海洋政策の採用へ。水産養殖や風力発電基地としての利用増加を受けて、米国初の海洋政策をホワイトハウスが協議中。
Geology: Burdened by Soviet Legacy, Nations Spar Over Water Rights
Science News Focus, 18 December 2009
→旧ソ連の負の遺産に悩む国家間で、水利権をめぐる争い。パミール山脈麓の平野部の農村では、淡水の獲得競争が激化。サレズ湖を水源にできれば解決するが…。
Geology: Peril in the Pamirs
Science News Focus, 18 December 2009
→タジキスタンの山間に地震で生じた世界一高い天然ダム「サレズ湖」。決壊回避のため、水位を下げる各種の方法が検討されている。
Enceladus plume is half ice
Nature News, 18 December 2009
→エンセラダスのプルームは、50％が氷で構成されているらしい。従来の予想は10-20％とかだった。地下の湖から噴出すとそうなるかも？ American Geophysical Union (AGU) Fall Meetingで発表。
Chicken or Egg Question Looms Over Climate Debate
ScienceDaily (Dec. 18, 2009)
→雲の量と気温の因果関係（鶏卵問題）を切り離せないので、雲フィードバックの直接測定ができないのが、現在の気候モデルの問題点という話。American Geophysical Union (AGU) Fall Meetingで発表。
Extrasolar planets: Water world larger than Earth
Nature News & Views, 17 December 2009
→地球型惑星の探索は、地球の2.7倍の大きさの惑星の発見によって大きく進んだ。この惑星の質量とサイズは、水が豊富にある巨大地球型惑星について理論から予測される値にぴったり。Natureに論文。
Global change: Interglacial and future sea level
Nature News & Views, 17 December 2009
→確率論的方法を使ったモデリングとデータとを組み合わせて、いちばん最近の間氷期の海水準は現在のそれよりもずっと高かったことが示された。このことは、温暖化に対して、これから氷床がどんな応答をするかについての手がかりを与えてくれる。Natureに論文。
Bacteria Can Transform Minerals Electrically
ScienceNOW Daily News, 17 December 2009
→Shewanellaなるバクテリアが、鉱物中の鉄・マンガンを還元して鉱物を変質させる仕組みが明らかになった。deca-heme c-class cytochromesなる酵素を、鉱物に付着させるらしい。Proceedings of the National Academy of Sciences（PNAS）に論文。
Hope for Japan's key projects
Nature News, 15 December 2009
→日本の科学予算の復活折衝について。
First Super-Earths Discovered Orbiting Sun-Like Stars
ScienceDaily (Dec. 14, 2009)
→太陽に似た恒星で、スーパーアースサイズの系外惑星が周回しているのが、初めて発見された。Astrophysical Journalに論文。
Ancient DNA from Dirt, Not Fossilized Bones, Shows Late Survival of Woolly Mammoth and Other Ice Age Megafauna
ScienceDaily (Dec. 14, 2009)
→アラスカの永久凍土から、絶滅したマンモスや馬などの古代DNAが検出・復元された。Proceedings of the National Academy of Sciences（PNAS）に論文。
Exoplanet claim bites the dust
Nature News, 8 December 2009
→VB10に“発見”された系外惑星は、実際には存在しておらず、観測上のノイズ？
Nature News, 18 December 2009
→アメリカ地質調査所（USGS）の新所長Marcia McNuttのインタビュー。初の女性所長。
2010 U.S. Budget: Congress Takes Care of Science In Quiet Finish to a Busy Year
Science News of the Week, 18 December 2009
→2010年度支出法案が米国連邦議会を平穏に通過。国立衛生研究所（NIH）の予算2.3％増、国立科学財団（NSF）の予算6.7％増など、科学関連機関の期待に応える内容。
France: Sarkozy's 'Grand Loan' Bets That Research Will Pay Off
Science News of the Week, 18 December 2009
→研究は採算が取れると請合うサルコジ大統領の「グランドローン」。12月14日、サルコジ大統領が350億ユーロの投資計画を発表。科学分野の生産性向上、国民高等教育の推進、経済競争力の強化、環境の浄化を公約。
Marine Sciences: U.S. Poised to Adopt National Ocean Policy
Science News Focus, 18 December 2009
→米国が国家海洋政策の採用へ。水産養殖や風力発電基地としての利用増加を受けて、米国初の海洋政策をホワイトハウスが協議中。
Geology: Burdened by Soviet Legacy, Nations Spar Over Water Rights
Science News Focus, 18 December 2009
→旧ソ連の負の遺産に悩む国家間で、水利権をめぐる争い。パミール山脈麓の平野部の農村では、淡水の獲得競争が激化。サレズ湖を水源にできれば解決するが…。
Geology: Peril in the Pamirs
Science News Focus, 18 December 2009
→タジキスタンの山間に地震で生じた世界一高い天然ダム「サレズ湖」。決壊回避のため、水位を下げる各種の方法が検討されている。
Enceladus plume is half ice
Nature News, 18 December 2009
→エンセラダスのプルームは、50％が氷で構成されているらしい。従来の予想は10-20％とかだった。地下の湖から噴出すとそうなるかも？ American Geophysical Union (AGU) Fall Meetingで発表。
Chicken or Egg Question Looms Over Climate Debate
ScienceDaily (Dec. 18, 2009)
→雲の量と気温の因果関係（鶏卵問題）を切り離せないので、雲フィードバックの直接測定ができないのが、現在の気候モデルの問題点という話。American Geophysical Union (AGU) Fall Meetingで発表。
Extrasolar planets: Water world larger than Earth
Nature News & Views, 17 December 2009
→地球型惑星の探索は、地球の2.7倍の大きさの惑星の発見によって大きく進んだ。この惑星の質量とサイズは、水が豊富にある巨大地球型惑星について理論から予測される値にぴったり。Natureに論文。
Global change: Interglacial and future sea level
Nature News & Views, 17 December 2009
→確率論的方法を使ったモデリングとデータとを組み合わせて、いちばん最近の間氷期の海水準は現在のそれよりもずっと高かったことが示された。このことは、温暖化に対して、これから氷床がどんな応答をするかについての手がかりを与えてくれる。Natureに論文。
Bacteria Can Transform Minerals Electrically
ScienceNOW Daily News, 17 December 2009
→Shewanellaなるバクテリアが、鉱物中の鉄・マンガンを還元して鉱物を変質させる仕組みが明らかになった。deca-heme c-class cytochromesなる酵素を、鉱物に付着させるらしい。Proceedings of the National Academy of Sciences（PNAS）に論文。
Hope for Japan's key projects
Nature News, 15 December 2009
→日本の科学予算の復活折衝について。
First Super-Earths Discovered Orbiting Sun-Like Stars
ScienceDaily (Dec. 14, 2009)
→太陽に似た恒星で、スーパーアースサイズの系外惑星が周回しているのが、初めて発見された。Astrophysical Journalに論文。
Ancient DNA from Dirt, Not Fossilized Bones, Shows Late Survival of Woolly Mammoth and Other Ice Age Megafauna
ScienceDaily (Dec. 14, 2009)
→アラスカの永久凍土から、絶滅したマンモスや馬などの古代DNAが検出・復元された。Proceedings of the National Academy of Sciences（PNAS）に論文。
Exoplanet claim bites the dust
Nature News, 8 December 2009
→VB10に“発見”された系外惑星は、実際には存在しておらず、観測上のノイズ？
2009年12月17日木曜日
集めた論文の覚書 ［微生物分析法］ Literature Review [Analytical methods for microbial activities]
修士論文に関連して集めた、微生物分析法（特に同位体ラベル）の論文。
Single-Cell Ecophysiology of Microbes as Revealed by Raman Microspectroscopy or Secondary Ion Mass Spectrometry Imaging
Michael Wagner
Annual Review of Microbiology (2009) Vol. 63: 411-429, doi:10.1146/annurev.micro.091208.073233
→顕微ラマンとSIMSを用いた、微生物細胞ごとの安定同位体ラベル分析のレビュー。
A single-cell view on the ecophysiology of anaerobic phototrophic bacteria
Niculina Musat, Hannah Halm, Barbel Winterholler, Peter Hoppe, Sandro Peduzzi, Francois Hillion, Francois Horreard, Rudolf Amann, Bo B. Jorgensen and Marcel M. M. Kuypers
PNAS November 18, 2008 vol. 105 no. 46 17861-17866, doi: 10.1073/pnas.0809329105→HISH-SIMSによる種特異的1細胞レベルの炭素・窒素同位体ラベル取り込み評価法の開発と、嫌気光合成バクテリアへの応用。
Biogeochemical processes in the saline meromictic Lake Kaiike, Japan: implications from molecular isotopic evidences of photosynthetic pigments
Naohiko Ohkouchi, Yoji Nakajima, Hisatake Okada, Nanako O. Ogawa, Hisami Suga, Kazumasa Oguri and Hiroshi Kitazato
Environmental Microbiology (2005) Volume 7 Issue 7, Pages 1009 - 1016, doi:10.1111/j.1462-2920.2005.00772.x
→貝池の水中のバクテリオクロロフィルの化合物レベル炭素・窒素同位体組成などから、光合成細菌による生物地球化学循環を推定。
Stable-isotope probing of DNA: insights into the function of uncultivated microorganisms from isotopically labeled metagenomes
Michael W Friedrich
Current Opinion in Biotechnology (2006) Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 59-66, doi:10.1016/j.copbio.2005.12.003
→DNA-SIPのレビュー。
Unlocking the 'microbial black box' using RNA-based stable isotope probing technologiesAndrew S Whiteley, Mike Manefield and Tillmann Lueders
Current Opinion in Biotechnology (2006) Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 67-71, doi:10.1016/j.copbio.2005.11.002
→RNA-SIPのレビュー。
13C-Labelling of lipids to investigate microbial communities in the environment
Richard P Evershed, Zoe M Crossman, Ian D Bull, Hazel Mottram, Jennifer AJ Dungait, Peter J Maxfield and Emma L Brennand
Current Opinion in Biotechnology (2006) Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 72-82, doi:10.1016/j.copbio.2006.01.003
→脂質SIPのレビュー。
Linking microbial community structure with function: fluorescence in situ hybridization-microautoradiography and isotope arrays
Michael Wagner, Per H Nielsen, Alexander Loy, Jeppe L Nielsen and Holger Daims
Current Opinion in Biotechnology, Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 83-91, doi:10.1016/j.copbio.2005.12.006
→FISH-MARのレビュー。
DNA-based stable isotope probing: a link between community structure and function
Ondrej Uhlik, Katerina Jecna, Mary Beth Leigh, Martina Mackova and Tomas Macek
Science of The Total Environment (2009) Volume 407, Issue 12, 1 June 2009, Pages 3611-3619, doi:10.1016/j.scitotenv.2008.05.012
→DNA-SIPの2009年度版レビュー。
Comparison of methods for simultaneous identification of bacterial species and determination of metabolic activity by protein-based stable isotope probing (Protein-SIP) experiments
Nico Jehmlich, Frank Schmidt, Martin Taubert, Jana Seifert, Martin von Bergen, Hans-Hermann Richnow, Carsten Vogt
Rapid Communications in Mass Spectrometry (2009) Volume 23 Issue 12, Pages 1871 - 1878, DOI:10.1002/rcm.4084
→タンパク質－SIPの手法の比較。
Quantifying 3H-thymidine incorporation rates by a phylogenetically defined group of marine planktonic bacteria (Bacteriodetes phylum)
Benjamin A. S. Van Mooy, Allan H. Devol and Richard G. Keil
Environmental Microbiology (2004) Volume 6 Issue 10, Pages 1061 - 1069, doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00636.x
→SNAP-BACの開発。
Who eats what, where and when? Isotope-labelling experiments are coming of age
Josh D Neufeld, Michael Wagner and J Colin Murrell
The ISME Journal (2007) 1, 103?110; doi:10.1038/ismej.2007.30
→微生物細胞の同位体ラベルによる代謝活性測定法のレビュー。
Microbial community proteomics: elucidating the catalysts and metabolic mechanisms that drive the Earth's biogeochemical cycles
Paul Wilmes and Philip L Bond
Current Opinion in Microbiology, Volume 12, Issue 3, June 2009, Pages 310-317, doi:10.1016/j.mib.2009.03.004
→“メタ”微生物プロテオミクスのレビュー。
Anaerobic Oxidation of Methane: Progress with an Unknown Process
Katrin Knittel and Antje Boetius
Annual Review of Microbiology (2009) Vol. 63: 311-334, doi:10.1146/annurev.micro.61.080706.093130
→嫌気的メタン酸化の最新レビュー論文。
Single-Cell Ecophysiology of Microbes as Revealed by Raman Microspectroscopy or Secondary Ion Mass Spectrometry Imaging
Michael Wagner
Annual Review of Microbiology (2009) Vol. 63: 411-429, doi:10.1146/annurev.micro.091208.073233
→顕微ラマンとSIMSを用いた、微生物細胞ごとの安定同位体ラベル分析のレビュー。
A single-cell view on the ecophysiology of anaerobic phototrophic bacteria
Niculina Musat, Hannah Halm, Barbel Winterholler, Peter Hoppe, Sandro Peduzzi, Francois Hillion, Francois Horreard, Rudolf Amann, Bo B. Jorgensen and Marcel M. M. Kuypers
PNAS November 18, 2008 vol. 105 no. 46 17861-17866, doi: 10.1073/pnas.0809329105→HISH-SIMSによる種特異的1細胞レベルの炭素・窒素同位体ラベル取り込み評価法の開発と、嫌気光合成バクテリアへの応用。
Biogeochemical processes in the saline meromictic Lake Kaiike, Japan: implications from molecular isotopic evidences of photosynthetic pigments
Naohiko Ohkouchi, Yoji Nakajima, Hisatake Okada, Nanako O. Ogawa, Hisami Suga, Kazumasa Oguri and Hiroshi Kitazato
Environmental Microbiology (2005) Volume 7 Issue 7, Pages 1009 - 1016, doi:10.1111/j.1462-2920.2005.00772.x
→貝池の水中のバクテリオクロロフィルの化合物レベル炭素・窒素同位体組成などから、光合成細菌による生物地球化学循環を推定。
Stable-isotope probing of DNA: insights into the function of uncultivated microorganisms from isotopically labeled metagenomes
Michael W Friedrich
Current Opinion in Biotechnology (2006) Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 59-66, doi:10.1016/j.copbio.2005.12.003
→DNA-SIPのレビュー。
Unlocking the 'microbial black box' using RNA-based stable isotope probing technologiesAndrew S Whiteley, Mike Manefield and Tillmann Lueders
Current Opinion in Biotechnology (2006) Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 67-71, doi:10.1016/j.copbio.2005.11.002
→RNA-SIPのレビュー。
13C-Labelling of lipids to investigate microbial communities in the environment
Richard P Evershed, Zoe M Crossman, Ian D Bull, Hazel Mottram, Jennifer AJ Dungait, Peter J Maxfield and Emma L Brennand
Current Opinion in Biotechnology (2006) Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 72-82, doi:10.1016/j.copbio.2006.01.003
→脂質SIPのレビュー。
Linking microbial community structure with function: fluorescence in situ hybridization-microautoradiography and isotope arrays
Michael Wagner, Per H Nielsen, Alexander Loy, Jeppe L Nielsen and Holger Daims
Current Opinion in Biotechnology, Volume 17, Issue 1, February 2006, Pages 83-91, doi:10.1016/j.copbio.2005.12.006
→FISH-MARのレビュー。
DNA-based stable isotope probing: a link between community structure and function
Ondrej Uhlik, Katerina Jecna, Mary Beth Leigh, Martina Mackova and Tomas Macek
Science of The Total Environment (2009) Volume 407, Issue 12, 1 June 2009, Pages 3611-3619, doi:10.1016/j.scitotenv.2008.05.012
→DNA-SIPの2009年度版レビュー。
Comparison of methods for simultaneous identification of bacterial species and determination of metabolic activity by protein-based stable isotope probing (Protein-SIP) experiments
Nico Jehmlich, Frank Schmidt, Martin Taubert, Jana Seifert, Martin von Bergen, Hans-Hermann Richnow, Carsten Vogt
Rapid Communications in Mass Spectrometry (2009) Volume 23 Issue 12, Pages 1871 - 1878, DOI:10.1002/rcm.4084
→タンパク質－SIPの手法の比較。
Quantifying 3H-thymidine incorporation rates by a phylogenetically defined group of marine planktonic bacteria (Bacteriodetes phylum)
Benjamin A. S. Van Mooy, Allan H. Devol and Richard G. Keil
Environmental Microbiology (2004) Volume 6 Issue 10, Pages 1061 - 1069, doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00636.x
→SNAP-BACの開発。
Who eats what, where and when? Isotope-labelling experiments are coming of age
Josh D Neufeld, Michael Wagner and J Colin Murrell
The ISME Journal (2007) 1, 103?110; doi:10.1038/ismej.2007.30
→微生物細胞の同位体ラベルによる代謝活性測定法のレビュー。
Microbial community proteomics: elucidating the catalysts and metabolic mechanisms that drive the Earth's biogeochemical cycles
Paul Wilmes and Philip L Bond
Current Opinion in Microbiology, Volume 12, Issue 3, June 2009, Pages 310-317, doi:10.1016/j.mib.2009.03.004
→“メタ”微生物プロテオミクスのレビュー。
Anaerobic Oxidation of Methane: Progress with an Unknown Process
Katrin Knittel and Antje Boetius
Annual Review of Microbiology (2009) Vol. 63: 311-334, doi:10.1146/annurev.micro.61.080706.093130
→嫌気的メタン酸化の最新レビュー論文。
2009年12月16日水曜日
新しい論文（091207-091213）
☆Nature☆
Catastrophic flood of the Mediterranean after the Messinian salinity crisis
D. Garcia-Castellanos, F. Estrada, I. Jiménez-Munt, C. Gorini, M. Fernàndez, J. Vergés & R. De Vicente
Nature 462, 778-781 (10 December 2009) doi:10.1038/nature08555
→533万年前に大西洋に地中海に海水が大量に流入したイベント（Zanclean洪水）は、90%もの水が数ヶ月～2年間で流入するという破滅的な速度・規模だったらしい。最大で1日に10m以上の海水準上昇もあったらしい。
【最新論文（Nature, Science）】
Ecoenzymatic stoichiometry of microbial organic nutrient acquisition in soil and sediment
Robert L. Sinsabaugh, Brian H. Hill & Jennifer J. Follstad Shah
Nature 462, 795-798 (10 December 2009) doi:10.1038/nature08632
→陸域土壌や淡水堆積物で、従属栄養微生物の有機物分解酵素の活性を調べると、炭素：窒素：リンの分解活性が数桁にわたって1:1:1で一定だった。微生物の元素組成、有機物供給、栄養同化・成長の効率が平衡しているためらしい。極めて重要そうだが、イマイチよく分からないな。。。
【陸域生元素循環1】
☆Science☆
Meteorite Kr in Earth's Mantle Suggests a Late Accretionary Source for the Atmosphere
Greg Holland, Martin Cassidy, and Chris J. Ballentine
Science 11 December 2009: Vol. 326. no. 5959, pp. 1522 - 1525, DOI: 10.1126/science.1179518
→地球のマントル中に含まれる隕石起源の希ガス（クリプトン）は、後期の隕石由来でであることを示唆する。つまり地球形成時に生成したガス成分は、地球大気の進化にほとんど寄与していない。
【最新論文（Nature, Science）】
Evolution of Organic Aerosols in the Atmosphere
J. L. Jimenez, M. R. Canagaratna, N. M. Donahue, A. S. H. Prevot, Q. Zhang, J. H. Kroll, P. F. DeCarlo, J. D. Allan, H. Coe, N. L. Ng, A. C. Aiken, K. S. Docherty, I. M. Ulbrich, A. P. Grieshop, A. L. Robinson, J. Duplissy, J. D. Smith, K. R. Wilson, V. A. Lanz, C. Hueglin, Y. L. Sun, J. Tian, A. Laaksonen, T. Raatikainen, J. Rautiainen, P. Vaattovaara, M. Ehn, M. Kulmala, J. M. Tomlinson, D. R. Collins, M. J. Cubison, E., J. Dunlea, J. A. Huffman, T. B. Onasch, M. R. Alfarra, P. I. Williams, K. Bower, Y. Kondo, J. Schneider, F. Drewnick, S. Borrmann, S. Weimer, K. Demerjian, D. Salcedo, L. Cottrell, R. Griffin, A. Takami, T. Miyoshi, S. Hatakeyama, A. Shimono, J. Y Sun, Y. M. Zhang, K. Dzepina, J. R. Kimmel, D. Sueper, J. T. Jayne, S. C. Herndon, A. M. Trimborn, L. R. Williams, E. C. Wood, A. M. Middlebrook, C. E. Kolb, U. Baltensperger, and D. R. Worsnop
Science 11 December 2009: Vol. 326. no. 5959, pp. 1525 - 1529, DOI: 10.1126/science.1180353
→有機エアロゾルは、数時間～数日で劇的に変化し、含酸素有機エアロゾルに変質する。有機エアロゾルとその前駆体ガスの組成、揮発性、酸化度の測定をもとに、気候影響をより高精度で予測するためのモデルが提案された。
【最新論文（Nature, Science）】
A Complete Skeleton of a Late Triassic Saurischian and the Early Evolution of Dinosaurs
Sterling J. Nesbitt, Nathan D. Smith, Randall B. Irmis, Alan H. Turner, Alex Downs, and Mark A. Norell
Science 11 December 2009: Vol. 326. no. 5959, pp. 1530 – 1533, DOI: 10.1126/science.1180350
→非常に保存の良い後期三畳紀の獣脚類化石が米ニューメキシコ州で発見され（この数個体の化石には相似的な形質と派生的な形質がモザイク状に混在していた）、獣脚類が属する初期の竜盤類の進化の過程が明らかにされた。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Proceedings of the National Academy of Sciences☆
Tipping Elements in Earth Systems特集。
Tipping Elements in Earth Systems Special Feature: Tipping elements in the Earth System
Hans Joachim Schellnhuber
PNAS 2009 106:20561-20563; doi:10.1073/pnas.0911106106
→巻頭言。
Sensitivities of marine carbon fluxes to ocean change
Ulf Riebesell, Arne Körtzinger, and Andreas Oschlies
PNAS 2009 106:20602-20609; doi:10.1073/pnas.0813291106
→海洋の炭酸系や物理・生物ポンプが、地球温暖化・海洋酸性化にどう応答するかを評価。
Dust as a tipping element: The Bodélé Depression, Chad
Richard Washington, Christel Bouet, Guy Cautenet, Elisabeth Mackenzie, Ian Ashpole, Sebastian Engelstaedter, Gil Lizcano, Gideon M. Henderson, Kerstin Schepanski, and Ina Tegen
PNAS 2009 106:20564-20571; doi:10.1073/pnas.0711850106
→ダスト生成（今回は特にチャド）が、気候変動に伴い、増加する見込み。
Basic mechanism for abrupt monsoon transitions
Anders Levermann, Jacob Schewe, Vladimir Petoukhov, and Hermann Held
PNAS 2009 106:20572-20577; doi:10.1073/pnas.0901414106
→モンスーンシステムの急激な遷移のメカニズムについて。放射入力の閾値で挙動が変わるらしい。
El Niño/Southern Oscillation response to global warming
M. Latif and N. S. Keenlyside
PNAS 2009 106:20578-20583; doi:10.1073/pnas.0710860105
→地球温暖化に対するENSOの応答について。
On the stability of the Atlantic meridional overturning circulation
Matthias Hofmann and Stefan Rahmstorf
PNAS 2009 106:20584-20589; doi:10.1073/pnas.0909146106
→大西洋の南北逆転循環（AMOC）の安定性について。モデルの誤差によって閾値が消えるので、現在のモデルは、安定性を過大評価しているらしい。
The future of ice sheets and sea ice: Between reversible retreat and unstoppable loss
Dirk Notz
PNAS 2009 106:20590-20595; doi:10.1073/pnas.0902356106
→グリーンランドや南極とは違い、北極海海氷の夏季における融解には閾値がない？
Ocean methane hydrates as a slow tipping point in the global carbon cycle
David Archer, Bruce Buffett, and Victor Brovkin
PNAS 2009 106:20596-20601; doi:10.1073/pnas.0800885105
→地球温暖化によるメタンハイドレート崩壊の閾値とその影響を、モデル評価。
Exploring the likelihood and mechanism of a climate-change-induced dieback of the Amazon rainforest
Yadvinder Malhi, Luiz E. O. C. Aragão, David Galbraith, Chris Huntingford, Rosie Fisher, Przemyslaw Zelazowski, Stephen Sitch, Carol McSweeney, and Patrick Meir
PNAS 2009 106:20610-20615; doi:10.1073/pnas.0804619106
→気候変動による、アマゾン熱帯雨林の後退について。
Reducing abrupt climate change risk using the Montreal Protocol and other regulatory actions to complement cuts in CO2 emissions
Mario Molina, Durwood Zaelke, K. Madhava Sarma, Stephen O. Andersen, Veerabhadran Ramanathan, and Donald Kaniaru
PNAS 2009 106:20616-20621; doi:10.1073/pnas.0902568106
→モントリオール・プロトコルなどによるHFCsの削減などで、CO2排出削減の補助を行い、とりあえず今後数十年の急激な気候変動を避けようという話。
☆Analytical Chemistry☆
Direct Compound-Specific Stable Chlorine Isotope Analysis of Organic Compounds with Quadrupole GC/MS Using Standard Isotope Bracketing
Christoph Aeppli, Henry Holmstrand, Per Andersson and Orjan Gustafsson
Anal. Chem., Publication Date (Web): December 11, 2009, DOI: 10.1021/ac902445f
→四重極GC/MSを使って、有機分子の化合物レベル安定塩素同位体組成を簡単に測定する方法。繰り返し測定で精度を上げているようだ。TIMS測定の結果ともよく合うらしい。
【最新論文（化学系）】
Catastrophic flood of the Mediterranean after the Messinian salinity crisis
D. Garcia-Castellanos, F. Estrada, I. Jiménez-Munt, C. Gorini, M. Fernàndez, J. Vergés & R. De Vicente
Nature 462, 778-781 (10 December 2009) doi:10.1038/nature08555
→533万年前に大西洋に地中海に海水が大量に流入したイベント（Zanclean洪水）は、90%もの水が数ヶ月～2年間で流入するという破滅的な速度・規模だったらしい。最大で1日に10m以上の海水準上昇もあったらしい。
【最新論文（Nature, Science）】
Ecoenzymatic stoichiometry of microbial organic nutrient acquisition in soil and sediment
Robert L. Sinsabaugh, Brian H. Hill & Jennifer J. Follstad Shah
Nature 462, 795-798 (10 December 2009) doi:10.1038/nature08632
→陸域土壌や淡水堆積物で、従属栄養微生物の有機物分解酵素の活性を調べると、炭素：窒素：リンの分解活性が数桁にわたって1:1:1で一定だった。微生物の元素組成、有機物供給、栄養同化・成長の効率が平衡しているためらしい。極めて重要そうだが、イマイチよく分からないな。。。
【陸域生元素循環1】
☆Science☆
Meteorite Kr in Earth's Mantle Suggests a Late Accretionary Source for the Atmosphere
Greg Holland, Martin Cassidy, and Chris J. Ballentine
Science 11 December 2009: Vol. 326. no. 5959, pp. 1522 - 1525, DOI: 10.1126/science.1179518
→地球のマントル中に含まれる隕石起源の希ガス（クリプトン）は、後期の隕石由来でであることを示唆する。つまり地球形成時に生成したガス成分は、地球大気の進化にほとんど寄与していない。
【最新論文（Nature, Science）】
Evolution of Organic Aerosols in the Atmosphere
J. L. Jimenez, M. R. Canagaratna, N. M. Donahue, A. S. H. Prevot, Q. Zhang, J. H. Kroll, P. F. DeCarlo, J. D. Allan, H. Coe, N. L. Ng, A. C. Aiken, K. S. Docherty, I. M. Ulbrich, A. P. Grieshop, A. L. Robinson, J. Duplissy, J. D. Smith, K. R. Wilson, V. A. Lanz, C. Hueglin, Y. L. Sun, J. Tian, A. Laaksonen, T. Raatikainen, J. Rautiainen, P. Vaattovaara, M. Ehn, M. Kulmala, J. M. Tomlinson, D. R. Collins, M. J. Cubison, E., J. Dunlea, J. A. Huffman, T. B. Onasch, M. R. Alfarra, P. I. Williams, K. Bower, Y. Kondo, J. Schneider, F. Drewnick, S. Borrmann, S. Weimer, K. Demerjian, D. Salcedo, L. Cottrell, R. Griffin, A. Takami, T. Miyoshi, S. Hatakeyama, A. Shimono, J. Y Sun, Y. M. Zhang, K. Dzepina, J. R. Kimmel, D. Sueper, J. T. Jayne, S. C. Herndon, A. M. Trimborn, L. R. Williams, E. C. Wood, A. M. Middlebrook, C. E. Kolb, U. Baltensperger, and D. R. Worsnop
Science 11 December 2009: Vol. 326. no. 5959, pp. 1525 - 1529, DOI: 10.1126/science.1180353
→有機エアロゾルは、数時間～数日で劇的に変化し、含酸素有機エアロゾルに変質する。有機エアロゾルとその前駆体ガスの組成、揮発性、酸化度の測定をもとに、気候影響をより高精度で予測するためのモデルが提案された。
【最新論文（Nature, Science）】
A Complete Skeleton of a Late Triassic Saurischian and the Early Evolution of Dinosaurs
Sterling J. Nesbitt, Nathan D. Smith, Randall B. Irmis, Alan H. Turner, Alex Downs, and Mark A. Norell
Science 11 December 2009: Vol. 326. no. 5959, pp. 1530 – 1533, DOI: 10.1126/science.1180350
→非常に保存の良い後期三畳紀の獣脚類化石が米ニューメキシコ州で発見され（この数個体の化石には相似的な形質と派生的な形質がモザイク状に混在していた）、獣脚類が属する初期の竜盤類の進化の過程が明らかにされた。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Proceedings of the National Academy of Sciences☆
Tipping Elements in Earth Systems特集。
Tipping Elements in Earth Systems Special Feature: Tipping elements in the Earth System
Hans Joachim Schellnhuber
PNAS 2009 106:20561-20563; doi:10.1073/pnas.0911106106
→巻頭言。
Sensitivities of marine carbon fluxes to ocean change
Ulf Riebesell, Arne Körtzinger, and Andreas Oschlies
PNAS 2009 106:20602-20609; doi:10.1073/pnas.0813291106
→海洋の炭酸系や物理・生物ポンプが、地球温暖化・海洋酸性化にどう応答するかを評価。
Dust as a tipping element: The Bodélé Depression, Chad
Richard Washington, Christel Bouet, Guy Cautenet, Elisabeth Mackenzie, Ian Ashpole, Sebastian Engelstaedter, Gil Lizcano, Gideon M. Henderson, Kerstin Schepanski, and Ina Tegen
PNAS 2009 106:20564-20571; doi:10.1073/pnas.0711850106
→ダスト生成（今回は特にチャド）が、気候変動に伴い、増加する見込み。
Basic mechanism for abrupt monsoon transitions
Anders Levermann, Jacob Schewe, Vladimir Petoukhov, and Hermann Held
PNAS 2009 106:20572-20577; doi:10.1073/pnas.0901414106
→モンスーンシステムの急激な遷移のメカニズムについて。放射入力の閾値で挙動が変わるらしい。
El Niño/Southern Oscillation response to global warming
M. Latif and N. S. Keenlyside
PNAS 2009 106:20578-20583; doi:10.1073/pnas.0710860105
→地球温暖化に対するENSOの応答について。
On the stability of the Atlantic meridional overturning circulation
Matthias Hofmann and Stefan Rahmstorf
PNAS 2009 106:20584-20589; doi:10.1073/pnas.0909146106
→大西洋の南北逆転循環（AMOC）の安定性について。モデルの誤差によって閾値が消えるので、現在のモデルは、安定性を過大評価しているらしい。
The future of ice sheets and sea ice: Between reversible retreat and unstoppable loss
Dirk Notz
PNAS 2009 106:20590-20595; doi:10.1073/pnas.0902356106
→グリーンランドや南極とは違い、北極海海氷の夏季における融解には閾値がない？
Ocean methane hydrates as a slow tipping point in the global carbon cycle
David Archer, Bruce Buffett, and Victor Brovkin
PNAS 2009 106:20596-20601; doi:10.1073/pnas.0800885105
→地球温暖化によるメタンハイドレート崩壊の閾値とその影響を、モデル評価。
Exploring the likelihood and mechanism of a climate-change-induced dieback of the Amazon rainforest
Yadvinder Malhi, Luiz E. O. C. Aragão, David Galbraith, Chris Huntingford, Rosie Fisher, Przemyslaw Zelazowski, Stephen Sitch, Carol McSweeney, and Patrick Meir
PNAS 2009 106:20610-20615; doi:10.1073/pnas.0804619106
→気候変動による、アマゾン熱帯雨林の後退について。
Reducing abrupt climate change risk using the Montreal Protocol and other regulatory actions to complement cuts in CO2 emissions
Mario Molina, Durwood Zaelke, K. Madhava Sarma, Stephen O. Andersen, Veerabhadran Ramanathan, and Donald Kaniaru
PNAS 2009 106:20616-20621; doi:10.1073/pnas.0902568106
→モントリオール・プロトコルなどによるHFCsの削減などで、CO2排出削減の補助を行い、とりあえず今後数十年の急激な気候変動を避けようという話。
☆Analytical Chemistry☆
Direct Compound-Specific Stable Chlorine Isotope Analysis of Organic Compounds with Quadrupole GC/MS Using Standard Isotope Bracketing
Christoph Aeppli, Henry Holmstrand, Per Andersson and Orjan Gustafsson
Anal. Chem., Publication Date (Web): December 11, 2009, DOI: 10.1021/ac902445f
→四重極GC/MSを使って、有機分子の化合物レベル安定塩素同位体組成を簡単に測定する方法。繰り返し測定で精度を上げているようだ。TIMS測定の結果ともよく合うらしい。
【最新論文（化学系）】
2009年12月15日火曜日
科学ニュース（091207-091213）
Earth's Atmosphere Came from Outer Space, Scientists Find
ScienceDaily (Dec. 11, 2009)
→地球の揮発ガス成分をもたらしたのは、火山活動ではなく、後期重爆撃期に降り注いだ隕石だったらしい。火山ガスの希ガス（クリプトン）同位体組成から分かった。Scienceに論文。
Introns Nonsense DNA May Be More Important to Evolution of Genomes Than Thought
ScienceDaily (Dec. 10, 2009)
→不要なDNAと思われていたイントロンが、実はゲノム進化に重要らしい。ミジンコのゲノム解析から分かった。Scienceに論文。
Studying Hair of Ancient Peruvians Answers Questions About Stress
ScienceDaily (Dec. 9, 2009)
→6-16世紀のペルー人の遺髪を化学分析したところ、cortisolなるストレスホルモンが見つかり、ストレスにさらされていたことが分かった。そんなん残るんだなぁ…。Journal of Archaeological Scienceに論文。
Tipping Elements in the Earth System: How Stable Is the Contemporary Environment?
ScienceDaily (Dec. 8, 2009)
→地球システムのうち、人間活動によって閾値を越えて急変しようとしている構成要素（tipping elements）についての特集が、Proceedings of the National Academy of Scienceで組まれた。
Life on Mars Theory Boosted by New Methane Study
ScienceDaily (Dec. 8, 2009)
→火星大気のメタンの供給源は大きな謎だが、実験と計算によると、火星に降り注ぐ隕石由来ではなさそうらしい。火山噴火由来は既に否定されているので、火星土壌に住む微生物由来か、火山活動と水の相互作用による無機的生成のどちらかに可能性が絞られたらしい。Earth and Planetary Science Lettersに論文。
Absence of Evidence for a Meteorite Impact Event 13,000 Years Ago
ScienceDaily (Dec. 7, 2009)
→1万3千年前に急激な寒冷化が起きたYounger Dryasでは、隕石衝突は結局無かったらしい。Proceedings of the National Academy of Scienceに論文。
Earth More Sensitive to Carbon Dioxide Than Previously Thought
ScienceDaily (Dec. 7, 2009)
→大気中二酸化炭素に対する地球の気候感度は、長期では従来の推定より30-50%高いらしい。Plioceneの数値モデル計算とプロキシデータから推定した。Nature Geoscience電子版に論文。
How Dinoflagellates Protect Themselves During Photosynthesis
ScienceDaily (Nov. 30, 2009)
→渦鞭毛藻はperidininなるカロテノイド色素を使って、光合成の際の酸化ダメージを防いでいるらしい。クロロフィル、peridinin、他のカロテノイドの酵素内での配置構造が明らかになった。Proceedings of the National Academy of Scienceに論文。
ScienceDaily (Dec. 11, 2009)
→地球の揮発ガス成分をもたらしたのは、火山活動ではなく、後期重爆撃期に降り注いだ隕石だったらしい。火山ガスの希ガス（クリプトン）同位体組成から分かった。Scienceに論文。
Introns Nonsense DNA May Be More Important to Evolution of Genomes Than Thought
ScienceDaily (Dec. 10, 2009)
→不要なDNAと思われていたイントロンが、実はゲノム進化に重要らしい。ミジンコのゲノム解析から分かった。Scienceに論文。
Studying Hair of Ancient Peruvians Answers Questions About Stress
ScienceDaily (Dec. 9, 2009)
→6-16世紀のペルー人の遺髪を化学分析したところ、cortisolなるストレスホルモンが見つかり、ストレスにさらされていたことが分かった。そんなん残るんだなぁ…。Journal of Archaeological Scienceに論文。
Tipping Elements in the Earth System: How Stable Is the Contemporary Environment?
ScienceDaily (Dec. 8, 2009)
→地球システムのうち、人間活動によって閾値を越えて急変しようとしている構成要素（tipping elements）についての特集が、Proceedings of the National Academy of Scienceで組まれた。
Life on Mars Theory Boosted by New Methane Study
ScienceDaily (Dec. 8, 2009)
→火星大気のメタンの供給源は大きな謎だが、実験と計算によると、火星に降り注ぐ隕石由来ではなさそうらしい。火山噴火由来は既に否定されているので、火星土壌に住む微生物由来か、火山活動と水の相互作用による無機的生成のどちらかに可能性が絞られたらしい。Earth and Planetary Science Lettersに論文。
Absence of Evidence for a Meteorite Impact Event 13,000 Years Ago
ScienceDaily (Dec. 7, 2009)
→1万3千年前に急激な寒冷化が起きたYounger Dryasでは、隕石衝突は結局無かったらしい。Proceedings of the National Academy of Scienceに論文。
Earth More Sensitive to Carbon Dioxide Than Previously Thought
ScienceDaily (Dec. 7, 2009)
→大気中二酸化炭素に対する地球の気候感度は、長期では従来の推定より30-50%高いらしい。Plioceneの数値モデル計算とプロキシデータから推定した。Nature Geoscience電子版に論文。
How Dinoflagellates Protect Themselves During Photosynthesis
ScienceDaily (Nov. 30, 2009)
→渦鞭毛藻はperidininなるカロテノイド色素を使って、光合成の際の酸化ダメージを防いでいるらしい。クロロフィル、peridinin、他のカロテノイドの酵素内での配置構造が明らかになった。Proceedings of the National Academy of Scienceに論文。
2009年12月11日金曜日
【申込〆切延長】第8回ニューイヤースクール
第8回「地球システム・地球進化ニューイヤースクール」の
参加申込締切が12/15まで延長されました。
代々木の国立オリンピック記念青少年総合センターで、
2010年1月9-10日に開催されます。
皆様、ぜひぜひご参加ください。
詳細はこちら。参加登録はこちら。
Websiteにアクセスできない時は、
earth21-nys8th AT m.aist.go.jp
（お手数ですが AT を@に替えてください）
にメールで連絡していただければ、申込みできます。
その際は、下記項目の情報を合わせてお知らせください。
=====申し込みフォーム（*は必須）=====
・名前*（例：田所雄介） ：
・ふりがな（例：たどころゆうすけ）：
・所属（例：東都大学地震研究所）：
・学年・職名（学生はB4,M2,D3など半角英数字で記入） ：
・連絡先のE-mail*（タイプミスにご注意下さい） ：
・出身地*（グループワークの班分けに利用します） ：
1北海道 2東北 3関東(東京以外） 4東京 5中部 6近畿 7中国 8四国 9九州 0その他
・グループワークへ参加できない方：
1. 9日不参加 2. 10日不参加 3. 9日10日ともに不参加
・earth21-mlへの登録：
1登録済み 2希望する 3希望しない
・宿泊希望（12月15日まで）(性別や要望などをお書きください）：宿泊を希望する 宿泊を希望しない
・アルバイト希望（12月15日まで）：希望する 希望しない
・専門分野・研究してみたい分野（例：地震学） ：
・NYS-VIIIに対するご意見：期待することや，取り上げて欲しいトピックなど ：
・みんなで作る地球科学本棚
（NYS8では、参加型企画として、みなさんのオススメ地球科学本を集めています。 当日、ポスターで結果を発表するとともに、ウェブ本棚を作成予定です。ご協力お願いします。）
本のタイトル：
オススメの理由：
=====（フォームここまで）=====
＜プログラム＞（敬称略、タイトルは変更の可能性あり）
2010年1月9日（土）
10:00～ 受付開始
10:30～ 講演開始
【通常講義】
・惑星の水
杉田 精司 教授（東京大学大学院・新領域創成科学研究科・複雑理工学専攻）
「火星探査が明かす火星表層環境の初期進化」
・固体地球深部の水
鍵 裕之 准教授（東京大学大学院・理学系研究科・地殻化学実験施設）
「光と中性子で探る、地球深部物質中の水の正体」
・熱水と生命
浦辺 徹郎 教授（東京大学 大学院理学系研究科）
「（仮）化学地質学・鉱床学・海底熱水活動・微生物圏地圏相互作用」
【Ex レクチャー】
・須藤 斎 助教（名古屋大学大学院・環境学研究科）
「子供向けの本を書く ～わかりやすく研究を伝える～」
・大木聖子 助教（東京大学・地震研究所・アウトリーチ推進室）
「地球科学研究者のLiberal Arts」
15:50～ グループワークによる議論
18:00～20:00 懇親会
1月10日（日）
09:00～ 講演開始
【通常レクチャー】
・水と災害
後藤 和久 助教（東北大学大学院・工学研究科・附属災害制御研究センター）
「沿岸巨礫群‐堆積学のラストフロンティアから挑む沿岸波浪災害‐」
・現代の海洋・大気循環
小橋 史明 准教授（東京海洋大学 海洋工学部）
「北太平洋の表層循環と大気海洋相互作用」
・過去の氷床・気候変動
川村 賢二 助教（国立極地研究所・研究教育系気水圏研究グループ）
「3kmのタイムカプセル：極域の氷床コアから気候変動のメカニズムを探る」
【Ex レクチャー】
・萩谷 宏 准教授（東京都市大学 知識工学部 自然科学科 ）
「自然科学科の立ち上げ －いまこそ博物学の時代をつくろう」
・千葉達朗 氏（アジア航測株式会社プロジェクト推進室技師長 理事・フェロー）
「赤色立体地図とは～一枚で立体的に見える地形表現法の発想～」
・泊 次郎 博士（東京大学・地震研究所・研究生）
「科学記者から地球科学史研究へ」
15:10～ グループワークによる議論
17:10 閉会挨拶
参加申込締切が12/15まで延長されました。
代々木の国立オリンピック記念青少年総合センターで、
2010年1月9-10日に開催されます。
皆様、ぜひぜひご参加ください。
詳細はこちら。参加登録はこちら。
Websiteにアクセスできない時は、
earth21-nys8th AT m.aist.go.jp
（お手数ですが AT を@に替えてください）
にメールで連絡していただければ、申込みできます。
その際は、下記項目の情報を合わせてお知らせください。
=====申し込みフォーム（*は必須）=====
・名前*（例：田所雄介） ：
・ふりがな（例：たどころゆうすけ）：
・所属（例：東都大学地震研究所）：
・学年・職名（学生はB4,M2,D3など半角英数字で記入） ：
・連絡先のE-mail*（タイプミスにご注意下さい） ：
・出身地*（グループワークの班分けに利用します） ：
1北海道 2東北 3関東(東京以外） 4東京 5中部 6近畿 7中国 8四国 9九州 0その他
・グループワークへ参加できない方：
1. 9日不参加 2. 10日不参加 3. 9日10日ともに不参加
・earth21-mlへの登録：
1登録済み 2希望する 3希望しない
・宿泊希望（12月15日まで）(性別や要望などをお書きください）：宿泊を希望する 宿泊を希望しない
・アルバイト希望（12月15日まで）：希望する 希望しない
・専門分野・研究してみたい分野（例：地震学） ：
・NYS-VIIIに対するご意見：期待することや，取り上げて欲しいトピックなど ：
・みんなで作る地球科学本棚
（NYS8では、参加型企画として、みなさんのオススメ地球科学本を集めています。 当日、ポスターで結果を発表するとともに、ウェブ本棚を作成予定です。ご協力お願いします。）
本のタイトル：
オススメの理由：
=====（フォームここまで）=====
＜プログラム＞（敬称略、タイトルは変更の可能性あり）
2010年1月9日（土）
10:00～ 受付開始
10:30～ 講演開始
【通常講義】
・惑星の水
杉田 精司 教授（東京大学大学院・新領域創成科学研究科・複雑理工学専攻）
「火星探査が明かす火星表層環境の初期進化」
・固体地球深部の水
鍵 裕之 准教授（東京大学大学院・理学系研究科・地殻化学実験施設）
「光と中性子で探る、地球深部物質中の水の正体」
・熱水と生命
浦辺 徹郎 教授（東京大学 大学院理学系研究科）
「（仮）化学地質学・鉱床学・海底熱水活動・微生物圏地圏相互作用」
【Ex レクチャー】
・須藤 斎 助教（名古屋大学大学院・環境学研究科）
「子供向けの本を書く ～わかりやすく研究を伝える～」
・大木聖子 助教（東京大学・地震研究所・アウトリーチ推進室）
「地球科学研究者のLiberal Arts」
15:50～ グループワークによる議論
18:00～20:00 懇親会
1月10日（日）
09:00～ 講演開始
【通常レクチャー】
・水と災害
後藤 和久 助教（東北大学大学院・工学研究科・附属災害制御研究センター）
「沿岸巨礫群‐堆積学のラストフロンティアから挑む沿岸波浪災害‐」
・現代の海洋・大気循環
小橋 史明 准教授（東京海洋大学 海洋工学部）
「北太平洋の表層循環と大気海洋相互作用」
・過去の氷床・気候変動
川村 賢二 助教（国立極地研究所・研究教育系気水圏研究グループ）
「3kmのタイムカプセル：極域の氷床コアから気候変動のメカニズムを探る」
【Ex レクチャー】
・萩谷 宏 准教授（東京都市大学 知識工学部 自然科学科 ）
「自然科学科の立ち上げ －いまこそ博物学の時代をつくろう」
・千葉達朗 氏（アジア航測株式会社プロジェクト推進室技師長 理事・フェロー）
「赤色立体地図とは～一枚で立体的に見える地形表現法の発想～」
・泊 次郎 博士（東京大学・地震研究所・研究生）
「科学記者から地球科学史研究へ」
15:10～ グループワークによる議論
17:10 閉会挨拶
2009年12月7日月曜日
新しい論文（091130-091206）
☆Nature☆
Half-precessional dynamics of monsoon rainfall near the East African Equator
Dirk Verschuren, Jaap S. Sinninghe Damsté, Jasper Moernaut, Iris Kristen, Maarten Blaauw, Maureen Fagot, Gerald H. Haug & CHALLACEA project members
Nature 462, 637-641 (3 December 2009) doi:10.1038/nature08520
→赤道アフリカ東部のChalla湖堆積物で、地震波構造探査とバイオマーカーから、過去25,000年の気候を復元。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Tracking the Variable North Atlantic Sink for Atmospheric CO2
Andrew J. Watson, Ute Schuster, Dorothee C. E. Bakker, Nicholas R. Bates, Antoine Corbiere, Melchor Gonzalez-Davila, Tobias Friedrich, Judith Hauck, Christoph Heinze, Truls Johannessen, Arne Kortzinger, Nicolas Metzl, Jon Olafsson, Are Olsen, Andreas Oschlies, X. Antonio Padin, Benjamin Pfeil, J. Magdalena Santana-Casiano, Tobias Steinhoff, Maciej Telszewski, Aida F. Rios, Douglas W. R. Wallace, and Rik Wanninkhof
Science 4 December 2009: Vol. 326. no. 5958, pp. 1391 - 1393, DOI: 10.1126/science.1177394
→観測機器を搭載した商船のネットワークを利用して、北大西洋の表層海水に吸収された二酸化炭素の量を測定した結果、海洋・大気間の二酸化炭素の流量に大きな年次変化が見られた。
【最新論文（Nature, Science）】
Coupling of CO2 and Ice Sheet Stability Over Major Climate Transitions of the Last 20 Million Years
Aradhna K. Tripati, Christopher D. Roberts, and Robert A. Eagle
Science 4 December 2009: Vol. 326. no. 5958, pp. 1394 - 1397, DOI: 10.1126/science.1178296
→海水準と大気中二酸化炭素濃度は、過去2000万年にわたり似たパターンで変動した。有孔虫のB/Ca比からpCO2推定。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Geology☆
How do prokaryotes survive in fluid inclusions in halite for 30 k.y.?
Brian A. Schubert, Tim K. Lowenstein, Michael N. Timofeeff and Matthew A. Parker
Geology December 2009 v. 37 no. 12 p. 1059-1062, doi: 10.1130/G30448A.1
→3万年前のhaliteの流体包有物から復活した好塩アーキアの生存戦略について。藻類の死骸から漏れ出てくる有機分子をエネルギー源にして生き延びていたらしい。
【最新論文（地球科学系）】
☆Chemical Geology☆
Ammonium-bearing clinopyroxene: A potential nitrogen reservoir in the Earth's mantle
Anke Watenphul, Bernd Wunder, Richard Wirth and Wilhelm Heinrich
Chemical Geology, Available online 6 December 2009, doi:10.1016/j.chemgeo.2009.12.003
→clinopyroxeneを高圧実験すると、アンモニアを500-1000ppm含有できるらしい。マントル中の窒素リザーバーとして重要？
【最新論文（地球科学系）】
☆Biogeosciences Discussions☆
Acidification increases microbial polysaccharide degradation in the ocean
J. Piontek, M. Lunau, N. Händel, C. Borchard, M. Wurst and A. Engel
Biogeosciences Discuss., 6, 11377-11400, 2009
→海洋酸性化すると、微生物によるポリ多糖の分解がより進むらしい。
【海洋生元素循環3】
☆Environmental Microbiology☆
Abundances of crenarchaeal amoA genes and transcripts in the Pacific Ocean
Matthew J. Church, Brenner Wai, David M. Karl and Edward F. DeLong
Environmental Microbiology, Published Online: 25 Nov 2009, DOI:10.1111/j.1462-2920.2009.02108.x
→海洋のCrenarchaeaのアンモニア酸化遺伝子（amoA）の存在量の発現量を中央太平洋で調べた。上層100mではCrenarchaeaは少ないが発現量は多く、深海ではCrenarchaeaは多いが発現量は低下していくらしい。
【最新論文（生物系）】
Half-precessional dynamics of monsoon rainfall near the East African Equator
Dirk Verschuren, Jaap S. Sinninghe Damsté, Jasper Moernaut, Iris Kristen, Maarten Blaauw, Maureen Fagot, Gerald H. Haug & CHALLACEA project members
Nature 462, 637-641 (3 December 2009) doi:10.1038/nature08520
→赤道アフリカ東部のChalla湖堆積物で、地震波構造探査とバイオマーカーから、過去25,000年の気候を復元。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Tracking the Variable North Atlantic Sink for Atmospheric CO2
Andrew J. Watson, Ute Schuster, Dorothee C. E. Bakker, Nicholas R. Bates, Antoine Corbiere, Melchor Gonzalez-Davila, Tobias Friedrich, Judith Hauck, Christoph Heinze, Truls Johannessen, Arne Kortzinger, Nicolas Metzl, Jon Olafsson, Are Olsen, Andreas Oschlies, X. Antonio Padin, Benjamin Pfeil, J. Magdalena Santana-Casiano, Tobias Steinhoff, Maciej Telszewski, Aida F. Rios, Douglas W. R. Wallace, and Rik Wanninkhof
Science 4 December 2009: Vol. 326. no. 5958, pp. 1391 - 1393, DOI: 10.1126/science.1177394
→観測機器を搭載した商船のネットワークを利用して、北大西洋の表層海水に吸収された二酸化炭素の量を測定した結果、海洋・大気間の二酸化炭素の流量に大きな年次変化が見られた。
【最新論文（Nature, Science）】
Coupling of CO2 and Ice Sheet Stability Over Major Climate Transitions of the Last 20 Million Years
Aradhna K. Tripati, Christopher D. Roberts, and Robert A. Eagle
Science 4 December 2009: Vol. 326. no. 5958, pp. 1394 - 1397, DOI: 10.1126/science.1178296
→海水準と大気中二酸化炭素濃度は、過去2000万年にわたり似たパターンで変動した。有孔虫のB/Ca比からpCO2推定。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Geology☆
How do prokaryotes survive in fluid inclusions in halite for 30 k.y.?
Brian A. Schubert, Tim K. Lowenstein, Michael N. Timofeeff and Matthew A. Parker
Geology December 2009 v. 37 no. 12 p. 1059-1062, doi: 10.1130/G30448A.1
→3万年前のhaliteの流体包有物から復活した好塩アーキアの生存戦略について。藻類の死骸から漏れ出てくる有機分子をエネルギー源にして生き延びていたらしい。
【最新論文（地球科学系）】
☆Chemical Geology☆
Ammonium-bearing clinopyroxene: A potential nitrogen reservoir in the Earth's mantle
Anke Watenphul, Bernd Wunder, Richard Wirth and Wilhelm Heinrich
Chemical Geology, Available online 6 December 2009, doi:10.1016/j.chemgeo.2009.12.003
→clinopyroxeneを高圧実験すると、アンモニアを500-1000ppm含有できるらしい。マントル中の窒素リザーバーとして重要？
【最新論文（地球科学系）】
☆Biogeosciences Discussions☆
Acidification increases microbial polysaccharide degradation in the ocean
J. Piontek, M. Lunau, N. Händel, C. Borchard, M. Wurst and A. Engel
Biogeosciences Discuss., 6, 11377-11400, 2009
→海洋酸性化すると、微生物によるポリ多糖の分解がより進むらしい。
【海洋生元素循環3】
☆Environmental Microbiology☆
Abundances of crenarchaeal amoA genes and transcripts in the Pacific Ocean
Matthew J. Church, Brenner Wai, David M. Karl and Edward F. DeLong
Environmental Microbiology, Published Online: 25 Nov 2009, DOI:10.1111/j.1462-2920.2009.02108.x
→海洋のCrenarchaeaのアンモニア酸化遺伝子（amoA）の存在量の発現量を中央太平洋で調べた。上層100mではCrenarchaeaは少ないが発現量は多く、深海ではCrenarchaeaは多いが発現量は低下していくらしい。
【最新論文（生物系）】
科学ニュース（091130-091206）
Undocumented Volcano Contributed to Extremely Cold Decade from 1810-1819
ScienceDaily (Dec. 5, 2009)
→1810-1819年の寒冷期の原因は、1815年のタンボラ火山に加えて、1809年の火山噴火？ アイスコアに火山由来硫酸（硫黄同位体が違うらしい）を検出。Geophysical Research Lettersに論文。
First Direct Observation of a Planet-Like Object Orbiting Star Similar to Sun
ScienceDaily (Dec. 3, 2009)
→すばる望遠鏡が、太陽と同じくらいの質量の星の近くで系外惑星候補を直接撮像することに、世界で初めて成功した。Astrophysical Journal Lettersに論文。
New Study Adds to FInding of Ancient Life Signs In Mars Meteorite
SpaceRef.com, November 30, 2009
→火星隕石ALH84001の“微化石”的な鎖状マグネタイトは、無機的には生成されず、生物由来の可能性が高いとか？ Geochimica et Cosmochimica Actaに論文。
Big Freeze Plunged Europe Into Ice Age in Months
ScienceDaily (Nov. 30, 2009)
→アイルランドの湖底堆積物を高解像度分析すると、Younger Dryasは数ヶ月～2年という短期間に急速に訪れたらしい。リアル“デイ・アフター・トゥモロー”？ the European Science Foundation BOREAS conferenceで発表。
ScienceDaily (Dec. 5, 2009)
→1810-1819年の寒冷期の原因は、1815年のタンボラ火山に加えて、1809年の火山噴火？ アイスコアに火山由来硫酸（硫黄同位体が違うらしい）を検出。Geophysical Research Lettersに論文。
First Direct Observation of a Planet-Like Object Orbiting Star Similar to Sun
ScienceDaily (Dec. 3, 2009)
→すばる望遠鏡が、太陽と同じくらいの質量の星の近くで系外惑星候補を直接撮像することに、世界で初めて成功した。Astrophysical Journal Lettersに論文。
New Study Adds to FInding of Ancient Life Signs In Mars Meteorite
SpaceRef.com, November 30, 2009
→火星隕石ALH84001の“微化石”的な鎖状マグネタイトは、無機的には生成されず、生物由来の可能性が高いとか？ Geochimica et Cosmochimica Actaに論文。
Big Freeze Plunged Europe Into Ice Age in Months
ScienceDaily (Nov. 30, 2009)
→アイルランドの湖底堆積物を高解像度分析すると、Younger Dryasは数ヶ月～2年という短期間に急速に訪れたらしい。リアル“デイ・アフター・トゥモロー”？ the European Science Foundation BOREAS conferenceで発表。
2009年12月1日火曜日
集めた論文の覚書 ［水素酸化微生物］ Literature Review [Hydrogen-oxidizing microbes]
H君に送ってもらった、温泉微生物論文（Kimura et al. 2009, EM）に関連して探してきた論文。
The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus
Gerard Deckert, Patrick V. Warren, Terry Gaasterland, William G. Young, Anna L. Lenox, David E. Graham, Ross Overbeek, Marjory A. Snead, Martin Keller, Monette Aujay, Robert Huber, Robert A. Feldman, Jay M. Short, Gary J. Olsen and Ronald V. Swanson
Nature 392, 353-358 (26 March 1998) doi:10.1038/32831
→超好熱性・好気水素酸化バクテリアAquifex aeolicusの完全ゲノム解読。
Use of Fe(III) as an Electron Acceptor To Recover Previously Uncultured Hyperthermophiles: Isolation and Characterization of Geothermobacterium ferrireducens gen. nov., sp. nov.
Kazem Kashefi, Dawn E. Holmes, Anna-Louise Reysenbach and Derek R. Lovley
Applied and Environmental Microbiology, April 2002, p. 1735-1742, Vol. 68, No. 4, DOI: 10.1128/AEM.68.4.1735-1742.2002
→超好熱性・水素酸化－鉄還元バクテリアGeothermobacterium ferrireducensの単離と性質同定。
Hydrogen isotope fractionation during H2/CO2 acetogenesis: hydrogen utilization efficiency and the origin of lipid-bound hydrogen
D. L. Valentine, A. L. Sessions, S. C. Tyler and A. Chidthaisong
Geobiology, Volume 2 Issue 3, Pages 179 - 188, Published Online: 29 Sep 2004, DOI:10.1111/j.1472-4677.2004.00030.x
→水素/二酸化炭素から嫌気的酢酸生成を行うバクテリアSporomusa sp.の水素代謝を調べるため、水素ガス、水、脂肪酸の水素同位体比を分析。脂肪酸と水の水素同位体比は非常によく相関。脂肪酸の水素は水から来ている？ 水と同位体平衡になった水素からも来ている？ また、脂肪酸の水素同位体比は他の生物に比べて格別低い。
Hydrogen isotopic fractionation in lipid biosynthesis by H2-consuming Desulfobacterium autotrophicumBrian J. Campbell, Chao Li, Alex L. Sessions and David L. Valentine
Geochimica et Cosmochimica Acta, Volume 73, Issue 10, 15 May 2009, Pages 2744-2757, doi:10.1016/j.gca.2009.02.034
→硫酸還元－水素酸化バクテリアDesulfobacterium autotrophicumの脂質生合成における水素同位体分別を調べた。Sporomusa sp.ほどではないが、光合成生物などと比べると、やはり大きな同位体分別。水素ガスは脂肪酸の水素としては入ってきていないらしい。
The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus
Gerard Deckert, Patrick V. Warren, Terry Gaasterland, William G. Young, Anna L. Lenox, David E. Graham, Ross Overbeek, Marjory A. Snead, Martin Keller, Monette Aujay, Robert Huber, Robert A. Feldman, Jay M. Short, Gary J. Olsen and Ronald V. Swanson
Nature 392, 353-358 (26 March 1998) doi:10.1038/32831
→超好熱性・好気水素酸化バクテリアAquifex aeolicusの完全ゲノム解読。
Use of Fe(III) as an Electron Acceptor To Recover Previously Uncultured Hyperthermophiles: Isolation and Characterization of Geothermobacterium ferrireducens gen. nov., sp. nov.
Kazem Kashefi, Dawn E. Holmes, Anna-Louise Reysenbach and Derek R. Lovley
Applied and Environmental Microbiology, April 2002, p. 1735-1742, Vol. 68, No. 4, DOI: 10.1128/AEM.68.4.1735-1742.2002
→超好熱性・水素酸化－鉄還元バクテリアGeothermobacterium ferrireducensの単離と性質同定。
Hydrogen isotope fractionation during H2/CO2 acetogenesis: hydrogen utilization efficiency and the origin of lipid-bound hydrogen
D. L. Valentine, A. L. Sessions, S. C. Tyler and A. Chidthaisong
Geobiology, Volume 2 Issue 3, Pages 179 - 188, Published Online: 29 Sep 2004, DOI:10.1111/j.1472-4677.2004.00030.x
→水素/二酸化炭素から嫌気的酢酸生成を行うバクテリアSporomusa sp.の水素代謝を調べるため、水素ガス、水、脂肪酸の水素同位体比を分析。脂肪酸と水の水素同位体比は非常によく相関。脂肪酸の水素は水から来ている？ 水と同位体平衡になった水素からも来ている？ また、脂肪酸の水素同位体比は他の生物に比べて格別低い。
Hydrogen isotopic fractionation in lipid biosynthesis by H2-consuming Desulfobacterium autotrophicumBrian J. Campbell, Chao Li, Alex L. Sessions and David L. Valentine
Geochimica et Cosmochimica Acta, Volume 73, Issue 10, 15 May 2009, Pages 2744-2757, doi:10.1016/j.gca.2009.02.034
→硫酸還元－水素酸化バクテリアDesulfobacterium autotrophicumの脂質生合成における水素同位体分別を調べた。Sporomusa sp.ほどではないが、光合成生物などと比べると、やはり大きな同位体分別。水素ガスは脂肪酸の水素としては入ってきていないらしい。
集めた論文の覚書 ［メタン生成アーキア＆補酵素］ Literature Review [Methanogenic archaea & coenzymes]
メタン生成アーキアおよび、その補酵素F430とF420に注目して集めた論文。
Methanogenesis in Marine SedimentsJames G. Ferry and Daniel J. Lessner
Annals of the New York Academy of Sciences (2008) Volume 1125, Pages 147 - 157, DOI:10.1196/annals.1419.007
→海底堆積物において酢酸や一酸化炭素からメタン生成する海洋アーキア（Methanosarcina acetivorans）について。淡水アーキアの代謝経路とはだいぶ違うらしい。
Methanogenic archaea: ecologically relevant differences in energy conservationRudolf K. Thauer, Anne-Kristin Kaster, Henning Seedorf, Wolfgang Buckel & Reiner Hedderich
Nature Reviews Microbiology 6, 579-591 (August 2008) doi:10.1038/nrmicro1931
→メタン生成アーキアのレビュー。
Nitrogen fixation in methanogens: the archaeal perspectiveJA Leigh
Current issues in molecular biology (2000) 2(4): 125-131.
→メタン生成アーキアによる窒素固定のレビュー。
Comparison of Methane Production Rate and Coenzyme F420 Content of Methanogenic Consortia in Anaerobic Granular Sludge
Jan Dolfing and Jan-Willem Mulder
Appl Environ Microbiol. 1985 May; 49(5): 1142-1145
→様々な基質でのメタン生成アーキアで、メタン生成活性とF420の量を比較。酢酸からのメタン生成では、F420が少ない。
Isolation and Properties of a Fluorescent Compound, Factor420, from Methanobacterium Strain M.o.H
P. Cheeseman, A. Toms-Wood and R. S. Wolfe
J Bacteriol. 1972 October; 112(1): 527-531
→F420の初期の研究。まだこの時点では構造不明。菌体の1万分の1ものF420が回収できる。
Changes in concentrations of coenzyme F420 analogs during batch growth of Methanosarcina barkeri and Methanosarcina mazeiM W Peck
Appl Environ Microbiol. 1989 April; 55(4): 940-945
→HPLCによってF420アナログ（F420-2～5）を分離。
Steady-State and Time-Resolved Spectroscopy of F420 Extracted from Methanogen Cells and Its Utility as a Marker for Fecal Contamination
Kyle D. Ashby, Thomas A. Casey, Mark A. Rasmussen, and, Jacob W. Petrich,
Journal of Agricultural and Food Chemistry 2001 49 (3), 1123-1127
→イオン交換カラムでF420を分離。
Methyl-coenzyme M reductase and the anaerobic oxidation of methane in methanotrophic Archaea
Seigo Shima and Rudolf K Thauer
Current Opinion in Microbiology, Volume 8, Issue 6, December 2005, Pages 643-648, DOI:doi:10.1016/j.mib.2005.10.002
→嫌気的メタン酸化アーキアが持つメチル－補酵素M還元酵素（MCR）についてレビュー。F430の変形版を持つらしい。
A conspicuous nickel protein in microbial mats that oxidize methane anaerobicallyMartin Krüger, Anke Meyerdierks, Frank Oliver Glöckner, Rudolf Amann, Friedrich Widdel, Michael Kube, Richard Reinhardt, Jörg Kahnt, Reinhard Böcher, Rudolf K. Thauer and Seigo Shima
Nature 426, 878-881 (18 December 2003) doi:10.1038/nature02207doi:10.1038/nature02207
→AOMが起きている黒海の微生物マットに、大量のF430アナログ。
Reverse Methanogenesis: Testing the Hypothesis with Environmental Genomics
Steven J. Hallam, Nik Putnam, Christina M. Preston, John C. Detter, Daniel Rokhsar, Paul M. Richardson, Edward F. DeLong1
Science 3 September 2004: Vol. 305. no. 5689, pp. 1457 - 1462, DOI: 10.1126/science.1100025
→嫌気的メタン酸化アーキアのメタゲノムから、代謝経路を推定。「メタン生成代謝の逆回し」説を支持。F420も使うらしい。うーむ。
Structure of an F430 Variant from Archaea Associated with Anaerobic Oxidation of MethaneStefan Mayr, Christopher Latkoczy, Martin Krger, Detlef Gnther, Seigo Shima, Rudolf K. Thauer, Friedrich Widdel, Bernhard Jaun
Journal of the American Chemical Society 2008 130 (32), 10758-10767
→AOMアーキアが持つF430アナログの構造決定。硫黄が入っている。
Biosynthesis of coenzyme F430 in methanogenic bacteria: Identification of 15,173-seco-F430-173-acid as an intermediateAndreas PFALTZ, André KOBELT, Rudolf HÜSTER, Rudolf K. THAUER
European Journal of Biochemistry (1987) Volume 170 Issue 1-2, Pages 459 - 467, DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13722.x
→メタン生成アーキアによるF430生合成における中間代謝物の同定。
The archaeal cofactor F0 is a light-harvesting antenna chromophore in eukaryotesAndreas F. Glas, Melanie J. Maul, Max Cryle, Thomas R. M. Barends, Sabine Schneider, Emine Kaya, Ilme Schlichting, and Thomas Carell
PNAS 2009 106:11540-11545; doi:10.1073/pnas.0812665106
→F420アナログのF0が、真核生物（ハエ、藻類）でも機能していることが分かった。うーむ。
Heme Biosynthesis in Methanosarcina barkeri via a Pathway Involving Two Methylation ReactionsBärbel Buchenau, Jörg Kahnt, Ilka U. Heinemann, Dieter Jahn, and Rudolf K. Thauer
J Bacteriol. 2006 December; 188(24): 8666–8668. Published online 2006 October 6. doi: 10.1128/JB.01349-06.→メタン生成アーキアMethanosarcina barkeriにおけるヘム生合成代謝系。
Methanogenesis in Marine SedimentsJames G. Ferry and Daniel J. Lessner
Annals of the New York Academy of Sciences (2008) Volume 1125, Pages 147 - 157, DOI:10.1196/annals.1419.007
→海底堆積物において酢酸や一酸化炭素からメタン生成する海洋アーキア（Methanosarcina acetivorans）について。淡水アーキアの代謝経路とはだいぶ違うらしい。
Methanogenic archaea: ecologically relevant differences in energy conservationRudolf K. Thauer, Anne-Kristin Kaster, Henning Seedorf, Wolfgang Buckel & Reiner Hedderich
Nature Reviews Microbiology 6, 579-591 (August 2008) doi:10.1038/nrmicro1931
→メタン生成アーキアのレビュー。
Nitrogen fixation in methanogens: the archaeal perspectiveJA Leigh
Current issues in molecular biology (2000) 2(4): 125-131.
→メタン生成アーキアによる窒素固定のレビュー。
Comparison of Methane Production Rate and Coenzyme F420 Content of Methanogenic Consortia in Anaerobic Granular Sludge
Jan Dolfing and Jan-Willem Mulder
Appl Environ Microbiol. 1985 May; 49(5): 1142-1145
→様々な基質でのメタン生成アーキアで、メタン生成活性とF420の量を比較。酢酸からのメタン生成では、F420が少ない。
Isolation and Properties of a Fluorescent Compound, Factor420, from Methanobacterium Strain M.o.H
P. Cheeseman, A. Toms-Wood and R. S. Wolfe
J Bacteriol. 1972 October; 112(1): 527-531
→F420の初期の研究。まだこの時点では構造不明。菌体の1万分の1ものF420が回収できる。
Changes in concentrations of coenzyme F420 analogs during batch growth of Methanosarcina barkeri and Methanosarcina mazeiM W Peck
Appl Environ Microbiol. 1989 April; 55(4): 940-945
→HPLCによってF420アナログ（F420-2～5）を分離。
Steady-State and Time-Resolved Spectroscopy of F420 Extracted from Methanogen Cells and Its Utility as a Marker for Fecal Contamination
Kyle D. Ashby, Thomas A. Casey, Mark A. Rasmussen, and, Jacob W. Petrich,
Journal of Agricultural and Food Chemistry 2001 49 (3), 1123-1127
→イオン交換カラムでF420を分離。
Methyl-coenzyme M reductase and the anaerobic oxidation of methane in methanotrophic Archaea
Seigo Shima and Rudolf K Thauer
Current Opinion in Microbiology, Volume 8, Issue 6, December 2005, Pages 643-648, DOI:doi:10.1016/j.mib.2005.10.002
→嫌気的メタン酸化アーキアが持つメチル－補酵素M還元酵素（MCR）についてレビュー。F430の変形版を持つらしい。
A conspicuous nickel protein in microbial mats that oxidize methane anaerobicallyMartin Krüger, Anke Meyerdierks, Frank Oliver Glöckner, Rudolf Amann, Friedrich Widdel, Michael Kube, Richard Reinhardt, Jörg Kahnt, Reinhard Böcher, Rudolf K. Thauer and Seigo Shima
Nature 426, 878-881 (18 December 2003) doi:10.1038/nature02207doi:10.1038/nature02207
→AOMが起きている黒海の微生物マットに、大量のF430アナログ。
Reverse Methanogenesis: Testing the Hypothesis with Environmental Genomics
Steven J. Hallam, Nik Putnam, Christina M. Preston, John C. Detter, Daniel Rokhsar, Paul M. Richardson, Edward F. DeLong1
Science 3 September 2004: Vol. 305. no. 5689, pp. 1457 - 1462, DOI: 10.1126/science.1100025
→嫌気的メタン酸化アーキアのメタゲノムから、代謝経路を推定。「メタン生成代謝の逆回し」説を支持。F420も使うらしい。うーむ。
Structure of an F430 Variant from Archaea Associated with Anaerobic Oxidation of MethaneStefan Mayr, Christopher Latkoczy, Martin Krger, Detlef Gnther, Seigo Shima, Rudolf K. Thauer, Friedrich Widdel, Bernhard Jaun
Journal of the American Chemical Society 2008 130 (32), 10758-10767
→AOMアーキアが持つF430アナログの構造決定。硫黄が入っている。
Biosynthesis of coenzyme F430 in methanogenic bacteria: Identification of 15,173-seco-F430-173-acid as an intermediateAndreas PFALTZ, André KOBELT, Rudolf HÜSTER, Rudolf K. THAUER
European Journal of Biochemistry (1987) Volume 170 Issue 1-2, Pages 459 - 467, DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13722.x
→メタン生成アーキアによるF430生合成における中間代謝物の同定。
The archaeal cofactor F0 is a light-harvesting antenna chromophore in eukaryotesAndreas F. Glas, Melanie J. Maul, Max Cryle, Thomas R. M. Barends, Sabine Schneider, Emine Kaya, Ilme Schlichting, and Thomas Carell
PNAS 2009 106:11540-11545; doi:10.1073/pnas.0812665106
→F420アナログのF0が、真核生物（ハエ、藻類）でも機能していることが分かった。うーむ。
Heme Biosynthesis in Methanosarcina barkeri via a Pathway Involving Two Methylation ReactionsBärbel Buchenau, Jörg Kahnt, Ilka U. Heinemann, Dieter Jahn, and Rudolf K. Thauer
J Bacteriol. 2006 December; 188(24): 8666–8668. Published online 2006 October 6. doi: 10.1128/JB.01349-06.→メタン生成アーキアMethanosarcina barkeriにおけるヘム生合成代謝系。
新しい論文（091123-091129）
☆Nature☆
Increase in Agulhas leakage due to poleward shift of Southern Hemisphere westerlies
A. Biastoch, C. W. Böning, F. U. Schwarzkopf & J. R. E. Lutjeharms
Nature 462, 495-498 (26 November 2009) doi:10.1038/nature08519
→アガラス･リーケージによるインド洋水塊の南大西洋への輸送が、風の強制の変動に応答して過去数十年間に増加しているらしい。南大西洋の水温躍層水塊で観測された塩分濃度の増加の一因。MOCの将来の変化に影響する可能性あり。
【最新論文（Nature, Science）】
Host plant genome overcomes the lack of a bacterial gene for symbiotic nitrogen fixation
Tsuneo Hakoyama, Kaori Niimi, Hirokazu Watanabe, Ryohei Tabata, Junichi Matsubara, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Li Jichun, Tsuyoshi Matsumoto, Kazuyuki Tatsumi, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima, Masumi Ishizaka, Koji Yano, Haruko Imaizumi-Anraku, Masayoshi Kawaguchi, Hiroshi Kouchi & Norio Suganuma
Nature 462, 514-517 (26 November 2009) doi:10.1038/nature08594
→内部共生細菌の窒素固定系には、宿主植物細胞由来のホモクエン酸が必須らしい。共生窒素固定におけるマメ科植物と根粒菌との相補的で不可欠な協力関係の分子基盤が分かってきた。
【最新論文（Nature, Science）】
An ancient light-harvesting protein is critical for the regulation of algal photosynthesis
Graham Peers, Thuy B. Truong, Elisabeth Ostendorf, Andreas Busch, Dafna Elrad, Arthur R. Grossman, Michael Hippler & Krishna K. Niyogi
Nature 462, 518-521 (26 November 2009) doi:10.1038/nature08587
→真核藻類の酸化損傷防御装置を調べると、陸上植物とは異なったタンパク質を用いて有害な余剰光エネルギーを消失させ、光合成装置を損傷から守っていることが分かった。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Climate-Driven Basin-Scale Decadal Oscillations of Oceanic Phytoplankton
Elodie Martinez, David Antoine, Fabrizio D’Ortenzio, and Bernard Gentili
Science 27 November 2009: Vol. 326. no. 5957, pp. 1253 – 1256, DOI: 10.1126/science.1177012
→衛星データによると、海洋上層の植物プランクトン（クロロフィル）が、海盆スケールで、海面水温の10年規模変動に影響されている。
【最新論文（Nature, Science）】
Global Signatures and Dynamical Origins of the Little Ice Age and Medieval Climate Anomaly
Michael E. Mann, Zhihua Zhang, Scott Rutherford, Raymond S. Bradley, Malcolm K. Hughes, Drew Shindell, Caspar Ammann, Greg Faluvegi, and Fenbiao Ni
Science 27 November 2009: Vol. 326. no. 5957, pp. 1256 - 1260, DOI: 10.1126/science.1177303
→過去1500年間の気温変動の空間的分布を、プロキシネットワークから復元。中世温暖期や小氷期は、自然気候強制力に対して、エルニーニョや北大西洋振動のような大規模な過程を経て現れた、気候システムの力学的応答らしい。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Organic Geochemistry☆
δ13C-δD distribution of lipid biomarkers in a bacterial mat from a hot spring in Miyagi Prefecture, NE Japan
Hiroshi Naraoka, Tomoko Uehara, Satoshi Hanada and Takeshi Kakegawa
Organic Geochemistry (2009), Available online 26 November 2009, doi:10.1016/j.orggeochem.2009.11.008
→宮城県の温泉微生物マットで脂質の炭素・水素同位体組成分析。C16:1脂肪酸とC20:1脂肪酸で、値が大きく違い、各微生物の代謝経路を反映？
【熱水系1】
☆Biogeosciences☆
Nitrogen uptake and regeneration pathways in the equatorial Pacific: a basin scale modeling study
X. J. Wang, R. Murtugudde and R. Le Borgne
Biogeosciences, 6, 2647-2660, 2009
→赤道太平洋で硝酸・アンモニアの同化・無機化過程の数値モデル。栄養塩の空間分布をうまく再現できたらしい。動物プランクトンによるアンモニア排出が、貧栄養海域有光層における重要な窒素源となっている。
【最新論文（地球科学系）】
☆The ISME Journal☆
Polymerase chain reaction primers miss half of rRNA microbial diversity
SunHee Hong, John Bunge, Chesley Leslin, Sunok Jeon and Slava S Epstein
The ISME Journal (2009) 3, 1365–1373; doi:10.1038/ismej.2009.89
→PCRプライマーやDNA抽出のバイアスがあるため、単一のPCRプライマーとDNA抽出法の組み合わせだと、rRNAの多様性の半分を検出できていないらしい。様々なプライマー・抽出手法を組み合わせるとバイアスは減るが、それでもまだ検出できていない微生物がいそう。
【最新論文（生物系）】
Microbial community structure in the North Pacific ocean
Mark V Brown, Gayle K Philip, John A Bunge, Matthew C Smith, Andrew Bissett, Federico M Lauro, Jed A Fuhrman and Stuart P Donachie
The ISME Journal (2009) 3, 1374–1386; doi:10.1038/ismej.2009.86
→北太平洋ALOHAでribosomal tag pyrosequencingで、微生物群集組成を調べた。従来研究よりも真核微生物の多様性がほぼ１桁多く推定されたらしい。微生物ループとかに重要？
【最新論文（生物系）】
Abundant transposases encoded by the metagenome of a hydrothermal chimney biofilm
William J Brazelton1 and John A Baross
The ISME Journal (2009) 3, 1420–1424; doi:10.1038/ismej.2009.79
→Lost City熱水噴出孔の微生物マットでメタゲノム解析すると、遺伝子水平伝播に関係する酵素遺伝子が大量に含まれていた。しかも16S rRNAよりも多様性が高い。種としての多様性が低くても、水平伝播を活用して、発現型として多様性が高くなる？
【最新論文（生物系）】
☆Trends in Microbiology☆
New dimensions of the virus world discovered through metagenomics
David M. Kristensen, Arcady R. Mushegian, Valerian V. Dolja and Eugene V. Koonin
Trends in Microbiology, Available online 26 November 2009, DOI:doi:10.1016/j.tim.2009.11.003
→ウイルスのメタゲノムのレビュー。
【ウイルス1】
Increase in Agulhas leakage due to poleward shift of Southern Hemisphere westerlies
A. Biastoch, C. W. Böning, F. U. Schwarzkopf & J. R. E. Lutjeharms
Nature 462, 495-498 (26 November 2009) doi:10.1038/nature08519
→アガラス･リーケージによるインド洋水塊の南大西洋への輸送が、風の強制の変動に応答して過去数十年間に増加しているらしい。南大西洋の水温躍層水塊で観測された塩分濃度の増加の一因。MOCの将来の変化に影響する可能性あり。
【最新論文（Nature, Science）】
Host plant genome overcomes the lack of a bacterial gene for symbiotic nitrogen fixation
Tsuneo Hakoyama, Kaori Niimi, Hirokazu Watanabe, Ryohei Tabata, Junichi Matsubara, Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Li Jichun, Tsuyoshi Matsumoto, Kazuyuki Tatsumi, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima, Masumi Ishizaka, Koji Yano, Haruko Imaizumi-Anraku, Masayoshi Kawaguchi, Hiroshi Kouchi & Norio Suganuma
Nature 462, 514-517 (26 November 2009) doi:10.1038/nature08594
→内部共生細菌の窒素固定系には、宿主植物細胞由来のホモクエン酸が必須らしい。共生窒素固定におけるマメ科植物と根粒菌との相補的で不可欠な協力関係の分子基盤が分かってきた。
【最新論文（Nature, Science）】
An ancient light-harvesting protein is critical for the regulation of algal photosynthesis
Graham Peers, Thuy B. Truong, Elisabeth Ostendorf, Andreas Busch, Dafna Elrad, Arthur R. Grossman, Michael Hippler & Krishna K. Niyogi
Nature 462, 518-521 (26 November 2009) doi:10.1038/nature08587
→真核藻類の酸化損傷防御装置を調べると、陸上植物とは異なったタンパク質を用いて有害な余剰光エネルギーを消失させ、光合成装置を損傷から守っていることが分かった。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Climate-Driven Basin-Scale Decadal Oscillations of Oceanic Phytoplankton
Elodie Martinez, David Antoine, Fabrizio D’Ortenzio, and Bernard Gentili
Science 27 November 2009: Vol. 326. no. 5957, pp. 1253 – 1256, DOI: 10.1126/science.1177012
→衛星データによると、海洋上層の植物プランクトン（クロロフィル）が、海盆スケールで、海面水温の10年規模変動に影響されている。
【最新論文（Nature, Science）】
Global Signatures and Dynamical Origins of the Little Ice Age and Medieval Climate Anomaly
Michael E. Mann, Zhihua Zhang, Scott Rutherford, Raymond S. Bradley, Malcolm K. Hughes, Drew Shindell, Caspar Ammann, Greg Faluvegi, and Fenbiao Ni
Science 27 November 2009: Vol. 326. no. 5957, pp. 1256 - 1260, DOI: 10.1126/science.1177303
→過去1500年間の気温変動の空間的分布を、プロキシネットワークから復元。中世温暖期や小氷期は、自然気候強制力に対して、エルニーニョや北大西洋振動のような大規模な過程を経て現れた、気候システムの力学的応答らしい。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Organic Geochemistry☆
δ13C-δD distribution of lipid biomarkers in a bacterial mat from a hot spring in Miyagi Prefecture, NE Japan
Hiroshi Naraoka, Tomoko Uehara, Satoshi Hanada and Takeshi Kakegawa
Organic Geochemistry (2009), Available online 26 November 2009, doi:10.1016/j.orggeochem.2009.11.008
→宮城県の温泉微生物マットで脂質の炭素・水素同位体組成分析。C16:1脂肪酸とC20:1脂肪酸で、値が大きく違い、各微生物の代謝経路を反映？
【熱水系1】
☆Biogeosciences☆
Nitrogen uptake and regeneration pathways in the equatorial Pacific: a basin scale modeling study
X. J. Wang, R. Murtugudde and R. Le Borgne
Biogeosciences, 6, 2647-2660, 2009
→赤道太平洋で硝酸・アンモニアの同化・無機化過程の数値モデル。栄養塩の空間分布をうまく再現できたらしい。動物プランクトンによるアンモニア排出が、貧栄養海域有光層における重要な窒素源となっている。
【最新論文（地球科学系）】
☆The ISME Journal☆
Polymerase chain reaction primers miss half of rRNA microbial diversity
SunHee Hong, John Bunge, Chesley Leslin, Sunok Jeon and Slava S Epstein
The ISME Journal (2009) 3, 1365–1373; doi:10.1038/ismej.2009.89
→PCRプライマーやDNA抽出のバイアスがあるため、単一のPCRプライマーとDNA抽出法の組み合わせだと、rRNAの多様性の半分を検出できていないらしい。様々なプライマー・抽出手法を組み合わせるとバイアスは減るが、それでもまだ検出できていない微生物がいそう。
【最新論文（生物系）】
Microbial community structure in the North Pacific ocean
Mark V Brown, Gayle K Philip, John A Bunge, Matthew C Smith, Andrew Bissett, Federico M Lauro, Jed A Fuhrman and Stuart P Donachie
The ISME Journal (2009) 3, 1374–1386; doi:10.1038/ismej.2009.86
→北太平洋ALOHAでribosomal tag pyrosequencingで、微生物群集組成を調べた。従来研究よりも真核微生物の多様性がほぼ１桁多く推定されたらしい。微生物ループとかに重要？
【最新論文（生物系）】
Abundant transposases encoded by the metagenome of a hydrothermal chimney biofilm
William J Brazelton1 and John A Baross
The ISME Journal (2009) 3, 1420–1424; doi:10.1038/ismej.2009.79
→Lost City熱水噴出孔の微生物マットでメタゲノム解析すると、遺伝子水平伝播に関係する酵素遺伝子が大量に含まれていた。しかも16S rRNAよりも多様性が高い。種としての多様性が低くても、水平伝播を活用して、発現型として多様性が高くなる？
【最新論文（生物系）】
☆Trends in Microbiology☆
New dimensions of the virus world discovered through metagenomics
David M. Kristensen, Arcady R. Mushegian, Valerian V. Dolja and Eugene V. Koonin
Trends in Microbiology, Available online 26 November 2009, DOI:doi:10.1016/j.tim.2009.11.003
→ウイルスのメタゲノムのレビュー。
【ウイルス1】
科学ニュース（091123-091129）
Scientists Explain Puzzling Lake Asymmetry on Titan
ScienceDaily (Nov. 29, 2009)
→タイタンの炭化水素湖の分布の非対称性は、軌道強制力（地球で言うところのミランコビッチサイクル）のせいらしい。カッシーニのデータ解析から明らかになった。へー。Nature Geoscienceに論文。
Microbiology: Variety—the Splice of Life—in Microbial Communities
Science Perspectives, 27 November 2009
→バクテリアやアーキアは、ウイルスの遺伝子の破片をゲノムに取り込むことで、群集内でも個体ごとにゲノムが異なる。破片取り込みによって、ウイルス感染に対抗しているらしい？
Single-celled life does a lot with very little
Nature News, 26 November 2009
→バクテリア（Mycoplasma pneumoniae）のプロテオーム、トランスクリプトーム、メタボロームが、3本並んでScienceに掲載。タンパク質をコードしてる遺伝子は689個しかないのに、色んな代謝を行っているらしい。
Democratic fallacy
Nature Editorials, November 25 2009
→科学技術予算に対する事業仕分けについての、Nature誌の社説。fallacy=誤った議論、詭弁。
Oceans Absorbing Carbon Dioxide More Slowly, Scientist Finds
ScienceDaily (Nov. 24, 2009)
→全球平均気温と大気中二酸化炭素濃度のラグが、20年前の5カ月から現在は15カ月に伸びたらしい。つまり、海洋による二酸化炭素吸収が遅くなっている。Geophysical Research Lettersに論文。
Aquatic Bacteria: Possible Markers for Monitoring Arctic Climate Change
ScienceDaily (Nov. 24, 2009)
→北極圏の大河川で、バクテリアの群集組成は気候変動を反映して変動しているらしい。気候変動のマーカーになる？ PNAS電子版に論文。
Climate Modeling May Have Missed Something: Aquatic Creatures Mix Ocean Water by Swimming
ScienceDaily (Nov. 23, 2009)
→生物が海洋をかき回す効果（以前に測定結果がNatureに出ていた）を、海洋・気候モデルに組み込んだ。the 62nd Annual Meeting of the American Physical Society's (APS) Division of Fluid Dynamicsで発表。
Extensive Valley Network on Mars Adds to Evidence for Ancient Martian Ocean
ScienceDaily (Nov. 23, 2009)
→火星のバレーネットワークの全球地図を描くと、従来考えられていたよりも2倍以上密らしい。昔に海があった説を支持。バレーネットワークを研究していた某氏は大丈夫だろうか…。Journal of Geophysical Research - Planetsに論文。
ScienceDaily (Nov. 29, 2009)
→タイタンの炭化水素湖の分布の非対称性は、軌道強制力（地球で言うところのミランコビッチサイクル）のせいらしい。カッシーニのデータ解析から明らかになった。へー。Nature Geoscienceに論文。
Microbiology: Variety—the Splice of Life—in Microbial Communities
Science Perspectives, 27 November 2009
→バクテリアやアーキアは、ウイルスの遺伝子の破片をゲノムに取り込むことで、群集内でも個体ごとにゲノムが異なる。破片取り込みによって、ウイルス感染に対抗しているらしい？
Single-celled life does a lot with very little
Nature News, 26 November 2009
→バクテリア（Mycoplasma pneumoniae）のプロテオーム、トランスクリプトーム、メタボロームが、3本並んでScienceに掲載。タンパク質をコードしてる遺伝子は689個しかないのに、色んな代謝を行っているらしい。
Democratic fallacy
Nature Editorials, November 25 2009
→科学技術予算に対する事業仕分けについての、Nature誌の社説。fallacy=誤った議論、詭弁。
Oceans Absorbing Carbon Dioxide More Slowly, Scientist Finds
ScienceDaily (Nov. 24, 2009)
→全球平均気温と大気中二酸化炭素濃度のラグが、20年前の5カ月から現在は15カ月に伸びたらしい。つまり、海洋による二酸化炭素吸収が遅くなっている。Geophysical Research Lettersに論文。
Aquatic Bacteria: Possible Markers for Monitoring Arctic Climate Change
ScienceDaily (Nov. 24, 2009)
→北極圏の大河川で、バクテリアの群集組成は気候変動を反映して変動しているらしい。気候変動のマーカーになる？ PNAS電子版に論文。
Climate Modeling May Have Missed Something: Aquatic Creatures Mix Ocean Water by Swimming
ScienceDaily (Nov. 23, 2009)
→生物が海洋をかき回す効果（以前に測定結果がNatureに出ていた）を、海洋・気候モデルに組み込んだ。the 62nd Annual Meeting of the American Physical Society's (APS) Division of Fluid Dynamicsで発表。
Extensive Valley Network on Mars Adds to Evidence for Ancient Martian Ocean
ScienceDaily (Nov. 23, 2009)
→火星のバレーネットワークの全球地図を描くと、従来考えられていたよりも2倍以上密らしい。昔に海があった説を支持。バレーネットワークを研究していた某氏は大丈夫だろうか…。Journal of Geophysical Research - Planetsに論文。
2009年11月29日日曜日
地球化学関東若手セミナー第2回（12/27）
「地球化学関東若手セミナー」の第2回を、
12月27日に東大海洋研で開催します。
今回からは、2人ぐらいが長めの時間で、
レビュー・イントロをメインに発表する形式です。
興味のある方は、ぜひぜひご参加ください。
日時： 12月27日（日） 15:00-
場所： 東京大学海洋研究所 A棟1F大講義室
アクセス： http://www.ori.u-tokyo.ac.jp/about/j/map.html
（門正面の5階建ての建物（A棟）の、正面玄関から入って左奥の教室）
【プログラム】
15:00-16:00
内藤 裕一
東京大学大学院新領域創成科学研究科先端生命科学専攻 D1
「考古学試料に対する有機分子レベル同位体分析の応用：現状と展望」
16:10-17:10
山崎 絵里香
東京工業大学大学院理工学研究科地球惑星科学専攻 D1
「スズ同位体を用いた地球化学・考古学」
17:20-18:00 総合討論
18:00- 懇親会
12月27日に東大海洋研で開催します。
今回からは、2人ぐらいが長めの時間で、
レビュー・イントロをメインに発表する形式です。
興味のある方は、ぜひぜひご参加ください。
日時： 12月27日（日） 15:00-
場所： 東京大学海洋研究所 A棟1F大講義室
アクセス： http://www.ori.u-tokyo.ac.jp/about/j/map.html
（門正面の5階建ての建物（A棟）の、正面玄関から入って左奥の教室）
【プログラム】
15:00-16:00
内藤 裕一
東京大学大学院新領域創成科学研究科先端生命科学専攻 D1
「考古学試料に対する有機分子レベル同位体分析の応用：現状と展望」
16:10-17:10
山崎 絵里香
東京工業大学大学院理工学研究科地球惑星科学専攻 D1
「スズ同位体を用いた地球化学・考古学」
17:20-18:00 総合討論
18:00- 懇親会
2009年11月24日火曜日
科学ニュース（091116-091122）
Origin of Life: Generating RNA Molecules in Water
ScienceDaily (Nov. 20, 2009)
→環状ヌクレオチドが40-90℃のお湯に入れておくだけで、100個以上が連なる鎖（RNA）ができた。生命の起源にヒント？ Journal of Biological Chemistryに論文。
Early Volcanoes Minted Nickel
ScienceNOW Daily News, 20 November 2009
→硫黄と鉄の同位体分析から、始生代のコマチアイトに関連した鉄・ニッケル硫化物鉱床における硫黄の源は、主に大気に由来することが分かった。Scienceに論文。
Planetary Science: Yes, There's Ice on the Moon—But How Much, and What Use Is It?
Science News of the week, 20 November 2009
→LCROSSの月面衝突実験で大量の水が見つかった話で、特に今後の展開について。
Astrophysics: Galactic Glare Reveals Birthplace of Cosmic Rays
Science News of the week, 20 November 2009
→銀河宇宙線を加速する場所が、星の爆発であることが確かめられた。Nature電子版とScienceに論文。
Paleontologists Find Extinction Rates Higher in Open-Ocean Settings During Mass Extinctions
ScienceDaily (Nov. 20, 2009)
→3大大量絶滅（P/T、Tr/J、K/T）は、浅海に生息する生命体よりも、外洋に面する沿岸に生息する生命体に大きな影響を与えたらしい。Scienceに論文。
Oceans' Uptake of Human-Made Carbon May Be Slowing
ScienceDaily (Nov. 19, 2009)
→海洋の観測データから計算で、海洋による人為起源CO2の吸収の履歴を復元。吸収量は1950年代以降に急速に増加しており、最近の数十年間は増加速度が少し低下していることが示された。Natureに論文。
Palaeoclimate: Kink in the thermometer
Nature News & Views, 18 November 2009
Antarctic temperature spike surprises climate researchers
Natue News, 18 November 2009
→東南極の氷の同位体組成は温暖期における気温変化に対して感度が低いらしいことが分かった。間氷期の気候のこれまでの気温の見積もりは低すぎたようだ。南極の間氷期の最高気温が、現在の気温よりも少なくとも6K高く、広く引用される3±1.5Kの約2倍であったらしい。Natureに論文。
Japanese science faces deep cuts
Nature News, 17 November 2009
Japan: Belt-Tightening Could Claim Some Scientific Scalps
Science News of the week, 20 November 2009
Japan's Scientists Fight Proposed Budget Cuts
Science Incider, 20 November 2009
→基礎科学予算に対する事業仕分けについて。日本の報道はほとんどスパコンが占めているが、ここではIODPやIFREEなども取り上げられている。
ScienceDaily (Nov. 20, 2009)
→環状ヌクレオチドが40-90℃のお湯に入れておくだけで、100個以上が連なる鎖（RNA）ができた。生命の起源にヒント？ Journal of Biological Chemistryに論文。
Early Volcanoes Minted Nickel
ScienceNOW Daily News, 20 November 2009
→硫黄と鉄の同位体分析から、始生代のコマチアイトに関連した鉄・ニッケル硫化物鉱床における硫黄の源は、主に大気に由来することが分かった。Scienceに論文。
Planetary Science: Yes, There's Ice on the Moon—But How Much, and What Use Is It?
Science News of the week, 20 November 2009
→LCROSSの月面衝突実験で大量の水が見つかった話で、特に今後の展開について。
Astrophysics: Galactic Glare Reveals Birthplace of Cosmic Rays
Science News of the week, 20 November 2009
→銀河宇宙線を加速する場所が、星の爆発であることが確かめられた。Nature電子版とScienceに論文。
Paleontologists Find Extinction Rates Higher in Open-Ocean Settings During Mass Extinctions
ScienceDaily (Nov. 20, 2009)
→3大大量絶滅（P/T、Tr/J、K/T）は、浅海に生息する生命体よりも、外洋に面する沿岸に生息する生命体に大きな影響を与えたらしい。Scienceに論文。
Oceans' Uptake of Human-Made Carbon May Be Slowing
ScienceDaily (Nov. 19, 2009)
→海洋の観測データから計算で、海洋による人為起源CO2の吸収の履歴を復元。吸収量は1950年代以降に急速に増加しており、最近の数十年間は増加速度が少し低下していることが示された。Natureに論文。
Palaeoclimate: Kink in the thermometer
Nature News & Views, 18 November 2009
Antarctic temperature spike surprises climate researchers
Natue News, 18 November 2009
→東南極の氷の同位体組成は温暖期における気温変化に対して感度が低いらしいことが分かった。間氷期の気候のこれまでの気温の見積もりは低すぎたようだ。南極の間氷期の最高気温が、現在の気温よりも少なくとも6K高く、広く引用される3±1.5Kの約2倍であったらしい。Natureに論文。
Japanese science faces deep cuts
Nature News, 17 November 2009
Japan: Belt-Tightening Could Claim Some Scientific Scalps
Science News of the week, 20 November 2009
Japan's Scientists Fight Proposed Budget Cuts
Science Incider, 20 November 2009
→基礎科学予算に対する事業仕分けについて。日本の報道はほとんどスパコンが占めているが、ここではIODPやIFREEなども取り上げられている。
新しい論文（091116-091122）
☆Nature☆
Evidence for warmer interglacials in East Antarctic ice cores
L. C. Sime, E. W. Wolff, K. I. C. Oliver & J. C. Tindall
Nature 462, 342-345 (19 November 2009) doi:10.1038/nature08564
→340kyrの3つの東南極氷床コア記録を、GCMモデリングからの入力と比べて分析すると、東南極の氷の同位体組成は温暖期における気温変化に対して感度が低いらしいことが分かった。間氷期の気候のこれまでの気温の見積もりは低すぎたようだ。南極の間氷期の最高気温が、現在の気温よりも少なくとも6K高く、広く引用される3±1.5Kの約2倍であったらしい。ひえー。
【最新論文（Nature, Science）】
Reconstruction of the history of anthropogenic CO2 concentrations in the ocean
S. Khatiwala, F. Primeau & T. Hall
Nature 462, 346-349 (19 November 2009) doi:10.1038/nature08526
→海洋の観測データから計算で、海洋による人為起源CO2の吸収の履歴を復元。吸収量は1950年代以降に急速に増加しており、最近の数十年間は増加速度が少し低下していることが示された。2008年の人為起源CO 2 の貯蓄量は140±25PgCであり、吸収速度は2.3±0.6Pg C/yrらしい。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Atmospheric Sulfur in Archean Komatiite-Hosted Nickel Deposits
Andrey Bekker, Mark E. Barley, Marco L. Fiorentini, Olivier J. Rouxel, Douglas Rumble, and Stephen W. Beresford
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1086 - 1089, DOI: 10.1126/science.1177742
→硫黄と鉄の同位体分析から、始生代のコマチアイトに関連した鉄・ニッケル硫化物鉱床における硫黄の源は、主に大気に由来することが分かった。
【最新論文（Nature, Science）】
Geophysical Detection of Relict Metasomatism from an Archean (～3.5 Ga) Subduction Zone
Chin-Wu Chen, Stephane Rondenay, Rob. L. Evans, and David B. Snyder
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1089 - 1091, DOI: 10.1126/science.1178477
→カナダのスレイブ・クラトンの地震波探査により、始生代におけるクラトン形成の原因は沈み込みであることが示唆された。つまり、プレートテクトニクスは35億年前には既にあった？
【最新論文（Nature, Science）】
Microsecond Simulations of Spontaneous Methane Hydrate Nucleation and Growth
Matthew R. Walsh, Carolyn A. Koh, E. Dendy Sloan, Amadeu K. Sum, and David T. Wu
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1095 - 1098, DOI: 10.1126/science.1174010
→氷にメタンが取り込まれ、最終的に2種類の結晶構造の混合物となる複雑なメタン水和物形成過程のシミュレーションが成功した。
【最新論文（Nature, Science）】
Aragonite Undersaturation in the Arctic Ocean: Effects of Ocean Acidification and Sea Ice Melt
Michiyo Yamamoto-Kawai, Fiona A. McLaughlin, Eddy C. Carmack, Shigeto Nishino, and Koji Shimada
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1098 - 1100, DOI: 10.1126/science.1174190
→カナダ海盆の表層海水は2008年時点でアラゴナイトに対して未飽和であった。これは予測よりかなり早い。人為起源二酸化炭素の増加に伴う海洋の酸性化に加えて近年の北極海での急激な海氷減少（融解）による影響で起きたらしい。JAMSTECからプレスリリース。
【最新論文（Nature, Science）】
Epicontinental Seas Versus Open-Ocean Settings: The Kinetics of Mass Extinction and Origination
Arnold I. Miller and Michael Foote
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1106 - 1109, DOI: 10.1126/science.1180061
→3大大量絶滅（P/T、Tr/J、K/T）は、浅海に生息する生命体よりも、外洋に面する沿岸に生息する生命体に大きな影響を与えたらしい。
【最新論文（Nature, Science）】
Symbiotic Nitrogen Fixation in the Fungus Gardens of Leaf-Cutter Ants
Adrian A. Pinto-Tomas, Mark A. Anderson, Garret Suen, David M. Stevenson, Fiona S. T. Chu, W. Wallace Cleland, Paul J. Weimer, and Cameron R. Currie
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1120 - 1123, DOI: 10.1126/science.1173036
→アセチレン還元法や15-N2ラベル実験から、ハキリアリは窒素固定細菌と相利共生していることが分かった。亜熱帯生態系における意外な窒素ソース。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Proceedings of the National Academy of Sciences☆
Sodium shortage as a constraint on the carbon cycle in an inland tropical rainforest
Michael Kaspari, Stephen P. Yanoviak, Robert Dudley, May Yuan, and Natalie A. Clay
PNAS 2009 106:19405-19409; published online November 2, 2009, doi:10.1073/pnas.0906448106
→内陸の熱帯雨林では、ナトリウムが有機物分解の制限因子になっているらしく、炭素循環に重要。
【最新論文（地球科学系）】
Nitrogen recycling and nutritional provisioning by Blattabacterium, the cockroach endosymbiont
Zakee L. Sabree, Srinivas Kambhampati, and Nancy A. Moran
PNAS 2009 106:19521-19526; published online before print October 30, 2009, doi:10.1073/pnas.0907504106
→ゴキブリの体内共生細菌、Blattabacteriumのゲノムを解析した結果、この細菌はゴキブリの体の老廃物窒素を、アミノ酸やビタミンに変換していることが明らかになった。細菌たちのおかげで、ゴキブリは排尿する必要さえないという。ゴキブリすごいな。。。
【最新論文（生物系）】
☆Applied and Environmental Microbiology☆
CO Dehydrogenase Genes Found in Metagenomic Fosmid Clones from the Deep Mediterranean Sea
Ana-Belen Martin-Cuadrado, Rohit Ghai, Aitor Gonzaga, and Francisco Rodriguez-Valera
Applied and Environmental Microbiology, December 2009, p. 7436-7444, Vol. 75, No. 23, doi:10.1128/AEM.01283-09
→地中海深海のメタゲノムデータに、一酸化炭素代謝の鍵酵素の遺伝子が見つかった。現場の一酸化炭素の濃度や起源などは分からないらしいが、地熱由来？
【最新論文（生物系）】
Phylogenetic Diversity and Metabolic Potential Revealed in a Glacier Ice Metagenome
Carola Simon, Arnim Wiezer, Axel W. Strittmatter and Rolf Daniel
Applied and Environmental Microbiology, December 2009, p. 7519-7526, Vol. 75, No. 23, doi:10.1128/AEM.00946-09
→ドイツの氷河のメタゲノム解析から、系統的多様性・代謝ポテンシャルを調べた。
【最新論文（生物系）】
Distribution and Diversity of Archaeal and Bacterial Ammonia Oxidizers in Salt Marsh Sediments
Nicole S. Moin, Katelyn A. Nelson, Alexander Bush, and Anne E. Bernhard
Applied and Environmental Microbiology, December 2009, p. 7461-7468, Vol. 75, No. 23, doi:10.1128/AEM.01001-09
→ニューイングランドのsalt march堆積物で、アンモニア酸化バクテリア・アーキアの分布・多様性を調べた。アーキアたくさんいるらしい。
【最新論文（生物系）】
Evidence for warmer interglacials in East Antarctic ice cores
L. C. Sime, E. W. Wolff, K. I. C. Oliver & J. C. Tindall
Nature 462, 342-345 (19 November 2009) doi:10.1038/nature08564
→340kyrの3つの東南極氷床コア記録を、GCMモデリングからの入力と比べて分析すると、東南極の氷の同位体組成は温暖期における気温変化に対して感度が低いらしいことが分かった。間氷期の気候のこれまでの気温の見積もりは低すぎたようだ。南極の間氷期の最高気温が、現在の気温よりも少なくとも6K高く、広く引用される3±1.5Kの約2倍であったらしい。ひえー。
【最新論文（Nature, Science）】
Reconstruction of the history of anthropogenic CO2 concentrations in the ocean
S. Khatiwala, F. Primeau & T. Hall
Nature 462, 346-349 (19 November 2009) doi:10.1038/nature08526
→海洋の観測データから計算で、海洋による人為起源CO2の吸収の履歴を復元。吸収量は1950年代以降に急速に増加しており、最近の数十年間は増加速度が少し低下していることが示された。2008年の人為起源CO 2 の貯蓄量は140±25PgCであり、吸収速度は2.3±0.6Pg C/yrらしい。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Atmospheric Sulfur in Archean Komatiite-Hosted Nickel Deposits
Andrey Bekker, Mark E. Barley, Marco L. Fiorentini, Olivier J. Rouxel, Douglas Rumble, and Stephen W. Beresford
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1086 - 1089, DOI: 10.1126/science.1177742
→硫黄と鉄の同位体分析から、始生代のコマチアイトに関連した鉄・ニッケル硫化物鉱床における硫黄の源は、主に大気に由来することが分かった。
【最新論文（Nature, Science）】
Geophysical Detection of Relict Metasomatism from an Archean (～3.5 Ga) Subduction Zone
Chin-Wu Chen, Stephane Rondenay, Rob. L. Evans, and David B. Snyder
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1089 - 1091, DOI: 10.1126/science.1178477
→カナダのスレイブ・クラトンの地震波探査により、始生代におけるクラトン形成の原因は沈み込みであることが示唆された。つまり、プレートテクトニクスは35億年前には既にあった？
【最新論文（Nature, Science）】
Microsecond Simulations of Spontaneous Methane Hydrate Nucleation and Growth
Matthew R. Walsh, Carolyn A. Koh, E. Dendy Sloan, Amadeu K. Sum, and David T. Wu
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1095 - 1098, DOI: 10.1126/science.1174010
→氷にメタンが取り込まれ、最終的に2種類の結晶構造の混合物となる複雑なメタン水和物形成過程のシミュレーションが成功した。
【最新論文（Nature, Science）】
Aragonite Undersaturation in the Arctic Ocean: Effects of Ocean Acidification and Sea Ice Melt
Michiyo Yamamoto-Kawai, Fiona A. McLaughlin, Eddy C. Carmack, Shigeto Nishino, and Koji Shimada
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1098 - 1100, DOI: 10.1126/science.1174190
→カナダ海盆の表層海水は2008年時点でアラゴナイトに対して未飽和であった。これは予測よりかなり早い。人為起源二酸化炭素の増加に伴う海洋の酸性化に加えて近年の北極海での急激な海氷減少（融解）による影響で起きたらしい。JAMSTECからプレスリリース。
【最新論文（Nature, Science）】
Epicontinental Seas Versus Open-Ocean Settings: The Kinetics of Mass Extinction and Origination
Arnold I. Miller and Michael Foote
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1106 - 1109, DOI: 10.1126/science.1180061
→3大大量絶滅（P/T、Tr/J、K/T）は、浅海に生息する生命体よりも、外洋に面する沿岸に生息する生命体に大きな影響を与えたらしい。
【最新論文（Nature, Science）】
Symbiotic Nitrogen Fixation in the Fungus Gardens of Leaf-Cutter Ants
Adrian A. Pinto-Tomas, Mark A. Anderson, Garret Suen, David M. Stevenson, Fiona S. T. Chu, W. Wallace Cleland, Paul J. Weimer, and Cameron R. Currie
Science 20 November 2009: Vol. 326. no. 5956, pp. 1120 - 1123, DOI: 10.1126/science.1173036
→アセチレン還元法や15-N2ラベル実験から、ハキリアリは窒素固定細菌と相利共生していることが分かった。亜熱帯生態系における意外な窒素ソース。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Proceedings of the National Academy of Sciences☆
Sodium shortage as a constraint on the carbon cycle in an inland tropical rainforest
Michael Kaspari, Stephen P. Yanoviak, Robert Dudley, May Yuan, and Natalie A. Clay
PNAS 2009 106:19405-19409; published online November 2, 2009, doi:10.1073/pnas.0906448106
→内陸の熱帯雨林では、ナトリウムが有機物分解の制限因子になっているらしく、炭素循環に重要。
【最新論文（地球科学系）】
Nitrogen recycling and nutritional provisioning by Blattabacterium, the cockroach endosymbiont
Zakee L. Sabree, Srinivas Kambhampati, and Nancy A. Moran
PNAS 2009 106:19521-19526; published online before print October 30, 2009, doi:10.1073/pnas.0907504106
→ゴキブリの体内共生細菌、Blattabacteriumのゲノムを解析した結果、この細菌はゴキブリの体の老廃物窒素を、アミノ酸やビタミンに変換していることが明らかになった。細菌たちのおかげで、ゴキブリは排尿する必要さえないという。ゴキブリすごいな。。。
【最新論文（生物系）】
☆Applied and Environmental Microbiology☆
CO Dehydrogenase Genes Found in Metagenomic Fosmid Clones from the Deep Mediterranean Sea
Ana-Belen Martin-Cuadrado, Rohit Ghai, Aitor Gonzaga, and Francisco Rodriguez-Valera
Applied and Environmental Microbiology, December 2009, p. 7436-7444, Vol. 75, No. 23, doi:10.1128/AEM.01283-09
→地中海深海のメタゲノムデータに、一酸化炭素代謝の鍵酵素の遺伝子が見つかった。現場の一酸化炭素の濃度や起源などは分からないらしいが、地熱由来？
【最新論文（生物系）】
Phylogenetic Diversity and Metabolic Potential Revealed in a Glacier Ice Metagenome
Carola Simon, Arnim Wiezer, Axel W. Strittmatter and Rolf Daniel
Applied and Environmental Microbiology, December 2009, p. 7519-7526, Vol. 75, No. 23, doi:10.1128/AEM.00946-09
→ドイツの氷河のメタゲノム解析から、系統的多様性・代謝ポテンシャルを調べた。
【最新論文（生物系）】
Distribution and Diversity of Archaeal and Bacterial Ammonia Oxidizers in Salt Marsh Sediments
Nicole S. Moin, Katelyn A. Nelson, Alexander Bush, and Anne E. Bernhard
Applied and Environmental Microbiology, December 2009, p. 7461-7468, Vol. 75, No. 23, doi:10.1128/AEM.01001-09
→ニューイングランドのsalt march堆積物で、アンモニア酸化バクテリア・アーキアの分布・多様性を調べた。アーキアたくさんいるらしい。
【最新論文（生物系）】
2009年11月20日金曜日
第8回ニューイヤースクールのお知らせ
今年度から、毎年年初に開催される
「地球システム・地球進化ニューイヤースクール」の
事務局に参加しています。
第8回の参加者を募っていますので、ここでも宣伝。
代々木の国立オリンピック記念青少年総合センターで、
2010年1月9-10日に開催されます。
今年のテーマは「地球を旅する水の科学」。
なかなか豪華な講師陣が揃ったのではないでしょうか。
皆様、ぜひぜひご参加ください。
詳細はこちら。参加登録はこちら。
ちなみに僕は、鍵先生と泊さんの担当と
レクチャーノート編集担当をやっています。
＜プログラム＞（敬称略、タイトルは変更の可能性あり）
2010年1月9日（土）
10:00～ 受付開始
10:30～ 講演開始
【通常講義】
・惑星の水
杉田 精司 教授（東京大学大学院・新領域創成科学研究科・複雑理工学専攻）
「火星探査が明かす火星表層環境の初期進化」
・固体地球深部の水
鍵 裕之 准教授（東京大学大学院・理学系研究科・地殻化学実験施設）
「光と中性子で探る、地球深部物質中の水の正体」
・熱水と生命
浦辺 徹郎 教授（東京大学 大学院理学系研究科）
「（仮）化学地質学・鉱床学・海底熱水活動・微生物圏地圏相互作用」
【Ex レクチャー】
・須藤 斎 助教（名古屋大学大学院・環境学研究科）
「子供向けの本を書く ～わかりやすく研究を伝える～」
・大木聖子 助教（東京大学・地震研究所・アウトリーチ推進室）
「地球科学研究者のLiberal Arts」
15:50～ グループワークによる議論
18:00～20:00 懇親会
1月10日（日）
09:00～ 講演開始
【通常レクチャー】
・水と災害
後藤 和久 助教（東北大学大学院・工学研究科・附属災害制御研究センター）
「沿岸巨礫群‐堆積学のラストフロンティアから挑む沿岸波浪災害‐」
・現代の海洋・大気循環
小橋 史明 准教授（東京海洋大学 海洋工学部）
「北太平洋の表層循環と大気海洋相互作用」
・過去の氷床・気候変動
川村 賢二 助教（国立極地研究所・研究教育系気水圏研究グループ）
「（仮）氷床コア気体分析、古気候・古環境復元」
【Ex レクチャー】
・萩谷 宏 准教授（東京都市大学 知識工学部 自然科学科 ）
「自然科学科の立ち上げ －いまこそ博物学の時代をつくろう」
・千葉達朗 氏（アジア航測株式会社プロジェクト推進室技師長 理事・フェロー）
「赤色立体地図とは～一枚で立体的に見える地形表現法の発想～」
・泊 次郎 博士（東京大学・地震研究所・研究生）
「科学記者から地球科学史研究へ」
15:10～ グループワークによる議論
17:10 閉会挨拶
「地球システム・地球進化ニューイヤースクール」の
事務局に参加しています。
第8回の参加者を募っていますので、ここでも宣伝。
代々木の国立オリンピック記念青少年総合センターで、
2010年1月9-10日に開催されます。
今年のテーマは「地球を旅する水の科学」。
なかなか豪華な講師陣が揃ったのではないでしょうか。
皆様、ぜひぜひご参加ください。
詳細はこちら。参加登録はこちら。
ちなみに僕は、鍵先生と泊さんの担当と
レクチャーノート編集担当をやっています。
＜プログラム＞（敬称略、タイトルは変更の可能性あり）
2010年1月9日（土）
10:00～ 受付開始
10:30～ 講演開始
【通常講義】
・惑星の水
杉田 精司 教授（東京大学大学院・新領域創成科学研究科・複雑理工学専攻）
「火星探査が明かす火星表層環境の初期進化」
・固体地球深部の水
鍵 裕之 准教授（東京大学大学院・理学系研究科・地殻化学実験施設）
「光と中性子で探る、地球深部物質中の水の正体」
・熱水と生命
浦辺 徹郎 教授（東京大学 大学院理学系研究科）
「（仮）化学地質学・鉱床学・海底熱水活動・微生物圏地圏相互作用」
【Ex レクチャー】
・須藤 斎 助教（名古屋大学大学院・環境学研究科）
「子供向けの本を書く ～わかりやすく研究を伝える～」
・大木聖子 助教（東京大学・地震研究所・アウトリーチ推進室）
「地球科学研究者のLiberal Arts」
15:50～ グループワークによる議論
18:00～20:00 懇親会
1月10日（日）
09:00～ 講演開始
【通常レクチャー】
・水と災害
後藤 和久 助教（東北大学大学院・工学研究科・附属災害制御研究センター）
「沿岸巨礫群‐堆積学のラストフロンティアから挑む沿岸波浪災害‐」
・現代の海洋・大気循環
小橋 史明 准教授（東京海洋大学 海洋工学部）
「北太平洋の表層循環と大気海洋相互作用」
・過去の氷床・気候変動
川村 賢二 助教（国立極地研究所・研究教育系気水圏研究グループ）
「（仮）氷床コア気体分析、古気候・古環境復元」
【Ex レクチャー】
・萩谷 宏 准教授（東京都市大学 知識工学部 自然科学科 ）
「自然科学科の立ち上げ －いまこそ博物学の時代をつくろう」
・千葉達朗 氏（アジア航測株式会社プロジェクト推進室技師長 理事・フェロー）
「赤色立体地図とは～一枚で立体的に見える地形表現法の発想～」
・泊 次郎 博士（東京大学・地震研究所・研究生）
「科学記者から地球科学史研究へ」
15:10～ グループワークによる議論
17:10 閉会挨拶
2009年11月17日火曜日
新しい論文（091109-091115）
☆Nature☆
Enhanced lithium depletion in Sun-like stars with orbiting planetsGarik Israelian, Elisa Delgado Mena, Nuno C. Santos, Sergio G. Sousa, Michel Mayor, Stephane Udry, Carolina Domínguez Cerdeña, Rafael Rebolo & Sofia Randich
Nature 462, 189-191 (12 November 2009) doi:10.1038/nature08483→惑星を有する恒星には、原始リチウム量の1％以下しか存在していないのに対して、惑星が発見されていない太陽類似星の約50％には、平均的に10倍以上の量のリチウムが存在していることがわかった。リチウム枯渇が系外惑星探索に有用なツールになる？
【最新論文（Nature, Science）】
Oxygen and hydrogen isotope evidence for a temperate climate 3.42 billion years ago
M. T. Hren, M. M. Tice & C. P. Chamberlain
Nature 462, 205-208 (12 November 2009) doi:10.1038/nature08518
→34.2億年前のチャートの酸素・水素同位体の分析によると、古始生代の海洋が、現代の海洋に比べて同位体が枯渇しており、これまでに酸素同位体だけから見積もられてきた海水温（55-85℃）よりもずっと低温で40℃以下だったらしい。
【先カンブリア紀2】
☆Science☆
Global Observations of the Interstellar Interaction from the Interstellar Boundary Explorer (IBEX)
D. J. McComas, F. Allegrini, P. Bochsler, M. Bzowski, E. R. Christian, G. B. Crew, R. DeMajistre, H. Fahr, H. Fichtner, P. C. Frisch, H. O. Funsten, S. A. Fuselier, G. Gloeckler, M. Gruntman, J. Heerikhuisen, V. Izmodenov, P. Janzen, P. Knappenberger, S. Krimigis, H. Kucharek, M. Lee, G. Livadiotis, S. Livi, R. J. MacDowall, D. Mitchell, E. Mobius, T. Moore, N. V. Pogorelov, D. Reisenfeld, E. Roelof, L. Saul, N. A. Schwadron, P. W. Valek, R. Vanderspek, P. Wurz, and G. P. Zank
Science 13 November 2009: Vol. 326. no. 5955, pp. 959 - 962, DOI: 10.1126/science.1180906ほか論文５本
→最近打ち上げられた太陽圏観測衛星（IBEX）により、太陽圏と星間物質との相互作用に関する驚くべき特徴（太陽風と近傍の星間物質とが相互作用する領域の大規模構造）が明らかになった。つまり、太陽系外の銀河環境が太陽圏に大きな影響を与える。宇宙線とか。
【最新論文（Nature, Science）】
Partitioning Recent Greenland Mass Loss
Michiel van den Broeke, Jonathan Bamber, Janneke Ettema, Eric Rignot, Ernst Schrama, Willem Jan van de Berg, Erik van Meijgaard, Isabella Velicogna, and Bert Wouters
Science 13 November 2009: Vol. 326. no. 5955, pp. 984 - 986, DOI: 10.1126/science.1178176→グリーンランド氷床の質量減少に寄与する主な区分について定量化が実現した。質量損失の計算に2つの異なる手法（表面質量収支・氷の流出量とGRACE衛星重力データ利用）を用いて一致した。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Nature Geosciences☆
Nitrogen-enhanced greenhouse warming on early EarthColin Goldblatt, Mark W. Claire, Timothy M. Lenton, Adrian J. Matthews, Andrew J. Watson & Kevin J. Zahnle
Nature Geoscience, Published online: 15 November 2009 doi:10.1038/ngeo692
→「暗い太陽のパラドックス」を解決する手段として、大気窒素ガス分圧が高かったことを提唱。現在の2倍と見積もってモデル計算すると、温室効果ガスの吸収幅を広げる効果により、4.4℃の温室効果が得られた。現在は、地殻やマントルに入っているらしい。
【先カンブリア紀2】
A seafloor microbial biome hosted within incipient ferromanganese crustsA. S. Templeton, E. J. Knowles, D. L. Eldridge, B. W. Arey, A. C. Dohnalkova, S. M. Webb, B. E. Bailey, B. M. Tebo & H. Staudigel
Nature Geoscience, Published online: 15 November 2009 doi:10.1038/ngeo696
→「海底火山岩に巣食う微生物のエネルギー源が、海水中成分の酸化による」という仮説をテストするため、シンクロトンＸ線で分析。岩（玄武岩）の溶解は少なく、海水からのFe(III)、Mn(IV)酸化物の沈着が見られたので、やはり海水中成分（地殻流体起源？）の酸化がエネルギー源らしい。
【地下生物圏2】
☆Global Biogeochemical Cycles☆
Carbon and hydrogen isotopic composition of methane over the last 1000 yearsMischler, J. A., T. A. Sowers, R. B. Alley, M. Battle, J. R. McConnell, L. Mitchell, T. Popp, E. Sofen, and M. K. Spencer
Global Biogeochem. Cycles, published 13 November 2009, 23, GB4024, doi:10.1029/2009GB003460.→南極氷床コアのメタンの炭素・水素同位体組成を、過去1000年分を分析。産業革命前から人間活動の影響が見られるらしい。バイオマス燃焼による寄与は減ってきて、農業由来の寄与が増加。
【最新論文（地球科学系）】
☆Geobiology☆
Analysis of hopanes and steranes in single oil-bearing fluid inclusions using time-of-flight secondary ion mass spectrometry (ToF-SIMS)S. SILJESTRÖM, J. LAUSMAA, P. SJÖVALL, C. BROMAN, V. THIEL AND T. HODE
Geobiology, Published Online: 11 Nov 2009, DOI:10.1111/j.1472-4669.2009.00223.x→堆積岩中の、石油を含む流体包有物の1個1個（直径15-30um、ピコリットル）を、TOF-SIMSで分析し、ホパンやステランを検出。
【最新論文（地球科学系）】
☆Organic Geochemistry☆
Molecular signature of the Neoproterozoic Acraman impact event
Hallmann, C.O.E., Grey, K., Webster, L.J., McKirdy, D.M., Grice, K.,
Organic Geochemistry (2009), Available online 11 November 2009, doi: 10.1016/j.orggeochem.2009.11.007→エディアカラ紀のAcraman衝突イベントで形成された堆積物を分析すると、PAH（コロネン）を大量に検出。炭素同位体組成の負のエクスカーションと一致することから、衝突イベントでバイオマス燃焼した？
【最新論文（地球科学系）】
Enhanced lithium depletion in Sun-like stars with orbiting planetsGarik Israelian, Elisa Delgado Mena, Nuno C. Santos, Sergio G. Sousa, Michel Mayor, Stephane Udry, Carolina Domínguez Cerdeña, Rafael Rebolo & Sofia Randich
Nature 462, 189-191 (12 November 2009) doi:10.1038/nature08483→惑星を有する恒星には、原始リチウム量の1％以下しか存在していないのに対して、惑星が発見されていない太陽類似星の約50％には、平均的に10倍以上の量のリチウムが存在していることがわかった。リチウム枯渇が系外惑星探索に有用なツールになる？
【最新論文（Nature, Science）】
Oxygen and hydrogen isotope evidence for a temperate climate 3.42 billion years ago
M. T. Hren, M. M. Tice & C. P. Chamberlain
Nature 462, 205-208 (12 November 2009) doi:10.1038/nature08518
→34.2億年前のチャートの酸素・水素同位体の分析によると、古始生代の海洋が、現代の海洋に比べて同位体が枯渇しており、これまでに酸素同位体だけから見積もられてきた海水温（55-85℃）よりもずっと低温で40℃以下だったらしい。
【先カンブリア紀2】
☆Science☆
Global Observations of the Interstellar Interaction from the Interstellar Boundary Explorer (IBEX)
D. J. McComas, F. Allegrini, P. Bochsler, M. Bzowski, E. R. Christian, G. B. Crew, R. DeMajistre, H. Fahr, H. Fichtner, P. C. Frisch, H. O. Funsten, S. A. Fuselier, G. Gloeckler, M. Gruntman, J. Heerikhuisen, V. Izmodenov, P. Janzen, P. Knappenberger, S. Krimigis, H. Kucharek, M. Lee, G. Livadiotis, S. Livi, R. J. MacDowall, D. Mitchell, E. Mobius, T. Moore, N. V. Pogorelov, D. Reisenfeld, E. Roelof, L. Saul, N. A. Schwadron, P. W. Valek, R. Vanderspek, P. Wurz, and G. P. Zank
Science 13 November 2009: Vol. 326. no. 5955, pp. 959 - 962, DOI: 10.1126/science.1180906ほか論文５本
→最近打ち上げられた太陽圏観測衛星（IBEX）により、太陽圏と星間物質との相互作用に関する驚くべき特徴（太陽風と近傍の星間物質とが相互作用する領域の大規模構造）が明らかになった。つまり、太陽系外の銀河環境が太陽圏に大きな影響を与える。宇宙線とか。
【最新論文（Nature, Science）】
Partitioning Recent Greenland Mass Loss
Michiel van den Broeke, Jonathan Bamber, Janneke Ettema, Eric Rignot, Ernst Schrama, Willem Jan van de Berg, Erik van Meijgaard, Isabella Velicogna, and Bert Wouters
Science 13 November 2009: Vol. 326. no. 5955, pp. 984 - 986, DOI: 10.1126/science.1178176→グリーンランド氷床の質量減少に寄与する主な区分について定量化が実現した。質量損失の計算に2つの異なる手法（表面質量収支・氷の流出量とGRACE衛星重力データ利用）を用いて一致した。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Nature Geosciences☆
Nitrogen-enhanced greenhouse warming on early EarthColin Goldblatt, Mark W. Claire, Timothy M. Lenton, Adrian J. Matthews, Andrew J. Watson & Kevin J. Zahnle
Nature Geoscience, Published online: 15 November 2009 doi:10.1038/ngeo692
→「暗い太陽のパラドックス」を解決する手段として、大気窒素ガス分圧が高かったことを提唱。現在の2倍と見積もってモデル計算すると、温室効果ガスの吸収幅を広げる効果により、4.4℃の温室効果が得られた。現在は、地殻やマントルに入っているらしい。
【先カンブリア紀2】
A seafloor microbial biome hosted within incipient ferromanganese crustsA. S. Templeton, E. J. Knowles, D. L. Eldridge, B. W. Arey, A. C. Dohnalkova, S. M. Webb, B. E. Bailey, B. M. Tebo & H. Staudigel
Nature Geoscience, Published online: 15 November 2009 doi:10.1038/ngeo696
→「海底火山岩に巣食う微生物のエネルギー源が、海水中成分の酸化による」という仮説をテストするため、シンクロトンＸ線で分析。岩（玄武岩）の溶解は少なく、海水からのFe(III)、Mn(IV)酸化物の沈着が見られたので、やはり海水中成分（地殻流体起源？）の酸化がエネルギー源らしい。
【地下生物圏2】
☆Global Biogeochemical Cycles☆
Carbon and hydrogen isotopic composition of methane over the last 1000 yearsMischler, J. A., T. A. Sowers, R. B. Alley, M. Battle, J. R. McConnell, L. Mitchell, T. Popp, E. Sofen, and M. K. Spencer
Global Biogeochem. Cycles, published 13 November 2009, 23, GB4024, doi:10.1029/2009GB003460.→南極氷床コアのメタンの炭素・水素同位体組成を、過去1000年分を分析。産業革命前から人間活動の影響が見られるらしい。バイオマス燃焼による寄与は減ってきて、農業由来の寄与が増加。
【最新論文（地球科学系）】
☆Geobiology☆
Analysis of hopanes and steranes in single oil-bearing fluid inclusions using time-of-flight secondary ion mass spectrometry (ToF-SIMS)S. SILJESTRÖM, J. LAUSMAA, P. SJÖVALL, C. BROMAN, V. THIEL AND T. HODE
Geobiology, Published Online: 11 Nov 2009, DOI:10.1111/j.1472-4669.2009.00223.x→堆積岩中の、石油を含む流体包有物の1個1個（直径15-30um、ピコリットル）を、TOF-SIMSで分析し、ホパンやステランを検出。
【最新論文（地球科学系）】
☆Organic Geochemistry☆
Molecular signature of the Neoproterozoic Acraman impact event
Hallmann, C.O.E., Grey, K., Webster, L.J., McKirdy, D.M., Grice, K.,
Organic Geochemistry (2009), Available online 11 November 2009, doi: 10.1016/j.orggeochem.2009.11.007→エディアカラ紀のAcraman衝突イベントで形成された堆積物を分析すると、PAH（コロネン）を大量に検出。炭素同位体組成の負のエクスカーションと一致することから、衝突イベントでバイオマス燃焼した？
【最新論文（地球科学系）】
科学ニュース（091109-091115）
Keeping the young Earth cosy
Nature News, 15 November 2009
→太古代の気温を保持していたのは、大気中の窒素ガスの分圧だった？ Nature Geoscienceに論文。
The Moon Is Wet!
ScienceNOW Daily News, 13 November 2009
Lunar impact tosses up water and stranger stuff
Nature News, 13 November 2009
→LCROSSの月面衝突実験で、大量の水が検出された。NASAが発表。
Ocean Science: Photosynthesis in the Open Ocean
Science Perspectives, 13 November 2009
→外洋では、強い光と少ない栄養分に適応するため、光合成でPTOXを使った代謝が回り始め、CO2固定とO2発生が必ずしも一緒になっていない。シアノバクテリアにも、真核藻類にもある。これは重要そうな雰囲気なので、ちゃんと調べてみようかな。
Two Earth-sized Bodies With Oxygen Rich Atmospheres Found, But They're Stars Not Planets
ScienceDaily (Nov. 12, 2009)
→地球の2倍のサイズで酸素大気を持つ星が見つかったが、残念ながら惑星ではなく白色矮星。Science電子版に論文。
How Much Water Does The Ocean Have?
ScienceDaily (Nov. 12, 2009)
→海水の量の変動を見積もることに初めて成功。気候モデル改善に重要らしい。Journal of Geophysical Researchに論文。
Earth's Early Ocean Cooled More Than A Billion Years Earlier Than Thought
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→34.2億年前のチャートの酸素・水素同位体の分析によると、古始生代の海洋が、現代の海洋に比べて同位体が枯渇しており、これまでに酸素同位体だけから見積もられてきた海水温（55-85℃）よりもずっと低温で40℃以下だったらしい。Natureに論文。
Lithium loss may be the planet-hunter's gain
Nature News, 11 November 2009
Astrophysics: A fossil record for exoplanets
Nature News & Views, 11 November 2009
Exoplanets Clue To Sun's Curious Chemistry
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→惑星を有する恒星には、原始リチウム量の1％以下しか存在していないのに対して、惑星が発見されていない太陽類似星の約50％には、平均的に10倍以上の量のリチウムが存在していることがわかった。リチウム枯渇が系外惑星探索に有用なツールになる？ Natureに論文。
Are Earth's Oceans Made Of Extraterrestrial Material?
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→地球型惑星は基本的に乾燥しており、水を含んだ物質の集積を通して初めて揮発性元素を獲得したらしい。Natureに論文。
Controversial New Climate Change Data: Is Earth's Capacity To Absorb CO2 Much Greater Than Expected?
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→陸域と海洋による二酸化炭素吸収量は従来推定より大きくて、吸収スピードは1850年から変わっていない？ Geophysical Research Lettersに論文。
Antarctica Glacier Retreat Creates New Carbon Dioxide Store; Has Beneficial Impact On Climate Change
ScienceDaily (Nov. 10, 2009)
→南極半島で氷床が融けたことで、植物プランクトンが大発生するようになり、二酸化炭素のシンクになっているらしい。Global Change Biologyに論文。
Nitrogen Loss Threatens Desert Plant Life, Study Shows
ScienceDaily (Nov. 9, 2009)
→50℃以上になる砂漠表面では、窒素化合物が無機的に反応してガス化して失われているらしい（従来は微生物による代謝が主に行うとされた）。Scienceに論文。
Mars rover plans its escape
Nature News, 5 November 2009
→火星ローバーSpiritが、火星土壌に足を取られて6カ月経つが、脱出を試みるらしい。
Nature News, 15 November 2009
→太古代の気温を保持していたのは、大気中の窒素ガスの分圧だった？ Nature Geoscienceに論文。
The Moon Is Wet!
ScienceNOW Daily News, 13 November 2009
Lunar impact tosses up water and stranger stuff
Nature News, 13 November 2009
→LCROSSの月面衝突実験で、大量の水が検出された。NASAが発表。
Ocean Science: Photosynthesis in the Open Ocean
Science Perspectives, 13 November 2009
→外洋では、強い光と少ない栄養分に適応するため、光合成でPTOXを使った代謝が回り始め、CO2固定とO2発生が必ずしも一緒になっていない。シアノバクテリアにも、真核藻類にもある。これは重要そうな雰囲気なので、ちゃんと調べてみようかな。
Two Earth-sized Bodies With Oxygen Rich Atmospheres Found, But They're Stars Not Planets
ScienceDaily (Nov. 12, 2009)
→地球の2倍のサイズで酸素大気を持つ星が見つかったが、残念ながら惑星ではなく白色矮星。Science電子版に論文。
How Much Water Does The Ocean Have?
ScienceDaily (Nov. 12, 2009)
→海水の量の変動を見積もることに初めて成功。気候モデル改善に重要らしい。Journal of Geophysical Researchに論文。
Earth's Early Ocean Cooled More Than A Billion Years Earlier Than Thought
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→34.2億年前のチャートの酸素・水素同位体の分析によると、古始生代の海洋が、現代の海洋に比べて同位体が枯渇しており、これまでに酸素同位体だけから見積もられてきた海水温（55-85℃）よりもずっと低温で40℃以下だったらしい。Natureに論文。
Lithium loss may be the planet-hunter's gain
Nature News, 11 November 2009
Astrophysics: A fossil record for exoplanets
Nature News & Views, 11 November 2009
Exoplanets Clue To Sun's Curious Chemistry
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→惑星を有する恒星には、原始リチウム量の1％以下しか存在していないのに対して、惑星が発見されていない太陽類似星の約50％には、平均的に10倍以上の量のリチウムが存在していることがわかった。リチウム枯渇が系外惑星探索に有用なツールになる？ Natureに論文。
Are Earth's Oceans Made Of Extraterrestrial Material?
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→地球型惑星は基本的に乾燥しており、水を含んだ物質の集積を通して初めて揮発性元素を獲得したらしい。Natureに論文。
Controversial New Climate Change Data: Is Earth's Capacity To Absorb CO2 Much Greater Than Expected?
ScienceDaily (Nov. 11, 2009)
→陸域と海洋による二酸化炭素吸収量は従来推定より大きくて、吸収スピードは1850年から変わっていない？ Geophysical Research Lettersに論文。
Antarctica Glacier Retreat Creates New Carbon Dioxide Store; Has Beneficial Impact On Climate Change
ScienceDaily (Nov. 10, 2009)
→南極半島で氷床が融けたことで、植物プランクトンが大発生するようになり、二酸化炭素のシンクになっているらしい。Global Change Biologyに論文。
Nitrogen Loss Threatens Desert Plant Life, Study Shows
ScienceDaily (Nov. 9, 2009)
→50℃以上になる砂漠表面では、窒素化合物が無機的に反応してガス化して失われているらしい（従来は微生物による代謝が主に行うとされた）。Scienceに論文。
Mars rover plans its escape
Nature News, 5 November 2009
→火星ローバーSpiritが、火星土壌に足を取られて6カ月経つが、脱出を試みるらしい。
2009年11月12日木曜日
集めた論文の覚書 ［アルカリ度と有機物］ Literature Review [Alkalinity & organic matter]
11/4の海洋研の地球環境セミナーで、10/20に見つけた論文（Kim and Lee, 2009）を紹介するために読んだ論文リスト。
セミナーには炭酸塩を研究している人が多いので、「炭酸系化学と有機地球化学の接点」というテーマで選んだ論文でしたが、そもそもアルカリ度が何たるかを分かっていなかったので、結構苦労しました。その分、海洋の炭酸系化学の基礎が、今更ですが分かってきた気がします。
Estimating the contribution of organic bases from microalgae to the titration alkalinity in coastal seawaters
J. Martín Hernández-Ayon, Alberto Zirino, A. G. Dickson Tania Camiro-Vargas & Valenzuela, E.
Limnol. Oceanogr. Methods, 2007, Vol.5, 225-23
→海生大型藻類を培養して、海水アルカリ度に関して、滴定による測定値と、他のパラメータからの計算値を比較すると、培養日数とともに差が拡大（最大で約800umol/kg！）。有機塩基のせい？ 沿岸域の海水でも、測定値と計算値に有意な差あり（約50-200 umol/kg）。
Estimating the organic acid contribution to coastal seawater alkalinity by potentiometric titrations in a closed cell
François L.L. Muller, and Bjørn Bleie
Analytica Chimica Acta, Volume 619, Issue 2, 7 July 2008, Pages 183-191, doi:10.1016/j.aca.2008.05.018
→ノルウェーのフィヨルドで、滴定による海水アルカリ度測定値と、他のパラメータからの計算値を比較し、“有機物アルカリ度”を見積もり。むしろ、DOMのダイナミクス解明に役立つ？
Contribution of phytoplankton and bacterial cells to the measured alkalinity of seawater
Kim, Hyun-Cheol, Kitack Lee, and Wonyong Choi
Limnol. Oceanogr., 51(1), 2006, 331-338
→粒子状有機物（POM；植物プランクトンやバクテリアの細胞など）が、海水の全アルカリ度に、多少寄与しているかも。
Calcium carbonate budget in the Atlantic Ocean based on water column inorganic carbon chemistry
Chung, S.-N., K. Lee, R. A. Feely, C. L. Sabine, F. J. Millero, R. Wanninkhof, J. L. Bullister, R. M. Key, and T.-H. Peng
Global Biogeochem. Cycles (2003) 17(4), 1093, doi:10.1029/2002GB002001.
→大西洋における炭酸塩の溶解度のbasinスケール分布を、海水アルカリ度の変化から推定。炭酸塩生産量の31%にあたる、年間11.1×10^12molCが溶解しているようだ。
An updated anthropogenic CO2 inventory in the Atlantic Ocean
K. Lee, S.-D. Choi, G.-H. Park, R. Wanninkhof, T.-H. Peng, R. M. Key, C. L. Sabine, R. A. Feely, J. L. Bullister, F. J. Millero, and Alex Kozyr
Global Biogeochem. Cycles (2003) 17(4), 1116, doi:10.1029/2003GB002067.
→海水のDICとアルカリ度などから、Gruber et al. (1996)で導入された複雑な計算を介して、人為起源CO2が大西洋海水に溶けている量を推定。太平洋・インド洋のデータも合わせると、産業革命以後、海は人為起源CO2の29%にあたる112±17PgCを吸収したらしい。
Impact of Anthropogenic CO2 on the CaCO3 System in the Oceans
Richard A. Feely, Christopher L. Sabine, Kitack Lee, Will Berelson, Joanie Kleypas, Victoria J. Fabry, and Frank J. Millero
Science 16 July 2004: 362-366. DOI: 10.1126/science.1097329
→上記のChung et al. (2003)の全球まとめ版。海洋全体で、0.5±0.2PgCのCaCO3（エクスポート生産の45-65%にあたる）が溶解しているらしい。
The Oceanic Sink for Anthropogenic CO2
Christopher L. Sabine, Richard A. Feely, Nicolas Gruber, Robert M. Key, Kitack Lee, John L. Bullister, Rik Wanninkhof, C. S. Wong, Douglas W. R. Wallace, Bronte Tilbrook, Frank J. Millero, Tsung-Hung Peng, Alexander Kozyr, Tsueno Ono, and Aida F. Rios
Science 16 July 2004: 367-371. DOI: 10.1126/science.1097403
→上記のLee et al. (2003)の全球まとめ版。
Oceanography: Anthropogenic carbon and ocean pH
Ken Caldeira & Michael E. Wickett
Nature, 425, 365 (25 September 2003) doi:10.1038/425365a
→海洋GCMで未来の人為起源CO2が、海洋pHに与える影響を計算。pHが0.7も下がるかもしれない。過去3億年間で未経験の大事件になるかもしれない。
Ocean model predictions of chemistry changes from carbon dioxide emissions to the atmosphere and ocean
Caldeira, K., and M. E. Wickett
J. Geophys. Res. (2005) 110, C09S04, doi:10.1029/2004JC002671.
→上記Caldeira & Wickett (2003)の詳細版。pHや炭酸塩補償深度の緯度・深度分布の、人為起源CO2による変化を、海洋GCMで計算。産業革命前と現代の計算に用いた元データは、下記のKey et al. (2004)。
A global ocean carbon climatology: Results from Global Data Analysis Project (GLODAP)
Key, R. M., A. Kozyr, C. L. Sabine, K. Lee, R. Wanninkhof, J. L. Bullister, R. A. Feely, F. J. Millero, C. Mordy, and T.-H. Peng
Global Biogeochem. Cycles (2004) 18, GB4031, doi:10.1029/2004GB002247.
→海水のDICやアルカリ度などの炭酸系化学データや放射性炭素やCFCなどによる海水の年代を、全球で3次元マッピングして、格子状データベース化した。
Ocean acidification due to increasing atmospheric carbon dioxide
Raven J. et al.
The Royal Society, London (2005)
→英国王立協会がまとめた、人為起源CO2による海洋酸性化に関する報告書。
セミナーには炭酸塩を研究している人が多いので、「炭酸系化学と有機地球化学の接点」というテーマで選んだ論文でしたが、そもそもアルカリ度が何たるかを分かっていなかったので、結構苦労しました。その分、海洋の炭酸系化学の基礎が、今更ですが分かってきた気がします。
Estimating the contribution of organic bases from microalgae to the titration alkalinity in coastal seawaters
J. Martín Hernández-Ayon, Alberto Zirino, A. G. Dickson Tania Camiro-Vargas & Valenzuela, E.
Limnol. Oceanogr. Methods, 2007, Vol.5, 225-23
→海生大型藻類を培養して、海水アルカリ度に関して、滴定による測定値と、他のパラメータからの計算値を比較すると、培養日数とともに差が拡大（最大で約800umol/kg！）。有機塩基のせい？ 沿岸域の海水でも、測定値と計算値に有意な差あり（約50-200 umol/kg）。
Estimating the organic acid contribution to coastal seawater alkalinity by potentiometric titrations in a closed cell
François L.L. Muller, and Bjørn Bleie
Analytica Chimica Acta, Volume 619, Issue 2, 7 July 2008, Pages 183-191, doi:10.1016/j.aca.2008.05.018
→ノルウェーのフィヨルドで、滴定による海水アルカリ度測定値と、他のパラメータからの計算値を比較し、“有機物アルカリ度”を見積もり。むしろ、DOMのダイナミクス解明に役立つ？
Contribution of phytoplankton and bacterial cells to the measured alkalinity of seawater
Kim, Hyun-Cheol, Kitack Lee, and Wonyong Choi
Limnol. Oceanogr., 51(1), 2006, 331-338
→粒子状有機物（POM；植物プランクトンやバクテリアの細胞など）が、海水の全アルカリ度に、多少寄与しているかも。
Calcium carbonate budget in the Atlantic Ocean based on water column inorganic carbon chemistry
Chung, S.-N., K. Lee, R. A. Feely, C. L. Sabine, F. J. Millero, R. Wanninkhof, J. L. Bullister, R. M. Key, and T.-H. Peng
Global Biogeochem. Cycles (2003) 17(4), 1093, doi:10.1029/2002GB002001.
→大西洋における炭酸塩の溶解度のbasinスケール分布を、海水アルカリ度の変化から推定。炭酸塩生産量の31%にあたる、年間11.1×10^12molCが溶解しているようだ。
An updated anthropogenic CO2 inventory in the Atlantic Ocean
K. Lee, S.-D. Choi, G.-H. Park, R. Wanninkhof, T.-H. Peng, R. M. Key, C. L. Sabine, R. A. Feely, J. L. Bullister, F. J. Millero, and Alex Kozyr
Global Biogeochem. Cycles (2003) 17(4), 1116, doi:10.1029/2003GB002067.
→海水のDICとアルカリ度などから、Gruber et al. (1996)で導入された複雑な計算を介して、人為起源CO2が大西洋海水に溶けている量を推定。太平洋・インド洋のデータも合わせると、産業革命以後、海は人為起源CO2の29%にあたる112±17PgCを吸収したらしい。
Impact of Anthropogenic CO2 on the CaCO3 System in the Oceans
Richard A. Feely, Christopher L. Sabine, Kitack Lee, Will Berelson, Joanie Kleypas, Victoria J. Fabry, and Frank J. Millero
Science 16 July 2004: 362-366. DOI: 10.1126/science.1097329
→上記のChung et al. (2003)の全球まとめ版。海洋全体で、0.5±0.2PgCのCaCO3（エクスポート生産の45-65%にあたる）が溶解しているらしい。
The Oceanic Sink for Anthropogenic CO2
Christopher L. Sabine, Richard A. Feely, Nicolas Gruber, Robert M. Key, Kitack Lee, John L. Bullister, Rik Wanninkhof, C. S. Wong, Douglas W. R. Wallace, Bronte Tilbrook, Frank J. Millero, Tsung-Hung Peng, Alexander Kozyr, Tsueno Ono, and Aida F. Rios
Science 16 July 2004: 367-371. DOI: 10.1126/science.1097403
→上記のLee et al. (2003)の全球まとめ版。
Oceanography: Anthropogenic carbon and ocean pH
Ken Caldeira & Michael E. Wickett
Nature, 425, 365 (25 September 2003) doi:10.1038/425365a
→海洋GCMで未来の人為起源CO2が、海洋pHに与える影響を計算。pHが0.7も下がるかもしれない。過去3億年間で未経験の大事件になるかもしれない。
Ocean model predictions of chemistry changes from carbon dioxide emissions to the atmosphere and ocean
Caldeira, K., and M. E. Wickett
J. Geophys. Res. (2005) 110, C09S04, doi:10.1029/2004JC002671.
→上記Caldeira & Wickett (2003)の詳細版。pHや炭酸塩補償深度の緯度・深度分布の、人為起源CO2による変化を、海洋GCMで計算。産業革命前と現代の計算に用いた元データは、下記のKey et al. (2004)。
A global ocean carbon climatology: Results from Global Data Analysis Project (GLODAP)
Key, R. M., A. Kozyr, C. L. Sabine, K. Lee, R. Wanninkhof, J. L. Bullister, R. A. Feely, F. J. Millero, C. Mordy, and T.-H. Peng
Global Biogeochem. Cycles (2004) 18, GB4031, doi:10.1029/2004GB002247.
→海水のDICやアルカリ度などの炭酸系化学データや放射性炭素やCFCなどによる海水の年代を、全球で3次元マッピングして、格子状データベース化した。
Ocean acidification due to increasing atmospheric carbon dioxide
Raven J. et al.
The Royal Society, London (2005)
→英国王立協会がまとめた、人為起源CO2による海洋酸性化に関する報告書。
2009年11月9日月曜日
新しい論文（091102-091108）
☆Nature☆
Structural basis of inter-protein electron transfer for nitrite reduction in denitrification
Masaki Nojiri, Hiroyasu Koteishi, Takuya Nakagami, Kazuo Kobayashi, Tsuyoshi Inoue, Kazuya Yamaguchi & Shinnichiro Suzuki
Nature 462, 117-120 (5 November 2009) doi:10.1038/nature08507
→脱窒における亜硝酸還元代謝を担う酵素（CuNIR）とシトクロムcの電子移動複合体の高分解能結晶構造を明らかにした。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Shifts in Lake N:P Stoichiometry and Nutrient Limitation Driven by Atmospheric Nitrogen Deposition
James J. Elser, Tom Andersen, Jill S. Baron, Ann-Kristin Bergstrom, Mats Jansson, Marcia Kyle, Koren R. Nydick, Laura Steger, and Dag O. Hessen
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 835 - 837, DOI: 10.1126/science.1176199
→大気からの窒素降下（化石燃料燃焼や人口肥料使用が由来）が、湖の栄養化学量論を変化させ（窒素制限→リン制限）、湖生態系に影響しているらしい。つまり、人間活動が直接は及ばないような湖でも、沿革的に影響を受けてしまう。
【最新論文（Nature, Science）】
Abiotic Gas Formation Drives Nitrogen Loss from a Desert Ecosystem
Carmody K. McCalley and Jed P. Sparks
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 837 - 840, DOI: 10.1126/science.1178984
→50℃以上になる砂漠表面では、窒素化合物が無機的に反応してガス化して失われているらしい（従来は微生物による代謝が主に行うとされた）。地球温暖化の影響や、全球の窒素循環を考える上で重要。
【陸域生元素循環1】
High Diversity of the Viral Community from an Antarctic Lake
Alberto Lopez-Bueno, Javier Tamames, David Velazquez, Andres Moya, Antonio Quesada, and Antonio Alcami
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 858 - 861, DOI: 10.1126/science.1179287
→南極の淡水湖に存在するウイルス群には、融氷時に顕著な構成成分の変化がみられるらしい（ssDNAのウイルス優勢→dsDNAのウイルス優勢）。
【最新論文（Nature, Science）】
Viral Glycosphingolipids Induce Lytic Infection and Cell Death in Marine Phytoplankton
Assaf Vardi, Benjamin A. S. Van Mooy, Helen F. Fredricks, Kimberly J. Popendorf, Justin E. Ossolinski, Liti Haramaty, and Kay D. Bidle
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 861 - 865, DOI: 10.1126/science.1177322
→海洋性ウイルスは、膜成分であるスフィンゴ糖脂質の生合成をコード化しており、このシグナル伝達経路によって、地球の炭素循環に大きな影響を及ぼす円石藻（Emiliania huxleyi）への感染、細胞死、ひいては集団消滅を制御しているらしい。「ウイルス（感染）のバイオマーカー」やっぱりあったか…。うーん、密かに狙っていただけに残念…。これから流行りそうだ。
【ウイルス1】
☆Geology☆
A possible link between the geomagnetic field and catastrophic climate at the Paleocene-Eocene thermal maximum
Youn Soo Lee and Kazuto Kodama
Geology November 2009, v. 37, p. 1047-1050, doi:10.1130/G30190A.1
→暁新世－始新世温暖極相期（PETM）の時の古地磁気記録を高解像度で調べると、53kyrにわたって地磁気の逆転があった。地磁気（地球核ダイナモ）と表層環境にリンク？ 地球の自転速度が変わった？
【最新論文（地球科学系）】
Extraterrestrial demise of banded iron formations 1.85 billion years ago
John F. Slack and William F. Cannon
Geology November 2009, v. 37, p. 1011-1014, doi:10.1130/G30259A.1
→縞状鉄鉱床（BIFs）が1.85Gaに見られなくなるのは、当時に地球外物質衝突（Sudbury衝突）によって、海水がかき混ぜられて、全体的にsuboxicになったから？
【最新論文（地球科学系）】
☆EOS☆
The Terrestrial Cosmic Ray Flux: Its Importance for Climate
Ram M, M. R. Stolz and B. A. Tinsley
Eos, Vol. 90, No. 44, 3 November 2009, 397-398
→太陽活動周期による宇宙線飛来量変動が気候に影響しているという話。GISP2のダスト量変動に太陽周期（22年など）が見られるらしい。大気～地面の電流が宇宙線の影響を受けるというメカニズム説。
【太陽と気候2】
☆Geochimica et Cosmochimica Acta☆
Elevated Concentrations of Formate, Acetate and Dissolved Organic Carbon Found at the Lost City Hydrothermal Field
Susan Q. Lang, David A. Butterfield, Mitch Schulte, Deborah S. Kelley and Marvin D. Lilley
Geochimica et Cosmochimica Acta, Available online 1 November 2009, doi:10.1016/j.gca.2009.10.045
→Lost City熱水噴出孔で、蟻酸・酢酸などの溶存有機物がわりと高濃度で見られる。蟻酸は、カンラン石の熱水変質に伴い、非生物的に合成されたものらしい。こうした高アルカリ性環境での生命にとって重要かも。
【熱水系1】
Structural basis of inter-protein electron transfer for nitrite reduction in denitrification
Masaki Nojiri, Hiroyasu Koteishi, Takuya Nakagami, Kazuo Kobayashi, Tsuyoshi Inoue, Kazuya Yamaguchi & Shinnichiro Suzuki
Nature 462, 117-120 (5 November 2009) doi:10.1038/nature08507
→脱窒における亜硝酸還元代謝を担う酵素（CuNIR）とシトクロムcの電子移動複合体の高分解能結晶構造を明らかにした。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
Shifts in Lake N:P Stoichiometry and Nutrient Limitation Driven by Atmospheric Nitrogen Deposition
James J. Elser, Tom Andersen, Jill S. Baron, Ann-Kristin Bergstrom, Mats Jansson, Marcia Kyle, Koren R. Nydick, Laura Steger, and Dag O. Hessen
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 835 - 837, DOI: 10.1126/science.1176199
→大気からの窒素降下（化石燃料燃焼や人口肥料使用が由来）が、湖の栄養化学量論を変化させ（窒素制限→リン制限）、湖生態系に影響しているらしい。つまり、人間活動が直接は及ばないような湖でも、沿革的に影響を受けてしまう。
【最新論文（Nature, Science）】
Abiotic Gas Formation Drives Nitrogen Loss from a Desert Ecosystem
Carmody K. McCalley and Jed P. Sparks
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 837 - 840, DOI: 10.1126/science.1178984
→50℃以上になる砂漠表面では、窒素化合物が無機的に反応してガス化して失われているらしい（従来は微生物による代謝が主に行うとされた）。地球温暖化の影響や、全球の窒素循環を考える上で重要。
【陸域生元素循環1】
High Diversity of the Viral Community from an Antarctic Lake
Alberto Lopez-Bueno, Javier Tamames, David Velazquez, Andres Moya, Antonio Quesada, and Antonio Alcami
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 858 - 861, DOI: 10.1126/science.1179287
→南極の淡水湖に存在するウイルス群には、融氷時に顕著な構成成分の変化がみられるらしい（ssDNAのウイルス優勢→dsDNAのウイルス優勢）。
【最新論文（Nature, Science）】
Viral Glycosphingolipids Induce Lytic Infection and Cell Death in Marine Phytoplankton
Assaf Vardi, Benjamin A. S. Van Mooy, Helen F. Fredricks, Kimberly J. Popendorf, Justin E. Ossolinski, Liti Haramaty, and Kay D. Bidle
Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 861 - 865, DOI: 10.1126/science.1177322
→海洋性ウイルスは、膜成分であるスフィンゴ糖脂質の生合成をコード化しており、このシグナル伝達経路によって、地球の炭素循環に大きな影響を及ぼす円石藻（Emiliania huxleyi）への感染、細胞死、ひいては集団消滅を制御しているらしい。「ウイルス（感染）のバイオマーカー」やっぱりあったか…。うーん、密かに狙っていただけに残念…。これから流行りそうだ。
【ウイルス1】
☆Geology☆
A possible link between the geomagnetic field and catastrophic climate at the Paleocene-Eocene thermal maximum
Youn Soo Lee and Kazuto Kodama
Geology November 2009, v. 37, p. 1047-1050, doi:10.1130/G30190A.1
→暁新世－始新世温暖極相期（PETM）の時の古地磁気記録を高解像度で調べると、53kyrにわたって地磁気の逆転があった。地磁気（地球核ダイナモ）と表層環境にリンク？ 地球の自転速度が変わった？
【最新論文（地球科学系）】
Extraterrestrial demise of banded iron formations 1.85 billion years ago
John F. Slack and William F. Cannon
Geology November 2009, v. 37, p. 1011-1014, doi:10.1130/G30259A.1
→縞状鉄鉱床（BIFs）が1.85Gaに見られなくなるのは、当時に地球外物質衝突（Sudbury衝突）によって、海水がかき混ぜられて、全体的にsuboxicになったから？
【最新論文（地球科学系）】
☆EOS☆
The Terrestrial Cosmic Ray Flux: Its Importance for Climate
Ram M, M. R. Stolz and B. A. Tinsley
Eos, Vol. 90, No. 44, 3 November 2009, 397-398
→太陽活動周期による宇宙線飛来量変動が気候に影響しているという話。GISP2のダスト量変動に太陽周期（22年など）が見られるらしい。大気～地面の電流が宇宙線の影響を受けるというメカニズム説。
【太陽と気候2】
☆Geochimica et Cosmochimica Acta☆
Elevated Concentrations of Formate, Acetate and Dissolved Organic Carbon Found at the Lost City Hydrothermal Field
Susan Q. Lang, David A. Butterfield, Mitch Schulte, Deborah S. Kelley and Marvin D. Lilley
Geochimica et Cosmochimica Acta, Available online 1 November 2009, doi:10.1016/j.gca.2009.10.045
→Lost City熱水噴出孔で、蟻酸・酢酸などの溶存有機物がわりと高濃度で見られる。蟻酸は、カンラン石の熱水変質に伴い、非生物的に合成されたものらしい。こうした高アルカリ性環境での生命にとって重要かも。
【熱水系1】
科学ニュース（091102-091108）
Past Climate Of Northern Antarctic Peninsular Informs Global Warming Debate
ScienceDaily (Nov. 6, 2009)
→南極半島北部で、過去1万4千年分の堆積物コアから気候復元。過去50年で3℃温暖化したらしい。Geological Society of America Bulletinに論文。
Lightning's 'NOx-ious' Impact On Pollution, Climate
ScienceDaily (Nov. 6, 2009)
→雷による窒素酸化物（NOx）生成への寄与率は、従来10%ぐらいと考えられてきたが、実際はもっと大きく、重要かもしれない。中緯度～亜熱帯での観測によると、雷1回で平均7kgのNOxが生成されるらしい。Journal of Geophysical Researchに論文。
March Geoengineering Confab Draws Praise, Criticism
Science Incider, November 6, 2009
→硫酸を成層圏にまいたり、鉄を海にまいたりして、地球温暖化を抑制しようという「地球工学」の是非を問う会議が来年3月に開催されるが、地球工学企業とのつながりに対して、利益相反の批判も。
The $4400 Genome
ScienceNOW Daily News (Nov. 6, 2009)
→ついに40万円でヒトゲノムが読めるようになったらしい。従来より一桁安い。じきに1日ほどで読めるようになるらしい。これはすごい。Science電子版に論文。
Abiotic Synthesis Of Methane: New Evidence Supports 19th-Century Idea On Formation Of Oil And Gas
ScienceDaily (Nov. 6, 2009)
→地球深部の温度圧力条件をダイヤモンドアンビルセルで再現して実験すると、メタンが非生物的に生成したらしい。石油無機起源説を支持？ Energy & Fuelに論文。
Airborne Nitrogen Shifts Aquatic Nutrient Limitation In Pristine Lakes
ScienceDaily (Nov. 5, 2009)
→大気からの窒素降下（化石燃料燃焼や人口肥料使用が由来）が、湖の栄養化学量論を変化させ（窒素制限→リン制限）、湖生態系に影響しているらしい。リン制限な植物プランクトンは、動物にとって”ジャンクフード”らしいので。Scienceに論文。
Earthquakes Actually Aftershocks Of 19th Century Quakes; Repercussions Of 1811 And 1812 New Madrid Quakes Continue To Be Felt
ScienceDaily (Nov. 5, 2009)
Earth science: Lasting earthquake legacy
Nature News & Views (Nov. 5, 2009)
Aftershocks can last for centuries
Nature News (Nov. 4, 2009)
→プレート内部での最近の地震の多くは、数百年前に起きた大地震の余震らしい。したがって、定常状態の地震活動として大陸の地震を取り扱う一般的な方法は、現在地震活動が活発な地域の災害を過大評価し、それ以外の地域では過小評価していることになる。 Natureに論文。
Newly Drilled Ice Cores May Be The Longest Taken From The Andes
ScienceDaily (Nov. 4, 2009)
→オハイオ州立大学のグループが、アンデスで5364mのアイスコアを掘削。かなり大量の昆虫・植物が氷中に含まれているらしい。温暖化の影響で、氷河が融け始めているので、この地点でのアイスコア掘削は最後のチャンス？
Mapping Nutrient Distributions Over The Atlantic Ocean
ScienceDaily (Nov. 3, 2009)
→溶存有機窒素と溶存有機リンの分布が、初めて大西洋で系統的にマッピングされた。表層100mの栄養の75%は溶存有機物らしい。また、北大西洋の方が濃度が薄い。Global Biogeochemical Cyclesに論文。
Origin Of Cosmic Rays: VERITAS Telescopes Help Solve 100-year-old Mystery
ScienceDaily (Nov. 3, 2009)
→VERITAS望遠鏡によるガンマ線観測から、宇宙線が光速近くにまで加速されている機構（100年来の謎）が分かった。超新星爆発や星間風らしい。超新星爆発が多数集まるM82星雲を観測すると、そこから宇宙線が多く放射されているらしい。Nature電子版に論文。
Deep-sea Ecosystems Affected By Climate Change
ScienceDaily (Nov. 3, 2009)
→深海の動物生態系は、気候変動に様々なかたちで影響されているらしい。表層からの有機物供給が、風による湧昇、混合層深度、ダスト輸送などの変化によって、大きく変化するとか。例えばある種の魚は、15年間で数が倍増。PNASに論文。
'Ultra-primitive' Particles Found In Comet Dust
ScienceDaily (Nov. 2, 2009)
→地球上層大気で、太陽系形成以前に作られた、非常に古い粒子（presolar grain）が採取された。2003年の彗星によってもたらされたらしい。Earth and Planetary Science Lettersに論文。
ScienceDaily (Nov. 6, 2009)
→南極半島北部で、過去1万4千年分の堆積物コアから気候復元。過去50年で3℃温暖化したらしい。Geological Society of America Bulletinに論文。
Lightning's 'NOx-ious' Impact On Pollution, Climate
ScienceDaily (Nov. 6, 2009)
→雷による窒素酸化物（NOx）生成への寄与率は、従来10%ぐらいと考えられてきたが、実際はもっと大きく、重要かもしれない。中緯度～亜熱帯での観測によると、雷1回で平均7kgのNOxが生成されるらしい。Journal of Geophysical Researchに論文。
March Geoengineering Confab Draws Praise, Criticism
Science Incider, November 6, 2009
→硫酸を成層圏にまいたり、鉄を海にまいたりして、地球温暖化を抑制しようという「地球工学」の是非を問う会議が来年3月に開催されるが、地球工学企業とのつながりに対して、利益相反の批判も。
The $4400 Genome
ScienceNOW Daily News (Nov. 6, 2009)
→ついに40万円でヒトゲノムが読めるようになったらしい。従来より一桁安い。じきに1日ほどで読めるようになるらしい。これはすごい。Science電子版に論文。
Abiotic Synthesis Of Methane: New Evidence Supports 19th-Century Idea On Formation Of Oil And Gas
ScienceDaily (Nov. 6, 2009)
→地球深部の温度圧力条件をダイヤモンドアンビルセルで再現して実験すると、メタンが非生物的に生成したらしい。石油無機起源説を支持？ Energy & Fuelに論文。
Airborne Nitrogen Shifts Aquatic Nutrient Limitation In Pristine Lakes
ScienceDaily (Nov. 5, 2009)
→大気からの窒素降下（化石燃料燃焼や人口肥料使用が由来）が、湖の栄養化学量論を変化させ（窒素制限→リン制限）、湖生態系に影響しているらしい。リン制限な植物プランクトンは、動物にとって”ジャンクフード”らしいので。Scienceに論文。
Earthquakes Actually Aftershocks Of 19th Century Quakes; Repercussions Of 1811 And 1812 New Madrid Quakes Continue To Be Felt
ScienceDaily (Nov. 5, 2009)
Earth science: Lasting earthquake legacy
Nature News & Views (Nov. 5, 2009)
Aftershocks can last for centuries
Nature News (Nov. 4, 2009)
→プレート内部での最近の地震の多くは、数百年前に起きた大地震の余震らしい。したがって、定常状態の地震活動として大陸の地震を取り扱う一般的な方法は、現在地震活動が活発な地域の災害を過大評価し、それ以外の地域では過小評価していることになる。 Natureに論文。
Newly Drilled Ice Cores May Be The Longest Taken From The Andes
ScienceDaily (Nov. 4, 2009)
→オハイオ州立大学のグループが、アンデスで5364mのアイスコアを掘削。かなり大量の昆虫・植物が氷中に含まれているらしい。温暖化の影響で、氷河が融け始めているので、この地点でのアイスコア掘削は最後のチャンス？
Mapping Nutrient Distributions Over The Atlantic Ocean
ScienceDaily (Nov. 3, 2009)
→溶存有機窒素と溶存有機リンの分布が、初めて大西洋で系統的にマッピングされた。表層100mの栄養の75%は溶存有機物らしい。また、北大西洋の方が濃度が薄い。Global Biogeochemical Cyclesに論文。
Origin Of Cosmic Rays: VERITAS Telescopes Help Solve 100-year-old Mystery
ScienceDaily (Nov. 3, 2009)
→VERITAS望遠鏡によるガンマ線観測から、宇宙線が光速近くにまで加速されている機構（100年来の謎）が分かった。超新星爆発や星間風らしい。超新星爆発が多数集まるM82星雲を観測すると、そこから宇宙線が多く放射されているらしい。Nature電子版に論文。
Deep-sea Ecosystems Affected By Climate Change
ScienceDaily (Nov. 3, 2009)
→深海の動物生態系は、気候変動に様々なかたちで影響されているらしい。表層からの有機物供給が、風による湧昇、混合層深度、ダスト輸送などの変化によって、大きく変化するとか。例えばある種の魚は、15年間で数が倍増。PNASに論文。
'Ultra-primitive' Particles Found In Comet Dust
ScienceDaily (Nov. 2, 2009)
→地球上層大気で、太陽系形成以前に作られた、非常に古い粒子（presolar grain）が採取された。2003年の彗星によってもたらされたらしい。Earth and Planetary Science Lettersに論文。
2009年11月2日月曜日
科学ニュース（091026-091101）
Did Ancient Earth Go Nuclear?
ScienceNOW Daily News, 29 October 2009
→GOEぐらいで大気酸素濃度が上昇した結果、ウランが可溶性になって海水に溶けだし、沿岸とかに蓄積して、自然に核反応が生じたという仮説の提唱。生物進化にも影響？ GSA Todayに論文。
Aerosols make methane more potent
Nature News, 29 October 2009
Atmospheric Science: Clean the Air, Heat the Planet?
Science Perspectives, 30 October 2009
Interactions With Aerosols Boost Warming Potential Of Some Gases
ScienceDaily (Oct. 31, 2009)
→エアロゾルとメタンを一緒に考えて計算すると、メタンの温室効果は従来予想より大きくなった。Scienceに論文。
Volcanoes Played Pivotal Role In Ancient Ice Age, Mass Extinction ScienceDaily (Oct. 26, 2009)
→4億5000万年前のオルドビス紀の氷河期は、火山のせい？ Geologyに論文。
Ancient 'Monster' Insect: 'Unicorn' Fly Never Before Observed
ScienceDaily (Oct. 26, 2009)
→1億年前のコハクの中に、“ユニコーン”バエを発見。Cretaceous Researchに論文。
New Wrinkle In Ancient Ocean Chemistry
ScienceDaily (Oct. 30, 2009)
→従来の予想より7億年も早く、25億年前には硫化水素に富んだ海水が形成されていた。極微量の酸素が光合成で生成され、大陸の風化を促進したためらしい。Scienceに論文。
ScienceNOW Daily News, 29 October 2009
→GOEぐらいで大気酸素濃度が上昇した結果、ウランが可溶性になって海水に溶けだし、沿岸とかに蓄積して、自然に核反応が生じたという仮説の提唱。生物進化にも影響？ GSA Todayに論文。
Aerosols make methane more potent
Nature News, 29 October 2009
Atmospheric Science: Clean the Air, Heat the Planet?
Science Perspectives, 30 October 2009
Interactions With Aerosols Boost Warming Potential Of Some Gases
ScienceDaily (Oct. 31, 2009)
→エアロゾルとメタンを一緒に考えて計算すると、メタンの温室効果は従来予想より大きくなった。Scienceに論文。
Volcanoes Played Pivotal Role In Ancient Ice Age, Mass Extinction ScienceDaily (Oct. 26, 2009)
→4億5000万年前のオルドビス紀の氷河期は、火山のせい？ Geologyに論文。
Ancient 'Monster' Insect: 'Unicorn' Fly Never Before Observed
ScienceDaily (Oct. 26, 2009)
→1億年前のコハクの中に、“ユニコーン”バエを発見。Cretaceous Researchに論文。
New Wrinkle In Ancient Ocean Chemistry
ScienceDaily (Oct. 30, 2009)
→従来の予想より7億年も早く、25億年前には硫化水素に富んだ海水が形成されていた。極微量の酸素が光合成で生成され、大陸の風化を促進したためらしい。Scienceに論文。
新しい論文（091026-091101）
☆Nature☆
Volatile accretion history of the terrestrial planets and dynamic implications
Francis Albarède
Nature 461, 1227-1233 (29 October 2009) doi:10.1038/nature08477
→「地球型惑星は基本的に乾燥しており、水を含んだ物質の集積を通して初めて揮発性元素を獲得した」という仮説に対する証拠の検討。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
A Late Archean Sulfidic Sea Stimulated by Early Oxidative Weathering of the Continents
Christopher T. Reinhard, Rob Raiswell, Clint Scott, Ariel D. Anbar, and Timothy W. Lyons
Science 30 October 2009: Vol. 326. no. 5953, pp. 713 – 716, DOI: 10.1126/science.1176711
→従来の予想より7億年も早く、25億年前には硫化水素に富んだ海水が形成されていた。極微量の酸素（硫黄のMIFは残る程度）が光合成で生成され、大陸の風化を促進したためらしい。
【先カンブリア紀2】
Improved Attribution of Climate Forcing to Emissions
Drew T. Shindell, Greg Faluvegi, Dorothy M. Koch, Gavin A. Schmidt, Nadine Unger, and Susanne E. Bauer
Science 30 October 2009: Vol. 326. no. 5953, pp. 716 – 718, DOI: 10.1126/science.1174760
→メタン－オゾン－エアロゾル相互作用を考慮に入れて計算すると、メタンの温室効果は、京都議定書で採用された従来予想よりも大きく出た。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Nature Geoscience☆
Large-scale distribution of Atlantic nitrogen fixation controlled by iron availability
C. Mark Moore, Matthew M. Mills, Eric P. Achterberg, Richard J. Geider, Julie LaRoche, Mike I. Lucas, Elaine L. McDonagh, Xi Pan, Alex J. Poulton, Micha J. A. Rijkenberg, David J. Suggett, Simon J. Ussher & E. Malcolm S. Woodward
Nature Geoscience, Published online: 01 November 2009 doi:10.1038/ngeo667
→大西洋を南北にトランセクトで窒素固定速度や栄養塩濃度を調べると、北大西洋の方が南大西洋よりも窒素固定速度が高く、鉄イオン濃度と正相関。鉄の供給が、窒素固定の制限要因になっているらしい。
【海洋生元素循環3】
☆Environmental Microbiology☆
Metagenome and mRNA expression analyses of anaerobic methanotrophic archaea of the ANME-1 group
Anke Meyerdierks, Michael Kube, Ivaylo Kostadinov Hanno Teeling Frank Oliver Glöckner Richard Reinhardt & Amann, Rudolf
Environmental Microbiology, Published Online: 29 Oct 2009, DOI:10.1111/j.1462-2920.2009.02083.x
→ANME（嫌気的メタン酸化アーキア）-1のメタゲノム解析、mRNA発現解析。
【地下生物圏2】
Biomass production and energy source of thermophiles in a Japanese alkaline geothermal pool
Hiroyuki Kimura, Kousuke Mori, Hiroaki Nashimoto, Shohei Hattori, Keita Yamada, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Kenji Kato
Environmental Microbiology, Published Online: Oct 29 2009, DOI: 10.1111/j.1462-2920.2009.02089.x
→長野県の85℃の温泉で、好熱微生物の生態学とガス同位体地球化学。水素ガスを酸化してエネルギー源にするバクテリアがたくさんいるらしい。
【熱水系1】
Roles of viruses in the environment
Forest Rohwer, David Prangishvili, Debbie Lindell
Environmental Microbiology, Published Online: Oct 27 2009, DOI: 10.1111/j.1462-2920.2009.02101.x
→Environmental Microbiologyの2009年11月号の“環境中ウイルス”特集号の序言。15本の論文が続く。
【ウイルス1】
Volatile accretion history of the terrestrial planets and dynamic implications
Francis Albarède
Nature 461, 1227-1233 (29 October 2009) doi:10.1038/nature08477
→「地球型惑星は基本的に乾燥しており、水を含んだ物質の集積を通して初めて揮発性元素を獲得した」という仮説に対する証拠の検討。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Science☆
A Late Archean Sulfidic Sea Stimulated by Early Oxidative Weathering of the Continents
Christopher T. Reinhard, Rob Raiswell, Clint Scott, Ariel D. Anbar, and Timothy W. Lyons
Science 30 October 2009: Vol. 326. no. 5953, pp. 713 – 716, DOI: 10.1126/science.1176711
→従来の予想より7億年も早く、25億年前には硫化水素に富んだ海水が形成されていた。極微量の酸素（硫黄のMIFは残る程度）が光合成で生成され、大陸の風化を促進したためらしい。
【先カンブリア紀2】
Improved Attribution of Climate Forcing to Emissions
Drew T. Shindell, Greg Faluvegi, Dorothy M. Koch, Gavin A. Schmidt, Nadine Unger, and Susanne E. Bauer
Science 30 October 2009: Vol. 326. no. 5953, pp. 716 – 718, DOI: 10.1126/science.1174760
→メタン－オゾン－エアロゾル相互作用を考慮に入れて計算すると、メタンの温室効果は、京都議定書で採用された従来予想よりも大きく出た。
【最新論文（Nature, Science）】
☆Nature Geoscience☆
Large-scale distribution of Atlantic nitrogen fixation controlled by iron availability
C. Mark Moore, Matthew M. Mills, Eric P. Achterberg, Richard J. Geider, Julie LaRoche, Mike I. Lucas, Elaine L. McDonagh, Xi Pan, Alex J. Poulton, Micha J. A. Rijkenberg, David J. Suggett, Simon J. Ussher & E. Malcolm S. Woodward
Nature Geoscience, Published online: 01 November 2009 doi:10.1038/ngeo667
→大西洋を南北にトランセクトで窒素固定速度や栄養塩濃度を調べると、北大西洋の方が南大西洋よりも窒素固定速度が高く、鉄イオン濃度と正相関。鉄の供給が、窒素固定の制限要因になっているらしい。
【海洋生元素循環3】
☆Environmental Microbiology☆
Metagenome and mRNA expression analyses of anaerobic methanotrophic archaea of the ANME-1 group
Anke Meyerdierks, Michael Kube, Ivaylo Kostadinov Hanno Teeling Frank Oliver Glöckner Richard Reinhardt & Amann, Rudolf
Environmental Microbiology, Published Online: 29 Oct 2009, DOI:10.1111/j.1462-2920.2009.02083.x
→ANME（嫌気的メタン酸化アーキア）-1のメタゲノム解析、mRNA発現解析。
【地下生物圏2】
Biomass production and energy source of thermophiles in a Japanese alkaline geothermal pool
Hiroyuki Kimura, Kousuke Mori, Hiroaki Nashimoto, Shohei Hattori, Keita Yamada, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Kenji Kato
Environmental Microbiology, Published Online: Oct 29 2009, DOI: 10.1111/j.1462-2920.2009.02089.x
→長野県の85℃の温泉で、好熱微生物の生態学とガス同位体地球化学。水素ガスを酸化してエネルギー源にするバクテリアがたくさんいるらしい。
【熱水系1】
Roles of viruses in the environment
Forest Rohwer, David Prangishvili, Debbie Lindell
Environmental Microbiology, Published Online: Oct 27 2009, DOI: 10.1111/j.1462-2920.2009.02101.x
→Environmental Microbiologyの2009年11月号の“環境中ウイルス”特集号の序言。15本の論文が続く。
【ウイルス1】
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