2010年9月30日木曜日

科学ニュース(100901-100930)

Geomicrobiology: Methanotrophs in moss
Nature Geosciences News & Views, 1 September 2010
→泥炭地におけるコケとメタン酸化微生物の共生。Nature Geosciencesに論文。

Climate Change: Panel Faults IPCC Leadership But Praises Its Conclusions
Science News of the Week, 3 Sep 2010
→各国の科学アカデミー合同委員会「インターアカデミー・カウンシル(IAC)」から、気候変動に関する政府間パネル(IPCC)に対する最新の検証が発表された。

Astrophysics: An Unsettled Debate About the Chemistry of the Sun
Science News of the Week, 3 Sep 2010
→太陽内部の化学組成については、2005年に新説が出てから、まだ議論が続いている。

Transition Metal Catalysts Could Be Key to Origin of Life, Scientists Report
ScienceDaily (Sep. 6, 2010)
→生命の起源には、熱水地下環境の遷移金属による錯体形成が重要? The Biological Bulletinに論文。

Geology: A trip to dinosaur time
Nature News, 8 September 2010
→中国Sangliao盆地を10km掘削して、白亜紀の環境変動を復元するプロジェクトが、ICDPの一環で進行中。すごいな。。。

Climate change: A glacial test of timing
Nature News & Views, 8 Sep 2010
→Younger Dryasにおける南半球の気候変動を、ニュージーランド氷河から復元。Natureに論文。

Planetary Science: Phoenix Lander Revealing a Younger, Livelier Mars
Science News of the Week, 10 Sep 2010
→フェニックスが火星大気中の二酸化炭素の安定同位体測定値を報告。火星の大気は現在も、液体の水とやりとりがあるらしい。Scienceに論文。

Origins of life: Shock synthesis
Nature News & Views, 15 Sep 2010
→隕石衝突が生命の起源?

Paleontology: China Clamps Down on Illegal Fossil Trading
Science News of the Week, 17 Sep 2010
→中国政府、違法な化石売買の取り締まりに着手。羽毛恐竜などの化石の宝庫となっている中国の壮大な化石層では略奪が横行。「国務院」はこれを阻止するため、規制法を発令。

When Earth's Mantle Meets Its Core: Findings Boost Hypothesis of Deep Magma Ocean
ScienceDaily (Sep. 17, 2010)
→マントル-核境界の温度圧力条件で、マントル岩石であるperidotiteが部分融解するらしい。深部マグマオーシャン仮説を支持。Scienceに論文。

Surprisingly Complicated Molecule Found in Outer Space
ScienceDaily (Sep. 17, 2010)
→超真空な星間ガス中にも、cyanopolyyne(HC11N)とかdiacetylene cation(H-CC-CC-H+)とか、けっこう複雑な有機分子が見つかっているらしい。

Martian Methane Lasts Less Than a Year
ScienceDaily (Sep. 22, 2010)
→最近なにかと話題の火星メタンの寿命は1年以内らしい。つまり、活発なソースとシンクの存在があると。European Planetary Science Congress 2010で発表。

Newly Discovered Planet May Be First Truly Habitable Exoplanet
ScienceDaily (Sep. 29, 2010)
→液体の水が存在可能な領域に、地球の3倍質量の系外惑星を発見。Astrophysical Journal(ApJ)に論文。

Marine biology: Out of the blue
Nature News, 29 Sep 2010
→6憶5千万ドルをかけて10年間おこなわれた国際プロジェクト「Census for Marine Life」の成果と課題について。

Biogeochemistry: Ocean biomes blended
Nature News & Views, 29 Sep 2010
→海洋中の窒素栄養塩とリン栄養塩の比は、海水の混合を考慮してモデル化するとうまく説明できるらしい。

Fossilized Giant Penguin Reveals Unusual Colors, Sheds Light on Bird Evolution
ScienceDaily (Sep. 30, 2010)
How Penguins Got Their Water Wings
Science Now, 30 September 2010
→3600万年前の古代ペンギンの化石を発見。エンペラーペンギンの2倍の大きさで、赤褐色の羽をしていたらしい。Science電子版に論文。

新しい論文(100901-100930)

2010年9月分をまとめて更新。

☆Nature☆

The impacts of climate change on water resources and agriculture in China
Shilong Piao et al.
Nature 467, 43-51 (2 September 2010) | doi:10.1038/nature09364
→気候変動が中国の水資源と農業に与える影響についてレビュー。将来予測はまだ難しいらしい。

Olivine water contents in the continental lithosphere and the longevity of cratons
Anne H. Peslier, Alan B. Woodland, David R. Bell & Marina Lazarov
Nature 467, 78-81 (2 September 2010) | doi:10.1038/nature09317
→大陸リソスフェアがマントルと混じり合わずに長期間安定な理由は、含水率の低さらしい。

Glacier retreat in New Zealand during the Younger Dryas stadial
Michael R. Kaplan, Joerg M. Schaefer, George H. Denton, David J. A. Barrell, Trevor J. H. Chinn, Aaron E. Putnam, Bjorn G. Andersen, Robert C. Finkel, Roseanne Schwartz & Alice M. Doughty
Nature 467, 194-197 (9 September 2010) | doi:10.1038/nature09313
→Younger Dryasにおけるニュージーランドの氷河の進退を復元。北半球が寒冷な時代だったが、南半球は温暖だったらしい。

A bizarre, humped Carcharodontosauria (Theropoda) from the Lower Cretaceous of Spain
Francisco Ortega, Fernando Escaso & Jose L. Sanz
Nature 467, 203-206 (9 September 2010) | doi:10.1038/nature09181
→背骨が湾曲している奇妙な肉食恐竜化石の発見。

Decreased frequency of North Atlantic polar lows associated with future climate warming
Matthias Zahn & Hans von Storch
Nature 467, 309-312 (16 September 2010) | doi:10.1038/nature09388
→気候モデル計算によると、将来の気候温暖化に伴って、北大西洋の極低気圧の頻度が減少するらしい。

Glaciation as a destructive and constructive control on mountain building
Stuart N. Thomson, Mark T. Brandon, Jonathan H. Tomkin, Peter W. Reiners, Cristian Vasquez & Nathaniel J. Wilson
Nature 467, 313-317 (16 September 2010) | doi:10.1038/nature09365
→パタゴニアアンデスの研究によると、氷河は山岳侵食に対して保護の役割も行う。

Formate-driven growth coupled with H2 production
Yun Jae Kim, Hyun Sook Lee, Eun Sook Kim, Seung Seob Bae, Jae Kyu Lim, Rie Matsumi, Alexander V. Lebedinsky, Tatyana G. Sokolova, Darya A. Kozhevnikova, Sun-Shin Cha, Sang-Jin Kim, Kae Kyoung Kwon, Tadayuki Imanaka, Haruyuki Atomi, Elizaveta A. Bonch-Osmolovskaya, Jung-Hyun Lee & Sung Gyun Kang
Nature 467, 352-355 (16 September 2010)  doi:10.1038/nature09375
→好熱アーキアThermococcusの一種は、嫌気環境下において、単独でギ酸+水→重炭酸+水素という代謝を行ってエネルギーを獲得している。ほほう。

Ocean nutrient ratios governed by plankton biogeography
Thomas S. Weber & Curtis Deutsch
Nature 467, 550-554 (30 September 2010) | doi:10.1038/nature09403
→海洋中の窒素栄養塩とリン栄養塩の比率は、各地域の藻類の群集組成によって変わり(12:1~20:1)、16:1という比は、海水の混合によって作られる。逆に、群集組成が気候変動などで変わると、栄養塩比率も変わり、生物ポンプも変化しうる。

Vertical extension of the subglacial drainage system into basal crevasses
Joel T. Harper, John H. Bradford, Neil F. Humphrey & Toby W. Meierbachtol
Nature 467, 579-582 (30 September 2010) | doi:10.1038/nature09398
→氷河の下の水流システムは、底面クレバスも考慮に入れると、水の量が非常に多くなるらしい。


☆Science☆

Chlorine Isotope Fractionation in the Stratosphere
J. C. Laube, J. Kaiser, W. T. Sturges, H. Bonisch, and A. Engel
Science 3 September 2010: Vol. 329. no. 5996, p. 1167, DOI: 10.1126/science.1191809
→成層圏における含塩素有機分子(CFC-12)の塩素同位体分別を初報告。大気化学と輸送プロセスの新手法となる?

Plastic Accumulation in the North Atlantic Subtropical Gyre
Kara Lavender Law, Skye Moret-Ferguson, Nikolai A. Maximenko, Giora Proskurowski, Emily E. Peacock, Jan Hafner, and Christopher M. Reddy
Science 3 September 2010: Vol. 329. no. 5996, pp. 1185 - 1188, DOI: 10.1126/science.1192321
→1986~2008年における、西北大西洋・カリブ海のプラスチックゴミの蓄積を調査。エクマン輸送によって亜熱帯地域に最も蓄積するらしい。しかし、プラスチック濃度のトレンドは見られないらしい。

The Shifting Balance of Diversity Among Major Marine Animal Groups
J. Alroy
Science 3 September 2010: Vol. 329. no. 5996, pp. 1191 - 1194, DOI: 10.1126/science.1189910
→化石記録は、主な分類群には各々一定の多様化率 と種の個体密度限界があることを示しており、その特性から、優勢な分類群の変化が予測できると考えられてきたが、適応放散や絶滅に応じて多様性の限界は上下するらしい。

A Red-Shifted Chlorophyll
Min Chen, Martin Schliep, Robert D. Willows, Zheng-Li Cai, Brett A. Neilan, and Hugo Scheer
Science 10 September 2010: Vol. 329. no. 5997, pp. 1318 - 1319, DOI: 10.1126/science.1191127
→より赤外線領域(706nm)を吸収する新種のクロロフィル、クロロフィルfを発見。なんと。

Future CO2 Emissions and Climate Change from Existing Energy Infrastructure
Steven J. Davis, Ken Caldeira, and H. Damon Matthews
Science 10 September 2010: Vol. 329. no. 5997, pp. 1330 - 1333, DOI: 10.1126/science.1188566
→2010年から2060年までに、現在のエネルギーインフラによる化石燃料燃焼に由来する二酸化炭素の累積排出量は496(282-701)ギガトン、平均1.3℃の温度上昇をもたらすらしい。

Stable Isotope Measurements of Martian Atmospheric CO2 at the Phoenix Landing Site
Paul B. Niles, William V. Boynton, John H. Hoffman, Douglas W. Ming, and Dave Hamara
Science 10 September 2010: Vol. 329. no. 5997, pp. 1334 - 1337, DOI: 10.1126/science.1192863
→フェニックスの着陸地点における火星大気中の二酸化炭素の安定同位体測定値。炭素が2.5 ± 4.3 per mil、酸素が31.0 ± 5.7 per mil。現世の火山脱ガスと液体の水との平衡に大きく影響されているらしい。

Tyrannosaur Paleobiology: New Research on Ancient Exemplar Organisms
Stephen L. Brusatte, Mark A. Norell, Thomas D. Carr, Gregory M. Erickson, John R. Hutchinson, Amy M. Balanoff, Gabe S. Bever, Jonah N. Choiniere, Peter J. Makovicky, and Xing Xu
Science 17 September 2010: Vol. 329. no. 5998, pp. 1481 - 1485, DOI: 10.1126/science.1193304
→ティラノサウルス古生物学のレビュー。

Hemispheric Aerosol Vertical Profiles: Anthropogenic Impacts on Optical Depth and Cloud Nuclei
Antony Clarke and Vladimir Kapustin
Science 17 September 2010: Vol. 329. no. 5998, pp. 1488 - 1492, DOI: 10.1126/science.1188838
→海半球におけるエアロゾルの鉛直分布を報告。エアロゾルの光散乱、質量、数が増大しており、この増大は人為的燃焼による一酸化炭素と関連していることが確認された。

Global Distribution of Large Lunar Craters: Implications for Resurfacing and Impactor Populations
James W. Head, III, Caleb I. Fassett, Seth J. Kadish, David E. Smith, Maria T. Zuber, Gregory A. Neumann, and Erwan Mazarico
Science 17 September 2010: Vol. 329. no. 5998, pp. 1504 - 1507, DOI: 10.1126/science.1195050
→高分解能高度測定により、月表面の直径20km以上の衝突クレーターについて全目録が作成され、月における衝突の歴史についての理解が進展した。

Global Silicate Mineralogy of the Moon from the Diviner Lunar Radiometer
Benjamin T. Greenhagen, Paul G. Lucey, Michael B. Wyatt, Timothy D. Glotch, Carlton C. Allen, Jessica A. Arnold, Joshua L. Bandfield, Neil E. Bowles, Kerri L. Donaldson Hanna, Paul O. Hayne, Eugenie Song, Ian R. Thomas, and David A. Paige
Science 17 September 2010: Vol. 329. no. 5998, pp. 1507 - 1509, DOI: 10.1126/science.1192196
→月放射測定実験(DLRE)で、熱放出分光法により、これまでに知られている斜長岩や玄武岩の組成と一致するスペクトル特性以外に、シリカを多く含む月の土壌の存在が明らかになった。

Highly Silicic Compositions on the Moon
Timothy D. Glotch, Paul G. Lucey, Joshua L. Bandfield, Benjamin T. Greenhagen, Ian R. Thomas, Richard C. Elphic, Neil Bowles, Michael B. Wyatt, Carlton C. Allen, Kerri Donaldson Hanna, and David A. Paige
Science 17 September 2010: Vol. 329. no. 5998, pp. 1510 - 1513, DOI: 10.1126/science.1192148
→月放射測定実験(DLRE)で、これまで「レッドスポット」と言われていた月の4カ所が中間赤外スペクトルを示し、石英・水晶、長石、またはシリコンに富むガラスの存在によると考えられた。

Rainforest Aerosols as Biogenic Nuclei of Clouds and Precipitation in the Amazon
U. Poschl, S. T. Martin, B. Sinha, Q. Chen, S. S. Gunthe, J. A. Huffman, S. Borrmann, D. K. Farmer, R. M. Garland, G. Helas, J. L. Jimenez, S. M. King, A. Manzi, E. Mikhailov, T. Pauliquevis, M. D. Petters, A. J. Prenni, P. Roldin, D. Rose, J. Schneider, H. Su, S. R. Zorn, P. Artaxo, and M. O. Andreae
Science 17 September 2010: Vol. 329. no. 5998, pp. 1513 - 1516, DOI: 10.1126/science.1191056
→大気中のエアロゾル粒子による気候への影響が人為的要素に左右されないアマゾンでは、雨期の環境条件は工業化以前の時代に近づく。今回、雲核を占める微粒子の大半が、生物由来のガス状前駆体の酸化で形成された有機物であることが明らかになった。

Melting of Peridotite to 140 Gigapascals
G. Fiquet, A. L. Auzende, J. Siebert, A. Corgne, H. Bureau, H. Ozawa, and G. Garbarino
Science 17 September 2010: Vol. 329. no. 5998, pp. 1516 - 1518, DOI: 10.1126/science.1192448
→マントル最下部における部分融解は核・マントル境界の地震波超低速度領域の原因とされている。今回、レーザー加熱式ダイアモンドアンビルセルを用いた高温高圧実験により、マントル最下部条件までのかんらん岩の融解相関係及び元素分配が明らかになった。

Eocene Patagonia Fossils of the Daisy Family
V. D. Barreda, L. Palazzesi, M. C. Telleria, L. Katinas, J. V. Crisci, K. Bremer, M. G. Passalia, R. Corsolini, R. Rodriguez Brizuela, and F. Bechis
Science 24 September 2010: Vol. 329. no. 5999, p. 1621, DOI: 10.1126/science.1193108
→ヒナギクやひまわりを含むキク科(Asteraceae)植物は、地球上の顕花植物のうち最も多様性に富み、広く分布している。キク科に特異的な小頭球(capitulum)の化石から、起源は、4700万年以上前の南米と考えられた。

The Ubiquity of Micrometer-Sized Dust Grains in the Dense Interstellar Medium
Laurent Pagani, Jurgen Steinacker, Aurore Bacmann, Amelia Stutz, and Thomas Henning
Science 24 September 2010: Vol. 329. no. 5999, pp. 1622 - 1624, DOI: 10.1126/science.1193211
→低温分子雲は恒星や惑星の誕生領域であり、雲中に混在する塵は平均 0.1micrometer (ミクロン)と考えられている。今回ミクロンサイズに成長した塵(dust grains)の存在を直接示すcoreshine effectが広域に観察された。

Slip Systems in MgSiO3 Post-Perovskite: Implications for D'' Anisotropy
Lowell Miyagi, Waruntorn Kanitpanyacharoen, Pamela Kaercher, Kanani K. M. Lee, and Hans-Rudolf Wenk
Science 24 September 2010: Vol. 329. no. 5999, pp. 1639 - 1641, DOI: 10.1126/science.1192465
→最下部マントルにおける鉱物相の変形を知ることは、地球内部の地震波異方性を解釈する上で重要である。今回、MgSiO3ポストペロブスカイトに対して軸圧縮実験が行なわれ、transformation直後と変形直前に格子面が高角度で圧縮方向に向いていた結果から、圧縮時に格子面上ですべりが起こったことが示唆された。


☆Nature Geosciences☆

Global prevalence of methane oxidation by symbiotic bacteria in peat-moss ecosystems
Nardy Kip, Julia F. van Winden, Yao Pan, Levente Bodrossy, Gert-Jan Reichart, Alfons J. P. Smolders, Mike S. M. Jetten, Jaap S. Sinninghe Damste & Huub J. M. Op den Camp
Nature Geoscience 3, 617 - 621 (2010) doi:10.1038/ngeo939
→全世界的に、泥炭地におけるコケから発生するメタンは、好気的メタン酸化によって消費されている。メタン酸化微生物は多様で、コケと共生関係にあって、炭素をリサイクルさせているらしい。

The biogeochemical cycle of iron in the ocean
P. W. Boyd & M. J. Ellwood
Nature Geoscience, Published online: 26 September 2010 | doi:10.1038/ngeo964
→微生物が粒子状鉄成分を溶かしたり、沈降粒子が鉄を吸着したりといった、海洋中の鉄の生物地球化学循環および、気候変動との関係をレビュー。


☆Proceedings of the National Academy of Sciences☆

Characterization of Prochlorococcus clades from iron-depleted oceanic regions
Douglas B. Rusch, Adam C. Martiny, Christopher L. Dupont, Aaron L. Halpern, and J. Craig Venter
PNAS 2010 107 (37) 16184-16189; doi:10.1073/pnas.1009513107
→世界中の海洋から分析された73のメタゲノムデータを解析して、未知のProchlorococcus2種が、鉄に欠乏している海域に卓越していることを発見。

Microbial community transcriptomes reveal microbes and metabolic pathways associated with dissolved organic matter turnover in the sea
Jay McCarren, Jamie W. Becker, Daniel J. Repeta, Yanmei Shi, Curtis R. Young, Rex R. Malmstrom, Sallie W. Chisholm, and Edward F. DeLong
PNAS 2010 107 (38) 16420-16427; published ahead of print August 31, 2010, doi:10.1073/pnas.1010732107
→メタトランスクリプトーム解析から、海洋溶存有機物の代謝における各微生物の役割を議論。


☆Geophysical Research Letters☆

Unusual time histories of galactic and anomalous cosmic rays at 1 AU over the deep solar minimum of cycle 23/24
McDonald, F. B., W. R. Webber, and D. V. Reames
Geophys. Res. Lett. (2010), 37, L18101, doi:10.1029/2010GL044218.
→サイクル23-24における銀河宇宙線の変動。


☆Geochemistry, Geophysics, Geosystems ☆

Tracking aquatic change using chlorine-specific carbon and nitrogen isotopes: The last glacial-interglacial transition at Lake Suigetsu, Japan
Tyler, J., Y. Kashiyama, N. Ohkouchi, N. Ogawa, Y. Yokoyama, Y. Chikaraishi, R. A. Staff, M. Ikehara, C. Bronk Ramsey, C. Bryant, F. Brock, K. Gotanda, T. Haraguchi, H. Yonenobu and T. Nakagawa
Geochem. Geophys. Geosyst. (2010) 11, Q09010, doi:10.1029/2010GC003186.
→うちの研究室PDだったジョンの研究。水月湖堆積物中のクロロフィル類の化合物レベル炭素・窒素同位体組成から、最終退氷期の環境復元&プロキシ評価。バルク窒素同位体組成とクロロフィル類窒素同位体組成があまり合わない。


☆Earth and Planetary Science Letters☆

Methane under-saturated fluids in deep-sea sediments: Implications for gas hydrate stability and rates of dissolution
Laura L. Lapham, Jeffrey P. Chanton, Ross Chapman and Christopher S. Martens
Earth and Planetary Science Letters, Available online 1 September 2010. doi:10.1016/j.epsl.2010.07.016
→ガスハイドレートを含む海底堆積物中の流体のメタン濃度を現場測定すると、メタン未飽和。でも飽和度から計算したハイドレート溶解速度は低め。微生物・物理プロセスがハイドレートの安定性を大きく上げている?


☆Geochimica et Cosmochimica Acta☆

The radiocarbon age of organic carbon in marine surface sediments
David R. Griffith, William R. Martin and Timothy I. Eglinton
Geochimica et Cosmochimica Acta, Available online 7 September 2010. doi:10.1016/j.gca.2010.09.001
→海洋表層堆積物における有機物埋没を理解するため、有機炭素の放射性炭素年代を解釈するべく、ボックスモデルを作成。いくつかの地点では、古い炭素の寄与が示唆される。

How contact metamorphism can trigger global climate changes: Modeling gas generation around igneous sills in sedimentary basins
Ingrid Aarnes, Henrik Svensen, James A.D. Connolly and Yuri Y. Podladchikov
Geochimica et Cosmochimica Acta, Available online 17 September 2010. doi:10.1016/j.gca.2010.09.011
→有機物に富む堆積物の接触変成作用により、メタンなど温室効果ガスが100-1000年スケールで放出され、気候に影響を与える? 堆積盆地におけるLIPsでは数千ギガトンの炭素が放出されるとか。


☆Organic Geochemistry☆

Tracing the rate and extent of N and C flow from 13C,15N-glycine and glutamate into individual de novo synthesized soil amino acids
Timothy D.J. Knowles, David R. Chadwick, Roland Bol and Richard P. Evershed
Organic Geochemistry, Available online 15 September 2010. doi:10.1016/j.orggeochem.2010.09.003
→土壌中の有機物動態を調べるため、13Cと15Nでアミノ酸SIP実験。新合成されたアミノ酸には、窒素のほうが炭素よりも2倍入っていったらしい。タイトルに一瞬ドキッとしたが、そういえば去年のIMOGのポスターで見かけたな。Bristol大学のグループ。


☆Biogeosciences☆

Tracing carbon assimilation in endosymbiotic deep-sea hydrothermal vent Mytilid fatty acids by 13C-fingerprinting
V. Riou, S. Bouillon, R. Serrao Santos, F. Dehairs, and A. Colaco
Biogeosciences, 7, 2591-2600, 2010, doi:10.5194/bg-7-2591-2010
→大西洋中央海嶺熱水噴出孔のシンカイヒバリガイで、脂質化合物レベルSIP。硫黄酸化で染まる脂質、メタン酸化で染まる脂質。

Carbon isotopic composition of branched tetraether membrane lipids in soils suggest a rapid turnover and a heterotrophic life style of their source organism(s)
Weijers, J. W. H., Wiesenberg, G. L. B., Bol, R., Hopmans, E. C., and Pancost, R. D.
Biogeosciences, 7, 2959-2973, doi:10.5194/bg-7-2959-2010, 2010.
→土壌中Branched GDGTsの炭素同位体組成を分析すると、全有機炭素と近いので、元の微生物は従属栄養な生活?


☆Limnology and Oceanography☆

Stable isotope fractionation during the methanogenic degradation of organic matter in the sediment of an acidic bog lake, Lake Grosse Fuchskuhle
Conrad, Ralf, Peter Claus, and Peter Casper
Limnol. Oceanogr., 55(5), 2010, 1932-1942 DOI: 10.4319/lo.2010.55.5.1932
→酸性湖における有機物分解での炭素同位体分別。

The association between biogenic and inorganic minerals and the amino acid composition of settling particles
Salter, I., A. E. S. Kemp, R. S. Lampitt, and M. Gledhill
Limnol. Oceanogr., 55(5), 2010, 2207-2218 DOI: 10.4319/lo.2010.55.5.2207
→カルシウム炭酸塩がオパールよりも有機物を深海に輸送する能力が高いという仮説を検証するため、深海Sediment trapのアミノ酸組成分析。鉱物相の違いではうまく説明できなそうらしい。


☆The ISME Journal☆

GeoChip 3.0 as a high-throughput tool for analyzing microbial community composition, structure and functional activity
Zhili He, Ye Deng, Joy D Van Nostrand, Qichao Tu, Meiying Xu, Christopher L Hemme, Xingyuan Li, Liyou Wu, Terry J Gentry, Yifeng Yin, Jost Liebich, Terry C Hazen and Jizhong Zhou
The ISME Journal 4, 1167-1179 (September 2010) | doi:10.1038/ismej.2010.46
→様々な微生物代謝を司る機能遺伝子を、数万個まとめて迅速に環境中で検出・定量するための「GeoChip 3.0」の開発。すごいなこれ。


☆Environmental Microbiology☆

GeneFISH - an in situ technique for linking gene presence and cell identity in environmental microorganisms
Cristina Moraru, Phyllis Lam, Bernhard M. Fuchs, Marcel M. M. Kuypers, Rudolf Amann
Environmental Microbiology, 2010, DOI: 10.1111/j.1462-2920.2010.02281.x
→特定の機能遺伝子のrRNAを微生物細胞中で染めて、微生物の種類と機能をつなげる手法(GeneFISH)の開発。これは強力だな。。。応用例として、海水中のamoA。サンプル中のCrenarchaeotaの30%はamoAを発現させてアンモニア酸化しているらしい。


☆Applied and Environmental Microbiology☆

Stimulation of methane generation from a non-productive coal by addition of nutrients or a microbial consortium
Elizabeth J.P. Jones, Mary A. Voytek, Margo D. Corum, and William H. Orem
Appl. Environ. Microbiol. doi:10.1128/AEM.00728-10, published online on 3 September 2010
→石炭から微生物メタン生成させるため、栄養and/or微生物を添加する実験。下北掘削の参考になりそう。

Cultivation of autotrophic ammonia-oxidizing archaea from marine sediments in co-culture with sulfur-oxidizing bacteria
Byoung-Joon Park, Soo-Je Park, Dae-No Yoon, Stefan Schouten, Jaap S. Sinninghe Damsté, and Sung-Keun Rhee
Appl. Environ. Microbiol. doi:10.1128/AEM.01478-10, published online on 24 September 2010
→海底堆積物から、アンモニア酸化アーキアを硫酸還元バクテリアと一緒に共培養することに成功。


☆Analytical Chemistry☆

Isotopic Effect on Ion Mobility and Separation of Isotopomers by High-Field Ion Mobility Spectrometry
Alexandre A. Shvartsburg, David E. Clemmer, and Richard D. Smith
Anal. Chem., DOI: 10.1021/ac101992d, Publication Date (Web): September 3, 2010
→Isotpomer(同位体異性体分子)を、FAIMS(field asymmetric waveform ion mobility spectrometry)で分離する手法の開発。強力な電場におけるイオン-分子相互作用の違いを利用しているらしい?

Quantitative Analysis of Blood Plasma Metabolites Using Isotope Enhanced NMR Methods
G. A. Nagana Gowda, Fariba Tayyari, Tao Ye, Yuliana Suryani, Siwei Wei, Narasimhamurthy Shanaiah, and Daniel Raftery
Anal. Chem., Article ASAP, DOI: 10.1021/ac101938w, Publication Date (Web): September 29, 2010
→同位体ラベルされた試薬を、定量したい代謝物と反応させて、二次元NMRで定量する手法の開発。


☆Rapid Communications in Mass Spectrometry☆

Intramolecular stable carbon isotopic analysis of archaeal glycosyl tetraether lipids
Yu-Shih Lin, Julius S. Lipp, Marcos Y. Yoshinaga, Shao-Hsuan Lin, Marcus Elvert, Kai-Uwe Hinrichs
Rapid Communications in Mass Spectrometry, Volume 24, Issue 19, pages 2817?2826, October 2010, DOI: 10.1002/rcm.4707.
→アーキア糖脂質の分子内炭素同位体組成(糖と脂質それぞれ)を測定する手法の開発。糖と脂質の炭素同位体組成の差を見ると、ANME-1(-15‰)と底性従属栄養アーキア(<7‰)で違いがあった。現場代謝の解析に有効かも? Bremen大学のYu-ShihのD論。

Essential methodological improvements in the oxygen isotope ratio analysis of N-containing organic compounds
Hans-Peter Sieper, Hans-Joachim Kupka, Lutz Lange, Andreas Rosmann, Nicole Tanz, Hanns-Ludwig Schmidt
Rapid Communications in Mass Spectrometry, Volume 24, Issue 19, pages 2849?2858, October 2010, DOI: 10.1002/rcm.4714
→窒素を含む有機分子の酸素同位体組成を、1170℃とそこそこの温度で普通のEA-IRMSで測定できるように、手法を改良。glassy carbonの代わりにblack carbonを使って、ガスクロの代わりに一酸化炭素吸着を使っている。±1‰の確度、±0.2‰の精度で測定できるらしい。