2009年12月1日火曜日

集めた論文の覚書 [水素酸化微生物] Literature Review [Hydrogen-oxidizing microbes]

H君に送ってもらった、温泉微生物論文(Kimura et al. 2009, EM)に関連して探してきた論文。

The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus
Gerard Deckert, Patrick V. Warren, Terry Gaasterland, William G. Young, Anna L. Lenox, David E. Graham, Ross Overbeek, Marjory A. Snead, Martin Keller, Monette Aujay, Robert Huber, Robert A. Feldman, Jay M. Short, Gary J. Olsen and Ronald V. Swanson
Nature 392, 353-358 (26 March 1998) doi:10.1038/32831
→超好熱性・好気水素酸化バクテリアAquifex aeolicusの完全ゲノム解読。

Use of Fe(III) as an Electron Acceptor To Recover Previously Uncultured Hyperthermophiles: Isolation and Characterization of Geothermobacterium ferrireducens gen. nov., sp. nov.
Kazem Kashefi, Dawn E. Holmes, Anna-Louise Reysenbach and Derek R. Lovley
Applied and Environmental Microbiology, April 2002, p. 1735-1742, Vol. 68, No. 4, DOI: 10.1128/AEM.68.4.1735-1742.2002
→超好熱性・水素酸化-鉄還元バクテリアGeothermobacterium ferrireducensの単離と性質同定。

Hydrogen isotope fractionation during H2/CO2 acetogenesis: hydrogen utilization efficiency and the origin of lipid-bound hydrogen
D. L. Valentine, A. L. Sessions, S. C. Tyler and A. Chidthaisong
Geobiology, Volume 2 Issue 3, Pages 179 - 188, Published Online: 29 Sep 2004, DOI:10.1111/j.1472-4677.2004.00030.x
→水素/二酸化炭素から嫌気的酢酸生成を行うバクテリアSporomusa sp.の水素代謝を調べるため、水素ガス、水、脂肪酸の水素同位体比を分析。脂肪酸と水の水素同位体比は非常によく相関。脂肪酸の水素は水から来ている? 水と同位体平衡になった水素からも来ている? また、脂肪酸の水素同位体比は他の生物に比べて格別低い。

Hydrogen isotopic fractionation in lipid biosynthesis by H2-consuming Desulfobacterium autotrophicumBrian J. Campbell, Chao Li, Alex L. Sessions and David L. Valentine
Geochimica et Cosmochimica Acta, Volume 73, Issue 10, 15 May 2009, Pages 2744-2757, doi:10.1016/j.gca.2009.02.034
→硫酸還元-水素酸化バクテリアDesulfobacterium autotrophicumの脂質生合成における水素同位体分別を調べた。Sporomusa sp.ほどではないが、光合成生物などと比べると、やはり大きな同位体分別。水素ガスは脂肪酸の水素としては入ってきていないらしい。

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