2010年1月7日木曜日

新しい論文(091221-091227)

☆Nature☆

Glaciers as a source of ancient and labile organic matter to the marine environment
Eran Hood, Jason Fellman, Robert G. M. Spencer, Peter J. Hernes, Rick Edwards, David D’Amore & Durelle Scott
Nature 462, 1044-1047 (24 December 2009) doi:10.1038/nature08580
→アラスカ湾では、氷河から古くて易分解性の溶存有機物(DOM)が供給されている。最も氷河被覆度が高い流域は、最も古く(14C年代が約4,000年)、最も易分解性な(66%が生物によって利用可能な)DOMの供給源。通常の河川では、古いDOMは難分解性なので、逆。
【最新論文(Nature, Science)】

The velocity of climate change
Scott R. Loarie, Philip B. Duffy, Healy Hamilton, Gregory P. Asner, Christopher B. Field & David D. Ackerly
Nature 462, 1052-1055 (24 December 2009) doi:10.1038/nature08649
→21世紀の気温上昇の空間的勾配(℃ km −1)および気温上昇速度の予測値(℃ yr −1)から導かれる、「気温変化速度」(km yr −1)という新たな指標の提唱。
【最新論文(Nature, Science)】

A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea
Dongying Wu, Philip Hugenholtz, Konstantinos Mavromatis, Rüdiger Pukall, Eileen Dalin, Natalia N. Ivanova, Victor Kunin, Lynne Goodwin, Martin Wu, Brian J. Tindall, Sean D. Hooper, Amrita Pati, Athanasios Lykidis, Stefan Spring, Iain J. Anderson, Patrik D’haeseleer, Adam Zemla, Mitchell Singer, Alla Lapidus, Matt Nolan, Alex Copeland, Cliff Han, Feng Chen, Jan-Fang Cheng, Susan Lucas, Cheryl Kerfeld, Elke Lang, Sabine Gronow, Patrick Chain, David Bruce, Edward M. Rubin, Nikos C. Kyrpides, Hans-Peter Klenk & Jonathan A. Eisen
Nature 462, 1056-1060 (24 December 2009) doi:10.1038/nature08656

→系統学的なカバー率が最大となるように選択した培養可能な細菌および古細菌56種のゲノム塩基配列を解読し、それらを分析。今後、系統学主導で「細菌および古細菌のゲノム百科」をまとめる体系的な「系統ゲノム」研究が必要らしい。
【最新論文(Nature, Science)】


☆Limnology and Oceanography☆

A comprehensive study of sterols in marine diatoms (Bacillariophyta): Implications for their use as tracers for diatom productivity
Sebastiaan W. Rampen, Ben A. Abbas, Stefan Schouten, and Jaap S. Sinninghe Damste
Limnol. Oceanogr., 55(1), 2010, 91–105
→100種類以上の珪藻でステロールの種類と量を調べて、バイオマーカーとして使えるかどうかを調べた。分布にパターンはあるようだが、結局のところ、「珪藻のバイオマーカー」として使えるステロールは無いらしい。
【最新論文(地球科学系)】

Molecular evidence for anaerobic ammonium–oxidizing (anammox) bacteria in continental shelf and slope sediments off northwest Africa
Andrea Jaeschke, Ben Abbas, Matthias Zabel, Ellen C. Hopmans, Stefan Schouten, and Jaap S. Sinninghe Damste
Limnol. Oceanogr., 55(1), 2010, 365–376
→北西アフリカの大陸棚・斜面堆積物で、嫌気的アンモニア酸化(アナモックス)の活性を、16S rRNAとラデラン脂質(IPLとコア脂質)で調べた。
【最新論文(地球科学系)】


☆Ecology☆

Stable isotope fingerprinting: a novel method for identifying plant, fungal, or bacterial origins of amino acids
Thomas Larsen, D. Lee Taylor, Mary Beth Leigh, and Diane M. O'Brien
Ecology: Vol. 90, No. 12, pp. 3526-3535. doi: 10.1890/08-1695.1
→植物、真菌、バクテリアのアミノ酸炭素同位体組成を分析して、パターンの違いを解析。イソロイシンとリシンの差、イソロイシンとロイシンの差を2次元プロットすると、3者がきれいに分かれるらしい。リシンは生合成系が違って情報に富む? TFA誘導体化だから、値の正確性が微妙だが。。。
【アミノ酸2】

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